小麥全基因組抗赤霉病QTL關(guān)聯(lián)位點(diǎn)特異性SSR標(biāo)記的篩
發(fā)布時(shí)間:2021-11-25 06:17
赤霉病是小麥主要的流行病害之一。借助標(biāo)記輔助選擇將不同數(shù)量性狀基因座(quantitative trait loci,QTL)聚合是防治赤霉病有效且環(huán)保的方法,可以從源頭上控制赤霉病并降低籽粒中毒素含量?钩嗝共TL在小麥全基因組均有分布,但除了Fhb1、Fhb2等少數(shù)位點(diǎn)有比較可靠的鑒別標(biāo)記,絕大部分位點(diǎn)缺乏有效的位點(diǎn)特異性鑒別標(biāo)記。簡(jiǎn)單重復(fù)序列(simple sequence repeat,SSR)標(biāo)記多態(tài)性豐富,可以區(qū)分自然群體中不同等位變異,方便用于標(biāo)記輔助育種;诖,搜集了不同文獻(xiàn)中報(bào)道的與赤霉病關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記386個(gè),并用這些標(biāo)記構(gòu)建全基因組赤霉病抗性QTL一致性圖譜,接著對(duì)這些關(guān)聯(lián)標(biāo)記進(jìn)行拷貝數(shù)分析,進(jìn)而選擇位點(diǎn)內(nèi)的單拷貝SSR標(biāo)記,將這些單拷貝標(biāo)記在156個(gè)品種組成的自然群體中進(jìn)行擴(kuò)增,并與三季大田和三季溫室環(huán)境下赤霉病抗性進(jìn)行關(guān)聯(lián),篩選與赤霉病抗性關(guān)聯(lián)的單拷貝SSR標(biāo)記,明確這些標(biāo)記在自然群體中的有效等位變異和效應(yīng)。結(jié)果表明,共8個(gè)單拷貝SSR標(biāo)記至少在兩季試驗(yàn)中與表型顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05),涉及2B、2D、3B、5A、5B、6A、6D、7A染色體,有5...
【文章來(lái)源】:生物技術(shù)進(jìn)展. 2020,10(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
小麥全基因組赤霉病抗性QTL區(qū)間、關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記及其拷貝數(shù)
圖1 小麥全基因組赤霉病抗性QTL區(qū)間、關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記及其拷貝數(shù)在三季大田試驗(yàn)中(如圖3所示),中國(guó)地方品種在高感、中感、中抗、高抗中分布的頻率分別是0.125、0.3、0.25、0.325;中國(guó)推廣品種分布的頻率為0.2、0.36、0.32、0.12;日本品種分布的頻率為0.04、0.21、0.25、0.5;美國(guó)品種分布的頻率為0.24、0.4、0.24、0.12。根據(jù)大田試驗(yàn)各國(guó)家地區(qū)品種的表型分析,本研究得到與溫室試驗(yàn)相同的結(jié)論,即在中國(guó)品種中,地方品種的赤霉病抗性優(yōu)于推廣品種,而大部分日本品種都能達(dá)到中抗或者高抗水平,美國(guó)品種抗性較為一般。
根據(jù)關(guān)聯(lián)分析結(jié)果(表1)可知,共有8個(gè)單拷貝標(biāo)記在超過(guò)兩季試驗(yàn)中出現(xiàn)且與表型顯著關(guān)聯(lián)。其中,單拷貝標(biāo)記gwm157、wmc363、gwm334、gwm533在大田和溫室環(huán)境下都與表型顯著關(guān)聯(lián),說(shuō)明這類標(biāo)記位點(diǎn)上的效應(yīng)受環(huán)境影響較小。而標(biāo)記barc117只在溫室環(huán)境下與表型關(guān)聯(lián)顯著,標(biāo)記barc196、wmc477、wmc479只在大田環(huán)境下與表型關(guān)聯(lián)顯著,說(shuō)明此類標(biāo)記位點(diǎn)上的效應(yīng)可能受到環(huán)境因素的制約。圖3 三季大田試驗(yàn)赤霉病病小穗率分布圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Breeding wheat for resistance to Fusarium head blight in the Global North: China, USA, and Canada[J]. Zhanwang Zhu,Yuanfeng Hao,Mohamed Mergoum,Guihua Bai,Gavin Humphreys,Sylvie Cloutier,Xianchun Xia,Zhonghu He. The Crop Journal. 2019(06)
[2]小麥TaLEA3基因家族的全基因組鑒定及其響應(yīng)赤霉病的表達(dá)模式分析[J]. 鄭彤,袁敏敏,花辰,周瑤,李磊,孫政璽,李韜. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2019(04)
[3]CAPS/dCAPS Designer: a web-based high-throughput dCAPS marker design tool[J]. Lei Li,Jiajun Liu,Xiang Xue,Changcheng Li,Zefeng Yang,Tao Li. Science China(Life Sciences). 2018(08)
[4]High-throughput development of genome-wide locus-specific informative SSR markers in wheat[J]. Lei Li,Fayu Sun,Di Wu,Fei Zhen,Guihua Bai,Derong Gao,Tao Li. Science China(Life Sciences). 2017(06)
[5]小麥赤霉病:從表型鑒定到抗性改良[J]. 李韜,李嬡嬡,李磊. 科技導(dǎo)報(bào). 2016(22)
[6]小麥赤霉病的微生物防治研究進(jìn)展[J]. 管章玲,辛海峰,李建宏,馬鴻翔,張旭. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(02)
本文編號(hào):3517573
【文章來(lái)源】:生物技術(shù)進(jìn)展. 2020,10(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
小麥全基因組赤霉病抗性QTL區(qū)間、關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記及其拷貝數(shù)
圖1 小麥全基因組赤霉病抗性QTL區(qū)間、關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記及其拷貝數(shù)在三季大田試驗(yàn)中(如圖3所示),中國(guó)地方品種在高感、中感、中抗、高抗中分布的頻率分別是0.125、0.3、0.25、0.325;中國(guó)推廣品種分布的頻率為0.2、0.36、0.32、0.12;日本品種分布的頻率為0.04、0.21、0.25、0.5;美國(guó)品種分布的頻率為0.24、0.4、0.24、0.12。根據(jù)大田試驗(yàn)各國(guó)家地區(qū)品種的表型分析,本研究得到與溫室試驗(yàn)相同的結(jié)論,即在中國(guó)品種中,地方品種的赤霉病抗性優(yōu)于推廣品種,而大部分日本品種都能達(dá)到中抗或者高抗水平,美國(guó)品種抗性較為一般。
根據(jù)關(guān)聯(lián)分析結(jié)果(表1)可知,共有8個(gè)單拷貝標(biāo)記在超過(guò)兩季試驗(yàn)中出現(xiàn)且與表型顯著關(guān)聯(lián)。其中,單拷貝標(biāo)記gwm157、wmc363、gwm334、gwm533在大田和溫室環(huán)境下都與表型顯著關(guān)聯(lián),說(shuō)明這類標(biāo)記位點(diǎn)上的效應(yīng)受環(huán)境影響較小。而標(biāo)記barc117只在溫室環(huán)境下與表型關(guān)聯(lián)顯著,標(biāo)記barc196、wmc477、wmc479只在大田環(huán)境下與表型關(guān)聯(lián)顯著,說(shuō)明此類標(biāo)記位點(diǎn)上的效應(yīng)可能受到環(huán)境因素的制約。圖3 三季大田試驗(yàn)赤霉病病小穗率分布圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Breeding wheat for resistance to Fusarium head blight in the Global North: China, USA, and Canada[J]. Zhanwang Zhu,Yuanfeng Hao,Mohamed Mergoum,Guihua Bai,Gavin Humphreys,Sylvie Cloutier,Xianchun Xia,Zhonghu He. The Crop Journal. 2019(06)
[2]小麥TaLEA3基因家族的全基因組鑒定及其響應(yīng)赤霉病的表達(dá)模式分析[J]. 鄭彤,袁敏敏,花辰,周瑤,李磊,孫政璽,李韜. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2019(04)
[3]CAPS/dCAPS Designer: a web-based high-throughput dCAPS marker design tool[J]. Lei Li,Jiajun Liu,Xiang Xue,Changcheng Li,Zefeng Yang,Tao Li. Science China(Life Sciences). 2018(08)
[4]High-throughput development of genome-wide locus-specific informative SSR markers in wheat[J]. Lei Li,Fayu Sun,Di Wu,Fei Zhen,Guihua Bai,Derong Gao,Tao Li. Science China(Life Sciences). 2017(06)
[5]小麥赤霉病:從表型鑒定到抗性改良[J]. 李韜,李嬡嬡,李磊. 科技導(dǎo)報(bào). 2016(22)
[6]小麥赤霉病的微生物防治研究進(jìn)展[J]. 管章玲,辛海峰,李建宏,馬鴻翔,張旭. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(02)
本文編號(hào):3517573
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