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利用四個(gè)馴化基因研究雜草稻起源

發(fā)布時(shí)間:2021-12-28 17:12
  栽培稻(Oryza sativa L.)是世界上最早的馴化作物,也是目前世界上超過三分之一人口的主要糧食作物。大約8000年前由野生稻馴化而來,在其馴化過程中,伴隨著諸如谷粒顏色、稃尖顏色、落粒性、休眠性和花周期等許多表型性狀的改變。這些表型性狀的改變是由控制該性狀馴化基因的變異所引起。雜草稻與栽培稻在植物分類學(xué)上屬于同一個(gè)屬,同時(shí)具有栽培稻和野生稻的特性,它寄生在世界各地的稻田中,難以去除和控制,給世界水稻生產(chǎn)帶來了巨大損失,所以雜草稻的起源逐漸成為人們研究的熱點(diǎn)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,控制這些表型形狀的基因相繼被克隆,為雜草稻起源研究提供了一個(gè)新的視角。Rc基因控制水稻谷粒顏色,該基因exon7上存在一個(gè)導(dǎo)致基因功能缺失的14 bp移碼刪除,花青素合成終止,水稻變?yōu)榘咨攘。該功能缺失的rc基因出現(xiàn)在93%具有白色谷粒顏色的栽培稻中。DTH7基因是控制花期變異路徑中的一個(gè)關(guān)鍵調(diào)控基因,在該基因上存在一個(gè)導(dǎo)致其功能缺失的8 bp移碼刪除,花期變?yōu)樵缁ㄆ。OsC1基因是控制水稻稃尖顏色的一個(gè)關(guān)鍵調(diào)控因子,該基因第三個(gè)外顯子上存在導(dǎo)致該基因功能缺失的兩個(gè)移碼刪除(8 bp/2 bp)... 

【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:132 頁

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

利用四個(gè)馴化基因研究雜草稻起源


圖2-1/?c基因的ML樹

單倍型分析,雜草稻,谷殼,雜交品種


?:'??知H.:.、.?、??_??圖2-1/?c基因的ML樹。BHA:黑色谷殼有芒的美國雜草稻;BR:棕色谷殼的美國雜草稻;MIX:栽培稻和??雜草稻的雜交品種;SH:淡黃色無芒的美國雜草稻??Figure.?2-1?Maximum?likelihood?(ML)?tree?of?Rc?haplotypes.?BHA,?black?hjiLl?awned;?BR,?brown?hfiLl;?MIX,??crop-weed?hybrid;?SH,?straw?hpLl?awnless??Group?1?/?\?,????'-mM??困?0.?raflpoffon?\?、■?¥?/??□?Red?pericarp?cultivated?ric??\???/??sr;—,?'(%/????5?J>^Outgroup??圖2-2價(jià)基因的TCS單倍型分析。BHA:黑色谷殼有芒的美國雜草稻;BR:椋色谷殼的美國雜草稻;MIX:??栽培稻和雜草稻的雜交品種;SH:淡黃色無芒的美國雜草稻??Figure?2-2?The?TCS?haplotype?analysis?(Phylogenetic?network?estimation?using?statistical?parsimony)?of?Rc?gene.??BHA,?black?hull?awned;?BR,?brown?hull;?MIX,?cr

序列,雜草稻,馬來西亞,栽培稻


我們發(fā)現(xiàn),雖然白色的馬來西亞雜草稻與白色栽培稻—樣也攜帶非功能的^??等位基因,但是白色馬來西亞的雜草稻在5’flanking區(qū)域的遺傳多樣性卻顯著的高??于栽培稻的遺傳多樣性(圖2-6)。這種遺傳多樣性的偏離主要是由于雜草稻??MUSC098導(dǎo)致的。MUSC098在rc基因的上游區(qū)域含有15個(gè)與其它白色馬來西亞??雜草稻完全不同的SNPs,但是與紅色馬來西亞雜草稻一致的SNPs?(圖2-7)。也就??是說MUSC098在基因的編碼區(qū)域攜帶非功能的w等位基因,但是在它的??5,flanking區(qū)域卻攜帶與紅色雜草稻的一致的序列。這意味著MUSC098是一個(gè)重組??單倍體(recombinant?haplotype)。??2.5??"illll???■?white?pericarp?Malaysian?weedy?rice?■?while?pericarp?cuHivated?rice??圖2-6白色馬來西亞雜草稻和白色栽培稻在基因組區(qū)域的核苷酸遺傳多樣性的比較。圖中的遺傳多樣性值,??僅表示攜帶rc等位基因的品種。在5’flanking區(qū)域(0_?2?kb),在凡:基因的編碼區(qū)(2-8.5?kb),3’下游區(qū)域(8.5-9.7??kb)每個(gè)?windows?為?500?bp

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物花青素合成途徑中的調(diào)控基因研究進(jìn)展[J]. 宮硤,薛靜,張曉東.  生物技術(shù)進(jìn)展. 2011(06)
[2]藍(lán)莓的成分與保健功能的研究進(jìn)展[J]. 趙秀玲.  中國野生植物資源. 2011(06)
[3]目標(biāo)序列捕獲技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 黃建鋒,肖華勝.  生物產(chǎn)業(yè)技術(shù). 2011(04)
[4]水稻色素原基因C的精細(xì)定位[J]. 范方軍,樊葉楊,杜景紅,莊杰云.  中國水稻科學(xué). 2007(05)

碩士論文
[1]水稻色素原C基因的圖位克隆與表達(dá)分析[D]. 趙沙沙.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014



本文編號(hào):3554422

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