稻曲病菌是引起真菌類病害水稻稻曲病的病原。從稻曲病菌菌株GZ-14-07中分離到一株真菌病毒,命名為Ustilaginoidea virens RNA virus 6（UvRV6）,對其進(jìn)行了序列分析。通過CF-11纖維素粉法提取菌株GZ-14-07中的真菌病毒UvRV6,采用隨機(jī)引物擴(kuò)增法獲得UvRV6的全長基因組序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等軟件對UvRV6的全長序列進(jìn)行拼接、比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析。研究發(fā)現(xiàn)UvRV6全基因組長度為5 043個堿基,GC為48.8%,UvRV6基因組序列中存在兩個開放閱讀框（ORF1和ORF2）,ORF1長2 280個堿基,編碼760個氨基酸（79.6 kD）,ORF2長2 385個堿基,編碼830個氨基酸（91.5 kD）。ORF1和ORF2編碼的蛋白,分別與全病毒科維多利亞屬真菌病毒成員的衣殼蛋白和依賴于RNA的RNA聚合酶顯著出較高的相似性。另外,UvRV6的ORF1和ORF2之間有一個AUGA序列,在AUGA序列上游存在一段能形成一個H型的假節(jié)序列,這兩個序列元件的存在使UvRV6兩個開放閱讀框（ORF1和ORF2）能通過翻... 

【文章來源】：生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

菌株GZ-14-07的1%瓊脂糖凝膠電泳檢測圖

UvRV6含有兩個開放閱讀框(ORF1和ORF2)(圖3)。ORF1起始于第222位堿基,終止于第2 505位的UGA密碼子,全長2 280個堿基,編碼760個氨基酸(79.6 kD)。ORF2起始于第2 502位的AUG密碼子,終止于第4 991位堿基,全長2 385個堿基,編碼830個氨基酸(91.5 kD)。5"和3"末端非翻譯區(qū)分別長222個堿基和52 個堿基。通過BlastP比對分析顯示ORF1與全病毒科維多利亞屬病毒的衣殼蛋白(CP)有很高的相似性,尤其是與Ustilaginoidea virens RNA virus 3(UvRv3)的衣殼蛋白(CP)的同源性達(dá)到73%;ORF2與全病毒科維多利亞屬病毒的依賴于RNA的RNA聚合酶(RdRp)有顯著的相似性,跟UvRV3的依賴于RNA的RNA聚合酶(RdRp)同源性高達(dá)75%。因此,UvRV6的ORF1編碼病毒的衣殼蛋白(CP),ORF2編碼病毒的依賴于RNA的RNA聚合酶(RdRp),UvRV6是全病毒科維多利亞屬中的一員。四核苷酸(AUGA)將ORF1和ORF2連接起來,它包含ORF1的終止密碼子(UGA)和ORF2的起始密碼子(AUG),在全病毒科維多利亞屬中這4個核苷酸(AUGA),能啟動一種叫翻譯終止后又重新啟動翻譯(Termination and reinitiation)的機(jī)制使ORF1和ORF2被融合成一個大的開放閱讀框(ORF)(圖3)。圖3 UvRV6的翻譯終止后又重新啟動翻譯機(jī)制

UvRV6的翻譯終止后又重新啟動翻譯機(jī)制

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]稻曲病菌成災(zāi)機(jī)制與防控技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 胡東維,梁五生,賴朝暉.  植物保護(hù). 2018(01)
[2]稻曲病病粒形成過程及對健粒的影響[J]. 王興國,湯洪濤,楊勤蓮.  植物保護(hù). 1989(05)



本文編號：3485079