鐮孢菌是重要的植物病原真菌之一,可引起多種植物發(fā)生病害。本研究以供試的尖鐮孢菌菌株為研究對(duì)象,利用生物信息學(xué)方法分析尖鐮孢菌全基因組SSR位點(diǎn)的分布特點(diǎn),在此基礎(chǔ)上開發(fā)SSR引物用來(lái)分析尖鐮孢種內(nèi)的SSR遺傳多樣性;以山西不同地區(qū)采集的鐮孢菌株為研究對(duì)象,采用線粒體小亞基（mtSSUrDNA）和組蛋白H3（histone H3）兩個(gè)基因序列探討不同種的鐮孢菌的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。其主要研究結(jié)果如下:1.對(duì)7條已公布的尖鐮孢菌染色體基因組序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果表明:基因組中7條染色體共有860個(gè)SSR位點(diǎn),平均每條染色體出現(xiàn)122個(gè)SSR位點(diǎn),大約每44.2kb出現(xiàn)一個(gè)長(zhǎng)度不小于18bp的SSR位點(diǎn)。其中四、五核苷酸重復(fù)為主要重復(fù)類型,占全部SSR的比例分別為23.84%和32.56%;435種重復(fù)基元的分布情況存在差異,基元為ACAA/TTGT出現(xiàn)次數(shù)最多,為33次,其次為CAAA/TTTG,出現(xiàn)32次。說(shuō)明尖鐮抱菌基因組中含有豐富的SSR位點(diǎn),為Genomic-SSR標(biāo)記在尖鐮孢菌鑒別中的應(yīng)用奠定了理論基礎(chǔ)。2.采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)尖鐮孢菌進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,60對(duì)SS... 

【文章來(lái)源】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

引物(GTAG)7和(TGATT)10對(duì)21株尖鐮袍菌基因組DN人的S5R-PCR擴(kuò)增效果

玻敝曇飭?呔?櫻櫻遙?校茫依┰黿峁?木劾嚳治觶崳?聚類分析結(jié)果表明（圖２），尖鐮孢菌菌株類群間總體遺傳相似系數(shù)在０．?５６？０．?９５。??當(dāng)遺傳相似系數(shù)為０．?５６時(shí)，２１株尖鐮孢菌可分成２個(gè)ＳＳＲ類群（ＳＳＲ?ｇｒｏｕｐｓ，ＳＧ）；當(dāng)??相似系數(shù)為０．７０時(shí)，２１株尖鐮孢菌可分成５個(gè)ＳＳＲ亞類群；當(dāng)相似系數(shù)為０．９５時(shí)，??２１株尖鐮孢菌可完全分開。表明尖鐮孢菌基因組ＤＮＡ的ＳＳＲ區(qū)域具有遺傳分化明顯的??特點(diǎn)，全基因組ＳＳＲ標(biāo)記技術(shù)是一種尖鐮孢菌遺傳分化研究的有效方法。??同一地理來(lái)源不同寄主，如分離自夏縣的黃瓜９號(hào)和西瓜１３號(hào)菌株、祁縣的茄子１??號(hào)和綠豆２號(hào)菌株、太谷的蠶豆５號(hào)和地豆６號(hào)菌株聚在不同的類群或亞類群（圖２）；??同一寄主不同地理來(lái)源的菌株聚于不同類群，如分離自太谷候縣番茄（１４號(hào)）與大同番??茄（１５號(hào)）分別聚在了?ＳＧ－１和ＳＧ－２中（圖２）。另外，雖然分離自黃瓜的９號(hào)、１０??號(hào)、１１號(hào)和１２號(hào)聚在了不同類群，但來(lái)自夏縣黃瓜９號(hào)和太原黃瓜１１號(hào)聚在一支上，??太谷黃瓜１０號(hào)和１２號(hào)聚在了一起；分離自運(yùn)城棉花１７號(hào)和１９號(hào)菌株聚在一起

圖２．２部分樣品電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ２．２?ｓａｍｐｌｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｏｇｒａｍ??－３３?－??

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3485004