小麥全蝕病菌重組酶聚合酶檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-12-30 15:50
由禾頂囊殼小麥變種Gaeumannomyces graminis var.tritici引起的小麥全蝕病是危害極大的小麥土傳真菌病害。本研究以小麥全蝕病菌β-tubulin為靶標(biāo)基因設(shè)計(jì)重組酶聚合酶擴(kuò)增技術(shù)(recombinase polymerase amplification,RPA)引物Gg-RPA-F/Gg-RPA-R和RPA探針Gg-LF-Probe,結(jié)合側(cè)流層析試紙條,建立了小麥全蝕病菌RPA快速檢測(cè)方法,該方法在38℃恒溫條件下30 min內(nèi)完成可視化檢測(cè),擺脫P(yáng)CR儀等儀器設(shè)備的限制。小麥全蝕病菌RPA快速檢測(cè)方法具有較高的檢測(cè)特異性,其檢測(cè)極限為10 pg/μL,與普通PCR一致。此外,小麥全蝕病菌RPA快速檢測(cè)方法可從土壤中快速檢測(cè)到小麥全蝕病菌,具有較強(qiáng)的實(shí)用性。因此,本研究建立的小麥全蝕病菌RPA快速檢測(cè)方法具備簡(jiǎn)便高效、實(shí)用性強(qiáng)的特點(diǎn),為小麥全蝕病菌的快速檢測(cè)和病害早期診斷提供新技術(shù)。
【文章來源】:植物保護(hù). 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
小麥全蝕病菌RPA檢測(cè)方法的建立
將小麥全蝕病菌基因組DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,并以稀釋液為模板分別進(jìn)行RPA反應(yīng)和普通PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,1#~5#側(cè)流層析試紙條檢測(cè)呈陽性,而6#側(cè)流層析試紙條檢測(cè)呈陰性,表明RPA對(duì)小麥全蝕病菌基因組DNA的檢測(cè)極限為10 pg/μL(圖3a);普通PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),泳道1~泳道5均呈現(xiàn)248 bp的清晰條帶,而泳道6無擴(kuò)增產(chǎn)物,表明普通PCR對(duì)小麥全蝕病菌基因組DNA的檢測(cè)極限亦為10 pg/μL(圖3b)。2.4 小麥全蝕病菌RPA檢測(cè)在土壤樣品檢測(cè)中的應(yīng)用
對(duì)安徽地區(qū)9份疑似小麥全蝕病發(fā)病田塊的土壤基因組DNA進(jìn)行RPA反應(yīng)和PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,RPA從8份土壤中成功檢測(cè)到小麥全蝕病菌,1份土壤不攜帶小麥全蝕病菌,陰性對(duì)照亦未檢測(cè)到小麥全蝕病菌(圖4a)。普通PCR檢測(cè)結(jié)果與RPA檢測(cè)結(jié)果一致(圖4b),表明RPA技術(shù)可快速準(zhǔn)確地從發(fā)病土壤中檢測(cè)到小麥全蝕病菌(表2)。圖4 土壤樣品中小麥全蝕病菌的RPA檢測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)小蒼蘭花葉病毒[J]. 樊榮輝,黃敏玲,鐘淮欽,葉秀仙,羅遠(yuǎn)華. 植物保護(hù). 2019(02)
[2]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)大麗輪枝菌[J]. 田擎,張海峰,曾丹丹,姚艷,任林榮,王源超,鄭小波. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]Recombinase polymerase amplification as a promising tool in hepatitis C virus diagnosis[J]. Hosam Zaghloul,Mahmoud El-shahat. World Journal of Hepatology. 2014(12)
[4]柑橘潰瘍病菌的普通LAMP及快速LAMP檢測(cè)方法的建立[J]. 張侖,殷幼平,吳瑜佳,王中康. 植物保護(hù). 2013(03)
[5]不同殺菌劑拌種防治小麥全蝕病研究[J]. 孫海燕,李琦,杜文珍,郭英鵬,張愛香,陳懷谷. 植物保護(hù). 2012(03)
[6]用重組酶介導(dǎo)擴(kuò)增技術(shù)快速擴(kuò)增核酸[J]. 呂蓓,程海榮,嚴(yán)慶豐,黃震巨,沈桂芳,張志芳,李軼女,鄧子新,林敏,程奇. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2010(10)
[7]大豆疫霉菌生物學(xué)性狀的遺傳與變異[J]. 侯巨梅,劉銅,左豫虎. 大豆科學(xué). 2007(06)
[8]湖北省潛江市發(fā)生的小麥全蝕病病原鑒定[J]. 王明祖,韓群營(yíng),付艷平,肖炎農(nóng). 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2000(02)
[9]我國(guó)小麥全蝕病的初步研究[J]. 賈廷祥,吳桂本,葉學(xué)昶,臧逢春,卓耀南,宮本義. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 1982(04)
本文編號(hào):3558516
【文章來源】:植物保護(hù). 2020,46(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
小麥全蝕病菌RPA檢測(cè)方法的建立
將小麥全蝕病菌基因組DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,并以稀釋液為模板分別進(jìn)行RPA反應(yīng)和普通PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,1#~5#側(cè)流層析試紙條檢測(cè)呈陽性,而6#側(cè)流層析試紙條檢測(cè)呈陰性,表明RPA對(duì)小麥全蝕病菌基因組DNA的檢測(cè)極限為10 pg/μL(圖3a);普通PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),泳道1~泳道5均呈現(xiàn)248 bp的清晰條帶,而泳道6無擴(kuò)增產(chǎn)物,表明普通PCR對(duì)小麥全蝕病菌基因組DNA的檢測(cè)極限亦為10 pg/μL(圖3b)。2.4 小麥全蝕病菌RPA檢測(cè)在土壤樣品檢測(cè)中的應(yīng)用
對(duì)安徽地區(qū)9份疑似小麥全蝕病發(fā)病田塊的土壤基因組DNA進(jìn)行RPA反應(yīng)和PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,RPA從8份土壤中成功檢測(cè)到小麥全蝕病菌,1份土壤不攜帶小麥全蝕病菌,陰性對(duì)照亦未檢測(cè)到小麥全蝕病菌(圖4a)。普通PCR檢測(cè)結(jié)果與RPA檢測(cè)結(jié)果一致(圖4b),表明RPA技術(shù)可快速準(zhǔn)確地從發(fā)病土壤中檢測(cè)到小麥全蝕病菌(表2)。圖4 土壤樣品中小麥全蝕病菌的RPA檢測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)小蒼蘭花葉病毒[J]. 樊榮輝,黃敏玲,鐘淮欽,葉秀仙,羅遠(yuǎn)華. 植物保護(hù). 2019(02)
[2]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)大麗輪枝菌[J]. 田擎,張海峰,曾丹丹,姚艷,任林榮,王源超,鄭小波. 植物病理學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]Recombinase polymerase amplification as a promising tool in hepatitis C virus diagnosis[J]. Hosam Zaghloul,Mahmoud El-shahat. World Journal of Hepatology. 2014(12)
[4]柑橘潰瘍病菌的普通LAMP及快速LAMP檢測(cè)方法的建立[J]. 張侖,殷幼平,吳瑜佳,王中康. 植物保護(hù). 2013(03)
[5]不同殺菌劑拌種防治小麥全蝕病研究[J]. 孫海燕,李琦,杜文珍,郭英鵬,張愛香,陳懷谷. 植物保護(hù). 2012(03)
[6]用重組酶介導(dǎo)擴(kuò)增技術(shù)快速擴(kuò)增核酸[J]. 呂蓓,程海榮,嚴(yán)慶豐,黃震巨,沈桂芳,張志芳,李軼女,鄧子新,林敏,程奇. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2010(10)
[7]大豆疫霉菌生物學(xué)性狀的遺傳與變異[J]. 侯巨梅,劉銅,左豫虎. 大豆科學(xué). 2007(06)
[8]湖北省潛江市發(fā)生的小麥全蝕病病原鑒定[J]. 王明祖,韓群營(yíng),付艷平,肖炎農(nóng). 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2000(02)
[9]我國(guó)小麥全蝕病的初步研究[J]. 賈廷祥,吳桂本,葉學(xué)昶,臧逢春,卓耀南,宮本義. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 1982(04)
本文編號(hào):3558516
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