隨著各物種基因組的不斷測(cè)定,近些年來越來越多的報(bào)道揭示不同寄生生物與其真核生物寄主之間存在基因水平轉(zhuǎn)移（Horizontal transfer of genetic materials,HT）現(xiàn)象,跨物種的HT對(duì)寄生生物及其寄主進(jìn)化有重要作用。轉(zhuǎn)座元件（Transposable element,TE）是一種能夠在宿主基因組中移動(dòng)的DNA片段,目前一般認(rèn)為大部分的HT事件在TE水平上發(fā)生。稻飛虱（灰飛虱Laodelphax striatellus,褐飛虱Nilaparvata lugens,和白背飛虱Sogatella furcifera）是亞洲水稻上的重要害蟲,其危害方式主要為直接取食為害和傳播重要的水稻病毒,對(duì)水稻的安全生產(chǎn)造成嚴(yán)重威脅。本研究利用已報(bào)道的三種稻飛虱基因組及目前已知的所有病毒序列,在稻飛虱基因組中鑒定了一段與虹彩病毒屬（Iridovirus）病毒高度同源且高拷貝的DNA序列。這些病毒序列位于虹彩病毒6（Invertebrate Iridescent virus 6,IIV-6）的開放閱讀框353L和354L的位置（157,843-158,142）,以正義或反義方向插入... 

【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

稻飛虱中類似IIV-6序列的鑒定

圖 2.2 RPSLS 序列在稻飛虱轉(zhuǎn)錄組以及基因組中的位置。黑線表示的是稻飛虱的 contig/scaffold,帶有箭頭的綠線表示稻飛虱的轉(zhuǎn)錄本及其方向，綠色方框代表昆蟲轉(zhuǎn)錄本中的 ORF，ORF 的注釋如圖中所示，紅色或者藍(lán)色方框代表正向或者反向插入的 RPSLS，紅色箭頭對(duì)表示用于 RPSLS 檢測(cè)的引物位置。Figure.2.2 Distribution of RPSLS (353L, 354L) within planthopper genomes. Black lines indicatecontigs/scaffolds of the planthopper. Green lines with arrows indicate transcripts of planthoppers and theirdirection. Green boxes represent the predicted ORF within insect transcripts. The annotation of thepredicted ORF is indicated above. Red and blue boxes represent the transcripts of RPSLS with R and Lstrands, respectively. Red arrow pairs indicate primer sets used for RT-PCR detection of RPSLS.

圖 2.3 RPSLS 序列在褐飛虱中的表達(dá)分析。(A)使用 qRT-PCR 檢測(cè)褐飛虱轉(zhuǎn)錄本中的 RPSLS。(B)RPSLS 在褐飛虱不同發(fā)育階段的表達(dá)。使用褐飛虱的 18S 基因作為內(nèi)參。誤差線采用的是三次重復(fù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差。Figure.2.3 Expression of planthopper RPSLS. (A) qRT-PCR detection of planthopper transcriptscontaining RPSLS. (B) Expression of RPSLS at different developmental stages of N. lugens. The 18S geneof N. lugens was used as an internal control for normalization. Error bars represent the standard deviationusing three replicates.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]白背飛虱稻田防治指標(biāo)調(diào)查研究[J]. 李杰.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2018(09)
[2]動(dòng)物病毒學(xué)家——殷震[J]. 青寧生.  微生物學(xué)報(bào). 2018(05)
[3]動(dòng)物類群中水平基因轉(zhuǎn)移的研究進(jìn)展[J]. 段昕妤,肖蘅,陳善元.  生命科學(xué)研究. 2017(04)
[4]關(guān)于“分子遺傳學(xué)”若干問題的討論[J]. 蔡紹京,宋遠(yuǎn)見.  生物學(xué)通報(bào). 2016(09)
[5]白菜和甘藍(lán)基因組轉(zhuǎn)座子表達(dá)及其對(duì)基因調(diào)控的潛在影響[J]. 趙美霞,張彪,劉勝毅,馬漸新.  遺傳. 2013(08)
[6]海南島庫(kù)蚊和伊蚊基因組彈狀病毒核蛋白內(nèi)生病毒片段的鑒定和特征描述[J]. 蔡群芳,李淑琴,黃用豪.  海南醫(yī)學(xué). 2012(09)
[7]家蠶核型多角體病毒水平轉(zhuǎn)移基因分析[J]. 段海蓉,丘德彬,貢成良,黃茉莉.  遺傳. 2011(06)
[8]基因水平轉(zhuǎn)移的評(píng)判方法和轉(zhuǎn)移方式研究進(jìn)展[J]. 李志江,李海權(quán),刁現(xiàn)民.  遺傳. 2008(09)
[9]海藻發(fā)酵飼料可提高魚貝抵抗力[J].   寧波農(nóng)業(yè)科技. 2008(02)
[10]海藻發(fā)酵飼料可提高魚貝抵抗力[J].   寧波農(nóng)業(yè)科技. 2008 (02)

碩士論文
[1]未知逆轉(zhuǎn)錄病毒在蝙蝠與鯨基因組中的發(fā)現(xiàn)[D]. 王麗娜.華東師范大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3550685