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蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌VmSom1、VM1G 0 6657、VM1G 0 7354和VM1G 1 1970基因的功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-12-31 22:44
  蘋(píng)果樹(shù)腐爛。╒alsa canker of apple)是由蘋(píng)果黑腐皮殼菌(Valsa mali)引起的重要枝干病害,危害嚴(yán)重,已經(jīng)成為蘋(píng)果產(chǎn)業(yè)發(fā)展的嚴(yán)重障礙,明確病菌生長(zhǎng)發(fā)育及其致病機(jī)制對(duì)于有效防控病害十分重要和必要。Som1是作用于調(diào)控病原真菌生長(zhǎng)發(fā)育、形態(tài)分化和致病力的環(huán)化腺苷酸信號(hào)途徑(c AMP/PKA)的一個(gè)重要轉(zhuǎn)錄因子,前期通過(guò)對(duì)Vm Som1缺失突變體(ΔVm Som1)和野生型菌株轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)了3個(gè)顯著差異表達(dá)基因VM1G06657、VM1G07354、VM1G11970,但對(duì)其功能知之甚少。本研究以Vm Som1和上述三個(gè)差異表達(dá)基因?yàn)槌霭l(fā)點(diǎn),通過(guò)生物信息學(xué)分析獲得了這四個(gè)基因的詳細(xì)信息、結(jié)構(gòu)域和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。通過(guò)對(duì)四個(gè)基因進(jìn)行敲除、回復(fù)和檢測(cè),獲得了正確敲除和回復(fù)突變體。本研究重在對(duì)四個(gè)腐爛病菌基因敲除突變株、回復(fù)菌株與野生菌株在生長(zhǎng)發(fā)育、脅迫耐受、致病力方面進(jìn)行了研究,并探究了Vm Som1的缺失對(duì)其他三個(gè)基因表達(dá)的影響。研究結(jié)果如下:1.生物信息學(xué)分析表明Vm Som1(KUI74346.... 

【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌VmSom1、VM1G 0 6657、VM1G 0 7354和VM1G 1 1970基因的功能分析


敲除突變體PCR驗(yàn)證示意圖

蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌,染色體,基因,登錄號(hào)


因的確定和分析獲得及詳細(xì)信息因通過(guò) Blast 比對(duì),如圖 2 所示。VmSom1 基因大小為 2723,位于 12 號(hào)染色體 69225 bp-71947 bp,編碼 824 個(gè)氨基酸,子。VM1G_11970 基因大小為 502 bp,登錄號(hào)為 KUI74531.1 bp-56647 bp,編碼 128 個(gè)氨基酸,包含 1 個(gè)內(nèi)含子 2 個(gè)外顯子 1050 bp,登錄號(hào)為 KUI71651.1,位于 7 號(hào)染色體 209859 bp基酸,無(wú)內(nèi)含子。VM1G_07354 基因大小為 2120 bp,登錄號(hào)為染色體 2748276 bp-2750395 bp,編碼 531 個(gè)氨基酸,包含 3 個(gè)

蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌,系統(tǒng)進(jìn)化分析,同源性


圖 3 蘋(píng)果樹(shù)腐爛病菌 VmSom1 蛋白的 NJ 系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig. 3 NJ Phylogenetic analysis of VmSom1 protein from V.mali通過(guò)與其他真菌的同源性分析顯示,VM1G_06657 與 Valsa mali var. pyri 中的Myb-like DNA-binding protein myb-1(KUI58850.1)的同源性為 98.28%,與 Valsa malicola中的 hypothetical protein VMCG_02812(ROW09038.1)的同源性為 86.82%,與 V. sordida中的 hypothetical protein VSDG_09916(ROV87513.1)的同源性為 91.52%,與C.leucostoma 中的 hypothetical protein VPNG_02297(ROW15519.1)的同源性為 74.52%,與 D. ampelina 中的 putative trichome differentiation protein gl1(KKY29649.1)的同源性為 45.62%,與 Diaporthe helianthi 中的 regulator of conidiation(POS72487.1)的同源性為 44.23%,與 Coniella lustricola 中的 hypothetical protein BD289DRAFT_442914(PSR79103.1 )的同源性為 36.80%,與 Monosporascus sp. mg162 中的 hypotheticalprotein DL768_005565(RYP48566.1)的同源性為 38.28%,與 Monosporascus sp. MG133中的 hypothetical protein DL767_010459(RYP13989.1)的同源性為 36.68%,與

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3561120

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