TMV侵染誘導(dǎo)煙草產(chǎn)生SAR中差異性LncRNA鑒定及功能分析
發(fā)布時間:2021-11-27 05:20
非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)是不編碼蛋白質(zhì)的RNA,在植物生長發(fā)育及脅迫耐受性中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。系統(tǒng)獲得性抗性(systemic acquired resistance,SAR)是植物在病原物侵染后建立的一種廣譜防御機制,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)多種基因及激素在其中發(fā)揮作用,但關(guān)于ncRNA對SAR的調(diào)控鮮見報道。煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)對主要經(jīng)濟作物生產(chǎn)造成極大危害且難以防治,N基因的溫度敏感性使枯斑三生煙(Nicotiana tabacum var.Samsun NN)在環(huán)境溫度低于28℃時具備對TMV的抗性、高于28℃時喪失對TMV的抗性,這為深入研究TMV與寄主互作及寄主SAR發(fā)展的分子機制提供了良好的試驗材料。本研究利用生物信息學(xué)、分子生物學(xué)手段,系統(tǒng)研究了ncRNA在N-TMV互作引起寄主SAR中的調(diào)控作用,并針對lncRNA(long-noncoding RNA)進行了部分驗證,主要研究結(jié)果如下:(1)通過觀察不同溫度條件下TMV侵染枯斑三生煙的病毒生物學(xué)表型,確定枯斑三生煙在25℃、31℃分別具備、喪失對TMV的抗...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA的調(diào)控方式(ZHANGetal.,2019)
19中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章TMV侵染枯斑三生煙的病毒生物學(xué)特性及系統(tǒng)獲得性抗性研究圖2-9TMV接種枯斑三生煙后系統(tǒng)葉PR1a、PR5表達情況Fig.2-9ExpressionofPR1aandPR5inuninfectedleavesofSamsunNNafterTMVinoculation.注:a:枯斑三生煙系統(tǒng)葉PR1a相對表達量變化,b:枯斑三生煙系統(tǒng)葉PR5相對表達量變化,誤差線表示三組生物學(xué)重復(fù)的正負標(biāo)準(zhǔn)差,采用t-檢驗分析差異顯著性:*,P<0.05;**,P<0.01。Note:a:relativeexpressionchangeofPR1ainuninfectedleavesofSamsunNN.b:relativeexpressionchangeofPR5inuninfectedleavesofSamsunNN.Errorbarsindicatethe±SDofthreebiologicalreplicates.Student’st-test,*,P<0.05,**,P<0.01.2.3討論枯斑三生煙對TMV的免疫具有溫度敏感性與可逆性,當(dāng)溫度低于28℃時枯斑三生煙存在抗TMV特性、建立SAR,但當(dāng)溫度高于28℃時抗性喪失。25℃環(huán)境中,病毒在侵染點與寄主發(fā)生互作反應(yīng),引起活性氧中間產(chǎn)物等離子變化、細胞壁強化、蛋白質(zhì)磷酸化、SA積累和多種防御基因表達,導(dǎo)致侵染點細胞壞死、HR形成,病毒的胞間運動被破壞(LIUetal.,2004)。HOLMES(1929)發(fā)現(xiàn)對N.glutinosa接種相同量的TMV時,幼葉相比老葉形成的枯斑更多,表明較弱煙株防御反應(yīng)發(fā)生時間相對較慢。本研究發(fā)現(xiàn)煙苗越成熟,對病毒入侵響應(yīng)越迅速,形成的壞死斑越小,暗示煙株對TMV抗性伴隨植株生長發(fā)育而增強。LI等(2018)提出煙草對TMV抗性在幼苗期是不完全的,而在植株成熟時達到完全抗性,且N基因的轉(zhuǎn)錄水平在此過程中不斷增加。CULVER等(1991)對出現(xiàn)在侵染區(qū)域外的壞死現(xiàn)象進行了研究,提出N-TMV互作是寄主限制病毒(發(fā)生HR)速度與病毒復(fù)制移動速度之間的競爭,在這一點上不同植物、不同組織都存在差異。幼嫩組織對病毒的響應(yīng)較
LncRNA-seq結(jié)果分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物載脂蛋白家族結(jié)構(gòu)與功能研究進展[J]. 吉凌霄,朱伯華,李佳佳,岳安琪,謝國生. 植物生理學(xué)報. 2017(11)
[2]煙草N基因及其介導(dǎo)的抗TMV信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子機制[J]. 王倩,劉貫山. 中國煙草科學(xué). 2016(03)
[3]煙草N基因及其在烤煙遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 張玉,羅成剛,殷英,胡小波,戴培剛,張波. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(19)
[4]煙草花葉病毒病發(fā)生及防治研究進展[J]. 周建國,肖啟明,劉雙清,周志成,唐前君. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(01)
[5]植物源抗煙草花葉病毒天然產(chǎn)物研究進展[J]. 耿召良,商勝華,陳興江,曹毅. 中國煙草科學(xué). 2011(01)
[6]心葉煙和三生煙對TMV的過敏性差異[J]. 劉開全,馬學(xué)萍,陸偉東,秦留云. 中國煙草科學(xué). 2010(04)
碩士論文
[1]煙草感染花葉病過程中差異表達基因與蛋白質(zhì)的篩選及應(yīng)用[D]. 肖萬福.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]棉花重要抗黃萎病相關(guān)基因的表達特性分析及GhPR10功能初步研究[D]. 陳捷胤.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號:3521631
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA的調(diào)控方式(ZHANGetal.,2019)
19中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章TMV侵染枯斑三生煙的病毒生物學(xué)特性及系統(tǒng)獲得性抗性研究圖2-9TMV接種枯斑三生煙后系統(tǒng)葉PR1a、PR5表達情況Fig.2-9ExpressionofPR1aandPR5inuninfectedleavesofSamsunNNafterTMVinoculation.注:a:枯斑三生煙系統(tǒng)葉PR1a相對表達量變化,b:枯斑三生煙系統(tǒng)葉PR5相對表達量變化,誤差線表示三組生物學(xué)重復(fù)的正負標(biāo)準(zhǔn)差,采用t-檢驗分析差異顯著性:*,P<0.05;**,P<0.01。Note:a:relativeexpressionchangeofPR1ainuninfectedleavesofSamsunNN.b:relativeexpressionchangeofPR5inuninfectedleavesofSamsunNN.Errorbarsindicatethe±SDofthreebiologicalreplicates.Student’st-test,*,P<0.05,**,P<0.01.2.3討論枯斑三生煙對TMV的免疫具有溫度敏感性與可逆性,當(dāng)溫度低于28℃時枯斑三生煙存在抗TMV特性、建立SAR,但當(dāng)溫度高于28℃時抗性喪失。25℃環(huán)境中,病毒在侵染點與寄主發(fā)生互作反應(yīng),引起活性氧中間產(chǎn)物等離子變化、細胞壁強化、蛋白質(zhì)磷酸化、SA積累和多種防御基因表達,導(dǎo)致侵染點細胞壞死、HR形成,病毒的胞間運動被破壞(LIUetal.,2004)。HOLMES(1929)發(fā)現(xiàn)對N.glutinosa接種相同量的TMV時,幼葉相比老葉形成的枯斑更多,表明較弱煙株防御反應(yīng)發(fā)生時間相對較慢。本研究發(fā)現(xiàn)煙苗越成熟,對病毒入侵響應(yīng)越迅速,形成的壞死斑越小,暗示煙株對TMV抗性伴隨植株生長發(fā)育而增強。LI等(2018)提出煙草對TMV抗性在幼苗期是不完全的,而在植株成熟時達到完全抗性,且N基因的轉(zhuǎn)錄水平在此過程中不斷增加。CULVER等(1991)對出現(xiàn)在侵染區(qū)域外的壞死現(xiàn)象進行了研究,提出N-TMV互作是寄主限制病毒(發(fā)生HR)速度與病毒復(fù)制移動速度之間的競爭,在這一點上不同植物、不同組織都存在差異。幼嫩組織對病毒的響應(yīng)較
LncRNA-seq結(jié)果分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物載脂蛋白家族結(jié)構(gòu)與功能研究進展[J]. 吉凌霄,朱伯華,李佳佳,岳安琪,謝國生. 植物生理學(xué)報. 2017(11)
[2]煙草N基因及其介導(dǎo)的抗TMV信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子機制[J]. 王倩,劉貫山. 中國煙草科學(xué). 2016(03)
[3]煙草N基因及其在烤煙遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 張玉,羅成剛,殷英,胡小波,戴培剛,張波. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(19)
[4]煙草花葉病毒病發(fā)生及防治研究進展[J]. 周建國,肖啟明,劉雙清,周志成,唐前君. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(01)
[5]植物源抗煙草花葉病毒天然產(chǎn)物研究進展[J]. 耿召良,商勝華,陳興江,曹毅. 中國煙草科學(xué). 2011(01)
[6]心葉煙和三生煙對TMV的過敏性差異[J]. 劉開全,馬學(xué)萍,陸偉東,秦留云. 中國煙草科學(xué). 2010(04)
碩士論文
[1]煙草感染花葉病過程中差異表達基因與蛋白質(zhì)的篩選及應(yīng)用[D]. 肖萬福.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]棉花重要抗黃萎病相關(guān)基因的表達特性分析及GhPR10功能初步研究[D]. 陳捷胤.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號:3521631
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