昆蟲病原真菌是指某些類群即能夠在寄主正常的生理?xiàng)l件下直接侵入其體內(nèi)、增長繁殖并很快引起死亡。該菌的生活方式多樣,以腐生、寄生、根際定植為主。目前,在這類真菌中以研究白僵菌和綠僵菌較為常見。綠僵菌具有容易培養(yǎng)及廣泛的昆蟲宿主特性,現(xiàn)已普遍應(yīng)用于蝗蟲、柑桔吉丁蟲等生物防治中�？勺兗艚幼鳛檎{(diào)節(jié)基因表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)組多樣性的重要機(jī)制,能夠使某些單個(gè)基因產(chǎn)生多個(gè)mRNA變體,是導(dǎo)致真核生物基因和蛋白質(zhì)較大差異的重要原因。盡管可變剪接在高等生物中研究較為廣泛,但在昆蟲病原真菌中的研究較為缺乏。作為重要蟲生真菌中的一員,羅伯茨綠僵菌轉(zhuǎn)錄組方面的可變剪接研究甚少。為了進(jìn)一步了解可變剪接對(duì)不同生活環(huán)境下羅伯茨綠僵菌的影響,我們從多種培養(yǎng)條件入手,以獲得較為全面的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),最終從轉(zhuǎn)錄組水平挖掘可變剪接的具體數(shù)據(jù)。本項(xiàng)目以羅伯茨綠僵菌為研究對(duì)象,在各種不同環(huán)境下培養(yǎng),包括生長發(fā)育、退化、逆境脅迫、侵染定殖,提取不同階段所要孢子或者菌絲的RNA,以等濃度同體積混合成樣,然后進(jìn)行RNA-seq測(cè)序,得出其可變剪接數(shù)據(jù)。其次,通過統(tǒng)計(jì)學(xué)及生物信息學(xué)等多重方法分析可變剪接基因的表達(dá)差異。最后,通過RT-PCR... 

【文章來源】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖0-1應(yīng)用EST數(shù)據(jù)分析可變剪接事件[33]

圖0-2可變剪接的類型[37]

圖 1-1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的實(shí)驗(yàn)步驟Figure 1-1 Transcriptome resequencing experimental process I 降解樣品總 RNA 中的所有 DNA 雜質(zhì)后，真核生物 mRNA。打斷 mRNA 鏈之后，以此為模板合成一鏈 cDNA 并進(jìn)行 的文庫用 Agilent 2100 Bioanalyzer 和 ABI StepOnePlus Real

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3571407