菜心是我國(guó)重要的葉菜類蔬菜,其栽培面積廣,經(jīng)濟(jì)效益好,在華南地區(qū)蔬菜的周年均衡供應(yīng)與出口創(chuàng)匯方面起著重要的作用。炭疽病是菜心生產(chǎn)過(guò)程重要的病害,其致病病原菌為希金斯炭疽菌,華南地區(qū)高溫高濕的氣候環(huán)境有利于該病原菌的繁殖和傳播,嚴(yán)重時(shí)導(dǎo)致產(chǎn)量損失30%⁴0%。因此,深入研究菜心與炭疽病菌的互作過(guò)程,探討可能的抗病機(jī)制,發(fā)掘潛在的抗病基因,對(duì)菜心炭疽病的科學(xué)防治以及抗病相關(guān)分子育種有著重要的意義。本研究在對(duì)41個(gè)菜心品種進(jìn)行抗病性鑒定的基礎(chǔ)上,篩選出抗病和感病的菜心品種,并通過(guò)RNA-seq技術(shù)分析比較抗病與感病品種受希金斯炭疽菌侵染前后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。主要研究結(jié)論如下:1、對(duì)3⁴葉期的菜心葉片進(jìn)行人工噴霧接種希金斯炭疽菌,根據(jù)不同溫度采用不同的接種濃度和接種后保濕時(shí)間能夠顯著區(qū)分不同菜心的抗病性。供試的41個(gè)菜心品種接種希金斯炭疽菌后的病情指數(shù)在35.045⁶4.643之間,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)高抗病的品種,也沒(méi)有發(fā)現(xiàn)高感病品種,只有中抗病品種和感病品種,其中中抗病品種33個(gè),感病品種8個(gè)。根據(jù)對(duì)41個(gè)品種的病原菌接種以及病情指數(shù)調(diào)查和... 

【文章來(lái)源】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：98 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 菜心炭疽病及其研究進(jìn)展
    1.2 植物抗病機(jī)制
        1.2.1 植物基礎(chǔ)防御反應(yīng)
        1.2.2 植物誘導(dǎo)防御反應(yīng)
    1.3 植物抗病基因
    1.4 植物防御相關(guān)基因
    1.5 植物抗病相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子
    1.6 植物炭疽病研究進(jìn)展
    1.7 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（RNA-seq）技術(shù)在植物病原互作機(jī)制研究中的應(yīng)用
    1.8 本課題的研究?jī)?nèi)容、目的和意義
2 材料與方法
    2.1 供試品種
    2.2 病原菌培養(yǎng)
    2.3 病原菌接種
    2.4 菜心品種抗性鑒定
        2.4.1 病情分級(jí)
        2.4.2 病情指數(shù)
        2.4.3 抗性評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)
    2.5 菜心不同抗性品種應(yīng)答炭疽病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組分析
        2.5.1 總RNA的提取及質(zhì)檢
        2.5.2 文庫(kù)構(gòu)建、檢測(cè)及上機(jī)
        2.5.3 原始數(shù)據(jù)處理
        2.5.4 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
        2.5.5 參考序列的比對(duì)
        2.5.6 基因表達(dá)水平統(tǒng)計(jì)
        2.5.7 基因差異表達(dá)分析
        2.5.8 差異表達(dá)基因GO富集性分析
        2.5.9 差異表達(dá)基因KEGG pathway富集性分析
    2.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）驗(yàn)證分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 不同菜心品種的抗病性鑒定
    3.2 RNA測(cè)序質(zhì)量的評(píng)估
        3.2.1 測(cè)序reads的評(píng)估
        3.2.2 RNA-seq相關(guān)性檢驗(yàn)
        3.2.3 參考基因組比對(duì)統(tǒng)計(jì)
        3.2.4 基因表達(dá)結(jié)果統(tǒng)計(jì)
    3.3 差異表達(dá)基因的篩選
    3.4 差異表達(dá)基因的GO功能顯著性分析
    3.5 差異表達(dá)基因的KEGG pathway富集分析
    3.6 抗病相關(guān)差異表達(dá)基因表達(dá)情況分析
        3.6.1 抗病基因
        3.6.2 病程相關(guān)蛋白
        3.6.3 抗病相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子
        3.6.4 細(xì)胞壁相關(guān)蛋白
        3.6.5 植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)蛋白
        3.6.6 其他抗病相關(guān)蛋白
    3.7 實(shí)時(shí)熒光定量（qRT-PCR）驗(yàn)證
4 討論
    4.1 菜心品種資源的炭疽病抗性鑒定分析
    4.2 轉(zhuǎn)錄因子對(duì)菜心炭疽病抗性的影響
    4.3 植物激素對(duì)菜心炭疽病抗性的影響
    4.4 ROS對(duì)菜心炭疽病抗性的影響
    4.5 其它因子對(duì)菜心炭疽病抗性的影響
5 全文結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]pHBA對(duì)菜心炭疽病的誘導(dǎo)抗性及植株生理特性的影響[J]. 康云艷,周小萌,楊暹,林潔.  植物病理學(xué)報(bào). 2014(04)
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[7]硅對(duì)菜薹炭疽病防御反應(yīng)中信號(hào)物質(zhì)的影響[J]. 楊暹,楊躍生,馮紅賢.  園藝學(xué)報(bào). 2008(06)
[8]硅對(duì)菜心炭疽病發(fā)生、菜薹形成及硅吸收沉積的影響[J]. 楊暹,馮紅賢,楊躍生.  應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2008(05)
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[10]氮營(yíng)養(yǎng)對(duì)菜心炭疽病抗性生理的影響 Ⅱ.氮營(yíng)養(yǎng)對(duì)菜心炭疽病及膜脂過(guò)氧化作用的影響[J]. 陳曉燕,楊暹,張璐璐.  華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2004(03)

博士論文
[1]柑橘褐斑病菌比較基因組和轉(zhuǎn)錄組分析及柑橘綠霉病菌產(chǎn)孢中心調(diào)控途徑和高滲甘油途徑的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大學(xué) 2016
[2]哈密瓜響應(yīng)青霉菌侵染的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組研究及相關(guān)抗性酶變化分析[D]. 單春會(huì).江南大學(xué) 2015
[3]柑橘潰瘍病防御相關(guān)基因的鑒定及功能分析[D]. 嚴(yán)佳文.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]玉米抗細(xì)菌性褐斑病候選基因的克隆與鑒定及NIL的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 吳曉軍.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]JAZ2和JAZ7調(diào)控茉莉酸介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄與代謝重編程的機(jī)理研究[D]. 閆會(huì)轉(zhuǎn).浙江大學(xué) 2014
[6]基于RNA-seq技術(shù)的甘藍(lán)型油菜抗、感菌核病分子機(jī)理分析[D]. 張秋平.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]黃瓜霜霉病抗病基因鑒定及其表達(dá)分析[D]. 劉大軍.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013

碩士論文
[1]日本結(jié)縷草響應(yīng)立枯絲核菌侵染及其轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 殷萍萍.北京林業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3461720