蘋果樹腐爛病菌VmSom1、VM1G 0 6657、VM1G 0 7354和VM1G 1 1970基因的功能分析
發(fā)布時間:2021-12-31 22:44
蘋果樹腐爛。╒alsa canker of apple)是由蘋果黑腐皮殼菌(Valsa mali)引起的重要枝干病害,危害嚴重,已經(jīng)成為蘋果產(chǎn)業(yè)發(fā)展的嚴重障礙,明確病菌生長發(fā)育及其致病機制對于有效防控病害十分重要和必要。Som1是作用于調(diào)控病原真菌生長發(fā)育、形態(tài)分化和致病力的環(huán)化腺苷酸信號途徑(c AMP/PKA)的一個重要轉(zhuǎn)錄因子,前期通過對Vm Som1缺失突變體(ΔVm Som1)和野生型菌株轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)了3個顯著差異表達基因VM1G06657、VM1G07354、VM1G11970,但對其功能知之甚少。本研究以Vm Som1和上述三個差異表達基因為出發(fā)點,通過生物信息學分析獲得了這四個基因的詳細信息、結(jié)構(gòu)域和系統(tǒng)進化關(guān)系。通過對四個基因進行敲除、回復和檢測,獲得了正確敲除和回復突變體。本研究重在對四個腐爛病菌基因敲除突變株、回復菌株與野生菌株在生長發(fā)育、脅迫耐受、致病力方面進行了研究,并探究了Vm Som1的缺失對其他三個基因表達的影響。研究結(jié)果如下:1.生物信息學分析表明Vm Som1(KUI74346....
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
敲除突變體PCR驗證示意圖
因的確定和分析獲得及詳細信息因通過 Blast 比對,如圖 2 所示。VmSom1 基因大小為 2723,位于 12 號染色體 69225 bp-71947 bp,編碼 824 個氨基酸,子。VM1G_11970 基因大小為 502 bp,登錄號為 KUI74531.1 bp-56647 bp,編碼 128 個氨基酸,包含 1 個內(nèi)含子 2 個外顯子 1050 bp,登錄號為 KUI71651.1,位于 7 號染色體 209859 bp基酸,無內(nèi)含子。VM1G_07354 基因大小為 2120 bp,登錄號為染色體 2748276 bp-2750395 bp,編碼 531 個氨基酸,包含 3 個
圖 3 蘋果樹腐爛病菌 VmSom1 蛋白的 NJ 系統(tǒng)進化分析Fig. 3 NJ Phylogenetic analysis of VmSom1 protein from V.mali通過與其他真菌的同源性分析顯示,VM1G_06657 與 Valsa mali var. pyri 中的Myb-like DNA-binding protein myb-1(KUI58850.1)的同源性為 98.28%,與 Valsa malicola中的 hypothetical protein VMCG_02812(ROW09038.1)的同源性為 86.82%,與 V. sordida中的 hypothetical protein VSDG_09916(ROV87513.1)的同源性為 91.52%,與C.leucostoma 中的 hypothetical protein VPNG_02297(ROW15519.1)的同源性為 74.52%,與 D. ampelina 中的 putative trichome differentiation protein gl1(KKY29649.1)的同源性為 45.62%,與 Diaporthe helianthi 中的 regulator of conidiation(POS72487.1)的同源性為 44.23%,與 Coniella lustricola 中的 hypothetical protein BD289DRAFT_442914(PSR79103.1 )的同源性為 36.80%,與 Monosporascus sp. mg162 中的 hypotheticalprotein DL768_005565(RYP48566.1)的同源性為 38.28%,與 Monosporascus sp. MG133中的 hypothetical protein DL767_010459(RYP13989.1)的同源性為 36.68%,與
【參考文獻】:
期刊論文
[1]蘋果樹腐爛病菌根皮苷水解酶基因Vmlph1的功能[J]. 朱百濤,尹志遠,吳玉星,高小寧,馮浩,韓青梅,黃麗麗. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2018(04)
[2]蘋果腐爛病菌VmHMG基因敲除突變體獲得及表型分析[J]. 賈曉曼,王怡霖,孫庚午,何邦令,葛順峰,王玉濤,劉會香. 核農(nóng)學報. 2018(03)
[3]蘋果樹腐爛病研究分析[J]. 周巖. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè). 2017(06)
[4]蘋果樹腐爛病菌細胞色素P450基因Vmcyp5的功能[J]. 高明煜,吳玉星,朱百濤,高小寧,馮浩,黃麗麗. 微生物學報. 2018(02)
[5]蘋果樹腐爛病菌果膠裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 許春景,孫迎超,吳玉星,馮浩,高小寧,黃麗麗. 果樹學報. 2017(01)
[6]提升產(chǎn)業(yè)價值鏈 打造中國“蘋果夢”[J]. 王旭芳. 中國農(nóng)村科技. 2016(08)
[7]蘋果樹腐爛病菌胞外果膠酶分離純化及其性質(zhì)[J]. 馮浩,何媛媛,甄偉,高小寧,王惠,黃麗麗. 微生物學通報. 2017(03)
[8]中國蘋果病害發(fā)生與分布現(xiàn)狀調(diào)查[J]. 胡清玉,胡同樂,王亞南,王樹桐,曹克強. 植物保護. 2016(01)
[9]蘋果樹腐爛病菌非核糖體多肽合成酶基因VmNRPS12的功能[J]. 馬晨琛,李正鵬,戴青青,韓青梅,黃麗麗. 微生物學報. 2016(08)
[10]近50年我國蘋果樹腐爛病發(fā)生情況分析[J]. 趙緒生,齊永志,王亞南,甄文超,曹克強. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2014(11)
博士論文
[1]稻瘟病菌麥角甾醇生物合成途徑和cAMP-PKA信號途徑致病相關(guān)新基因功能研究[D]. 閆霞.浙江大學 2012
[2]稻瘟病菌G蛋白及MAPK信號途徑相關(guān)基因的功能分析[D]. 張海峰.南京農(nóng)業(yè)大學 2011
碩士論文
[1]蘋果樹腐爛病菌4個多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北農(nóng)林科技大學 2014
[2]蘋果樹腐爛病菌2個己糖激酶基因功能的初步研究[D]. 戴青青.西北農(nóng)林科技大學 2014
[3]蘋果樹腐爛病菌內(nèi)切多聚半乳糖醛酸酶基因的功能研究[D]. 許利軍.西北農(nóng)林科技大學 2014
[4]青霉素對蘋果樹及腐爛病中根皮苷影響的研究[D]. 王娟.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2009
本文編號:3561120
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
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因的確定和分析獲得及詳細信息因通過 Blast 比對,如圖 2 所示。VmSom1 基因大小為 2723,位于 12 號染色體 69225 bp-71947 bp,編碼 824 個氨基酸,子。VM1G_11970 基因大小為 502 bp,登錄號為 KUI74531.1 bp-56647 bp,編碼 128 個氨基酸,包含 1 個內(nèi)含子 2 個外顯子 1050 bp,登錄號為 KUI71651.1,位于 7 號染色體 209859 bp基酸,無內(nèi)含子。VM1G_07354 基因大小為 2120 bp,登錄號為染色體 2748276 bp-2750395 bp,編碼 531 個氨基酸,包含 3 個
圖 3 蘋果樹腐爛病菌 VmSom1 蛋白的 NJ 系統(tǒng)進化分析Fig. 3 NJ Phylogenetic analysis of VmSom1 protein from V.mali通過與其他真菌的同源性分析顯示,VM1G_06657 與 Valsa mali var. pyri 中的Myb-like DNA-binding protein myb-1(KUI58850.1)的同源性為 98.28%,與 Valsa malicola中的 hypothetical protein VMCG_02812(ROW09038.1)的同源性為 86.82%,與 V. sordida中的 hypothetical protein VSDG_09916(ROV87513.1)的同源性為 91.52%,與C.leucostoma 中的 hypothetical protein VPNG_02297(ROW15519.1)的同源性為 74.52%,與 D. ampelina 中的 putative trichome differentiation protein gl1(KKY29649.1)的同源性為 45.62%,與 Diaporthe helianthi 中的 regulator of conidiation(POS72487.1)的同源性為 44.23%,與 Coniella lustricola 中的 hypothetical protein BD289DRAFT_442914(PSR79103.1 )的同源性為 36.80%,與 Monosporascus sp. mg162 中的 hypotheticalprotein DL768_005565(RYP48566.1)的同源性為 38.28%,與 Monosporascus sp. MG133中的 hypothetical protein DL767_010459(RYP13989.1)的同源性為 36.68%,與
【參考文獻】:
期刊論文
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[4]蘋果樹腐爛病菌細胞色素P450基因Vmcyp5的功能[J]. 高明煜,吳玉星,朱百濤,高小寧,馮浩,黃麗麗. 微生物學報. 2018(02)
[5]蘋果樹腐爛病菌果膠裂解酶基因Vmpl4的致病功能研究[J]. 許春景,孫迎超,吳玉星,馮浩,高小寧,黃麗麗. 果樹學報. 2017(01)
[6]提升產(chǎn)業(yè)價值鏈 打造中國“蘋果夢”[J]. 王旭芳. 中國農(nóng)村科技. 2016(08)
[7]蘋果樹腐爛病菌胞外果膠酶分離純化及其性質(zhì)[J]. 馮浩,何媛媛,甄偉,高小寧,王惠,黃麗麗. 微生物學通報. 2017(03)
[8]中國蘋果病害發(fā)生與分布現(xiàn)狀調(diào)查[J]. 胡清玉,胡同樂,王亞南,王樹桐,曹克強. 植物保護. 2016(01)
[9]蘋果樹腐爛病菌非核糖體多肽合成酶基因VmNRPS12的功能[J]. 馬晨琛,李正鵬,戴青青,韓青梅,黃麗麗. 微生物學報. 2016(08)
[10]近50年我國蘋果樹腐爛病發(fā)生情況分析[J]. 趙緒生,齊永志,王亞南,甄文超,曹克強. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2014(11)
博士論文
[1]稻瘟病菌麥角甾醇生物合成途徑和cAMP-PKA信號途徑致病相關(guān)新基因功能研究[D]. 閆霞.浙江大學 2012
[2]稻瘟病菌G蛋白及MAPK信號途徑相關(guān)基因的功能分析[D]. 張海峰.南京農(nóng)業(yè)大學 2011
碩士論文
[1]蘋果樹腐爛病菌4個多聚半乳糖醛酸酶基因功能的初步研究[D]. 宋娜.西北農(nóng)林科技大學 2014
[2]蘋果樹腐爛病菌2個己糖激酶基因功能的初步研究[D]. 戴青青.西北農(nóng)林科技大學 2014
[3]蘋果樹腐爛病菌內(nèi)切多聚半乳糖醛酸酶基因的功能研究[D]. 許利軍.西北農(nóng)林科技大學 2014
[4]青霉素對蘋果樹及腐爛病中根皮苷影響的研究[D]. 王娟.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2009
本文編號:3561120
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