果生炭疽菌嚴(yán)重危害多種經(jīng)濟(jì)作物。引起金冠系蘋果品種炭疽葉枯�。℅LS）,造成早期落葉和果實斑點,嚴(yán)重影響蘋果產(chǎn)量和品質(zhì)。已知炭疽菌效應(yīng)蛋白可以通過影響寄主免疫反應(yīng)促進(jìn)寄主感病,為炭疽菌重要致病因子。但目前對果生炭疽菌致病機(jī)理目前了解很少。實驗室前期從果生炭疽菌篩選鑒定出一個效應(yīng)蛋白Cf CE92,本研究擬對其致病中的功能進(jìn)行系統(tǒng)研究,取得以下主要結(jié)果:1. 用果生炭疽菌野生型和ΔCf CE92突變體分別接種嘎啦葉片,24 h后提取RNA,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序、基因預(yù)測與注釋,共獲得52.41G數(shù)據(jù),注釋45116個基因。差異分析獲得突變體和野生型2370個差異表達(dá)基因,其中顯著上調(diào)310個基因。通過Pathway富集分析可以看出,在乙醛酸和二羧酸代謝途徑、黃酮生物合成途徑、半乳糖代謝途徑、氨基糖和核苷酸糖代謝、甘油脂代謝和MAPK信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等6個通路顯著富集。2. MAPK信號通路在生物體內(nèi)能夠介導(dǎo)細(xì)胞的生長發(fā)育及分裂分化等多種生理變化,并參與病理過程。在MAPK信號通路中富集到了7個基因,包括2個脫落酸受體、PR1a、PR3、絲氨酸蘇氨酸蛋白激酶、類乙烯反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子和WRKY29。對PR1a... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

對接種C.fructicola及突變體ΔCfCE92菌株蘋果葉片轉(zhuǎn)錄組的相關(guān)性矩陣圖

西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文22通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，鑒定到310個在果生炭疽菌ΔCfCE92突變體接種葉片中顯著上調(diào)表達(dá)基因。KEGGPathway富集獲得六個顯著差異有關(guān)途徑：乙醛酸和二羧酸代謝途徑、黃酮生物合成途徑、半乳糖代謝途徑、氨基酸和核苷酸代謝途徑、甘油脂代謝途徑、MAPK信號通路途徑（圖3-2），共包含32個基因（表3-1）。圖3-2差異表達(dá)基因在接種ΔCfCE92突變體菌株的蘋果葉片中有顯著的通路富集（p<0.05）Figure3-2ThebubblediagramshowsthatthesignificantpathwayenrichmentofdifferentiallyexpressedgenesintheappleleavesinoculatedwithΔCfCE92strain(P<0.05)

西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文24WRKY29和胼胝質(zhì)合成酶。挑選出部分與植物防御相關(guān)的基因PR1a，PR3，PR5，PR10a，MAPK3，WRKY29，Callosesynthase2-like進(jìn)行qRT-PCR檢測，結(jié)果如圖3-3所示：差異表達(dá)最明顯的為PR3基因，突變體ΔCfCE92比野生型C.fructicola上調(diào)15倍；PR1a基因突變體比野生型上調(diào)6倍。其余PR5，PR10a，MAPK3，WRKY29，Callosesynthase2-like基因差異表達(dá)相似，突變體比野生型上調(diào)為：2，2.5，1.6，2.25，2倍。qRT-PCR證實突變體比野生型這些防御相關(guān)基因普遍上調(diào)表達(dá)，表明CfCE92通過抑制病程相關(guān)PR基因、MAPK3、WRKY29和胼胝質(zhì)合成酶等表達(dá)，進(jìn)而侵染植物，使得植物感玻圖3-3對接種ΔCfCE92和WT菌株24小時后的葉片提取總RNA，對7個防御相關(guān)基因進(jìn)行qRT-PCR分析,以MdUBQ為內(nèi)參基因。Figure3-3ThetotalRNAwasextractedfromtheleavesinoculatedwithΔCfCE92andWTstrainsat24hpirespectivelyandsubjectedtoqRT-PCRanalysisofsevendefense-relatedgenes.MdUBQwasusedasreferencegene.3.1.3CfCE92影響類黃酮合成途徑

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3451161