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甘藍(lán)染色體片段替換系的構(gòu)建和黑腐病抗性QTL定位及候選基因分析

發(fā)布時(shí)間:2021-09-24 01:25
  結(jié)球甘藍(lán)(Brassica oleracea var.capitata)是一種在世界范圍內(nèi)廣泛種植的葉菜類蔬菜。近年來(lái),由于復(fù)種指數(shù)的提高、不合理栽培方式與大量引種,黑腐病在我國(guó)甘藍(lán)產(chǎn)區(qū)普遍發(fā)生且逐年加重,嚴(yán)重影響了甘藍(lán)的品質(zhì)和產(chǎn)量,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。了解甘藍(lán)黑腐病遺傳機(jī)理、選育抗病品種是防治黑腐病最經(jīng)濟(jì)有效的辦法。本研究以野生抗黑腐病甘藍(lán)自交系R4-P1與感病骨干自交系R2-P2為雜交組合構(gòu)建的重組自交系繪制了甘藍(lán)遺傳圖譜;通過(guò)連續(xù)多代回交與自交策略,結(jié)合遺傳圖譜上均勻分布的分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇的方法構(gòu)建了一套以R2-P2為背景、R4-P1為供體的甘藍(lán)染色體片段替換系;利用構(gòu)建的染色體片段替換系與繪制圖譜所用的重組自交系,進(jìn)行了甘藍(lán)黑腐病抗性QTL定位,對(duì)主效定位區(qū)段內(nèi)的9個(gè)候選基因進(jìn)行測(cè)序比對(duì)與接病后不同時(shí)間段表達(dá)量與瞬時(shí)表達(dá)分析;并對(duì)甘藍(lán)全基因組NBS-LRR類型抗病基因進(jìn)行了鑒定與基因分析,為甘藍(lán)抗黑腐病品種的分子選育提供幫助。主要研究結(jié)果如下:1.選用野生甘藍(lán)高代純合自交系R4-P1和結(jié)球甘藍(lán)骨干自交系R2-P2構(gòu)建的重組自交系,構(gòu)建了一張包含303對(duì)SSR與In Del標(biāo)... 

【文章來(lái)源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁(yè)數(shù)】:125 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

甘藍(lán)染色體片段替換系的構(gòu)建和黑腐病抗性QTL定位及候選基因分析


圖2-1雙親R4-P1與R2-P2形態(tài)特征

株系,連鎖群


1 對(duì) InDel)條帶清晰單一、差異明顯標(biāo)記且重復(fù)性好的標(biāo)記,標(biāo)記 20.1%。高密度遺傳圖譜的構(gòu)建09 對(duì) RIL8 群體的多態(tài)性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)整理 (圖 2-2),整理數(shù)據(jù)導(dǎo)入 JoinMap擇軟件中的“Individual genot.freq.”命令,挑選出在這些標(biāo)記中出現(xiàn)雜合基型)較多的株系,利用“individuals”命令中的“Exclude”按鈕共刪除 2 個(gè)單株鎖分析時(shí),以 α=0.05 水平上的 LOD 值作為閾值 (LOD 閾值=5.0),在 LO,共有 303 個(gè) SSR 標(biāo)記進(jìn)入 9 個(gè)連鎖群 (LG1-LG9),各連鎖群的重組頻有連鎖群上的所有 LOD 得分均>0.6。最終得到的連鎖群數(shù)與染色體[B.ole8,CC)]數(shù)目一致,連鎖率為 98.15%,其余 6 個(gè)標(biāo)記由于結(jié)果統(tǒng)計(jì)不準(zhǔn)確重與偏分離等原因未進(jìn)入 9 條連鎖群。群的染色體定位與標(biāo)記分布

路線圖,構(gòu)建技術(shù),染色體片段,甘藍(lán)


L-Finder (0.9a14) (http://mapdisto.free.fr/CSSLFinder/) 程序譜上,從 C1-C9 依次選擇出均勻分布于甘藍(lán) 9 條染色體上的片段替換系的構(gòu)建,并根據(jù)各標(biāo)記的位置以及各標(biāo)記間的圖軟件繪制替換系構(gòu)建所用分子標(biāo)記遺傳圖譜。計(jì)與技術(shù)路線體片段替換系的構(gòu)建流程如圖 3-1 所示,具體流程如下: R4-P1 和 R2-P2 雜交產(chǎn)生 F1代,隨后以 R2-P2 為輪回親本C2F1代材料。從 BC2F1開(kāi)始進(jìn)行,于 2015 年利用從各圖譜上選擇的分系共計(jì) 126 個(gè)單株進(jìn)行全基因組分子標(biāo)記跟蹤和人工選擇F1世代中選擇最佳單株分別進(jìn)行回交與自交,最佳單株選擇 的染色體替換片段數(shù)盡可能少,受體 R2-P2 的遺傳背景回全基因組的覆蓋率要盡可能的高,對(duì)BC3F1單株沒(méi)有覆蓋到


本文編號(hào):3406818

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