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基于LAMP檢測技術的橡膠樹白粉病早期測報技術初探

發(fā)布時間:2021-08-23 20:17
  天然橡膠產(chǎn)業(yè)是重要的經(jīng)濟產(chǎn)業(yè)。海南省是我國橡膠樹重要種植區(qū)。橡膠樹白粉病是橡膠樹重要的葉部病害之一,橡膠樹白粉病主要是由專性寄生菌Oidium heveae B.A.Steinmn通過氣流傳播的。橡膠樹白粉病嚴重危害橡膠樹的嫩芽、花序和葉片,嚴重時導致葉片早脫,割膠延遲,嚴重影響橡膠樹的生長發(fā)育和產(chǎn)膠量。橡膠樹白粉病發(fā)病前期肉眼較難觀察到,等全面爆發(fā)后很難控制,所以早期預測預報技術對橡膠樹白粉病的防治具有重要意義。我們的研究團隊已經(jīng)建立了較為成熟的白粉菌檢測技術,即LAMP檢測技術。本文在LAMP快速、可視等優(yōu)勢的基礎上,初步探索了LAMP技術在橡膠樹白粉病早期預測預報中的應用潛能,為實際生產(chǎn)中有效防控橡膠樹白粉病提供科學依據(jù)。本研究借助甘油通過改變白粉菌孢子細胞壁內(nèi)外的滲透壓達到破壁效果,實現(xiàn)簡單粗略的提取橡膠樹白粉菌的DNA。通過和常規(guī)DNA提取方法經(jīng)PCR擴增結果顯示,本研究建立的簡化橡膠樹白粉菌DNA提取方法可以提取到白粉菌孢子DNA,經(jīng)驗證可通過LAMP技術檢測到。提取不同數(shù)量的橡膠樹白粉菌孢子DNA,并測量提取DNA濃度。獲得一系列成組數(shù)據(jù),通過統(tǒng)計分析,建立白粉菌孢子量與... 

【文章來源】:海南大學海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:57 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于LAMP檢測技術的橡膠樹白粉病早期測報技術初探


圖2特異性序列的開放鬩讀框預測圖??Fig2Prediction?of?specific?sequence?ORF??

序列編碼,特異性基因,預測圖,信號肽


圖3特異性基因序列編碼蛋信號肽預測圖??Fig?3Signal?peptide?prediction?which?specific?gene?sequence?edit??水性分析結果??水性分析網(wǎng)址:http://cn.expasy.org/tools/protscale.htm丨分。??

分析結果圖,蛋白質(zhì),特異性基因,序列編碼


(2)蛋白質(zhì)疏水性分析結果??經(jīng)蛋白質(zhì)疏水性分析網(wǎng)址:http://cn.expasy.org/tools/protscale.htm丨分析,可以得??到如圖4的結果。??Prot?Scale?output?for?use?resequence?? ̄'?'?Hpn〇t?'?/?Kyte'&.?Doolittle?———??1?-]?-??05?i}?"?ft?tl?I??。AA?II?Pul?1?n?f?Jl.??05?-?1^'?I/"?U?I?'?'l,?;?M],1?.??vi?1丨?i????.2.?1?1?I?1??v?f???2?5????????????????????20?40?60?80?100?120?140?160??Position??圖4特異性基因序列編碼蛋白質(zhì)的疏水性分析圖??Fig?4Protein?hydrophobicity?analysis?of?specific?gene?sequences??⑶蛋白質(zhì)跨膜區(qū)分析結果??網(wǎng)址為:http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/,對該蛋白質(zhì)進彳丁跨膜區(qū)分??析

【參考文獻】:
期刊論文
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[2]橡膠樹白粉病菌分子檢測技術的建立[J]. 毛宇寧,梁鵬,劉文波,林春花,繆衛(wèi)國,鄭服叢.  植物保護. 2016(04)
[3]堿裂解法快速提取蟲草屬真菌DNA研究[J]. 王茜,侯飛俠,王藝璇,葉茂,彭成,沈才洪,國錦琳.  時珍國醫(yī)國藥. 2016(04)
[4]葡萄A病毒RT-LAMP檢測方法的建立[J]. 張永江,辛言言,李桂芬,乾義柯.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2016(01)
[5]中國橡膠樹種植氣候適宜性區(qū)劃[J]. 劉少軍,周廣勝,房世波.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2015(12)
[6]2013年海南省新中農(nóng)場橡膠樹病害調(diào)查初報[J]. 林舒雅,許文君.  寧德師范學院學報(自然科學版). 2015(02)
[7]腸炎沙門氏菌血清型特異性基因挖掘及生物信息學分析[J]. 余水靜,彭艷平,鄧揚悟,郭燕華,梁長利,歐陽城添.  江西理工大學學報. 2014(03)
[8]環(huán)介導恒溫擴增技術在植物病原物檢測中的應用[J]. 秦文韜,王忠躍,張昊.  中國農(nóng)業(yè)科技導報. 2013(03)
[9]阪崎腸桿菌LAMP、PCR與傳統(tǒng)檢測方法的比較[J]. 徐曉可,吳清平,張淑紅,張菊梅,郭偉鵬,吳秀華.  現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2013(09)
[10]河南省幾種白粉菌的ITS序列分析[J]. 馬原松,裴冬麗,王文靜,李成偉.  河南農(nóng)業(yè)科學. 2012(09)

博士論文
[1]大腦中動脈閉塞的芯片數(shù)據(jù)挖掘及生物信息學分析[D]. 權哲.山東大學 2016

碩士論文
[1]橡膠樹白粉菌(Oidium heveae)互作組織學及其基因組初步分析[D]. 萬三連.海南大學 2013
[2]橡膠樹白粉病生防菌研究[D]. 黃有航.海南大學 2012
[3]網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚主要疾病的預報模型研究[D]. 周瑞娟.寧波大學 2011
[4]BTH誘導橡膠樹對白粉病的抗性研究[D]. 羅嬋娟.海南大學 2010
[5]漯河市小麥主要病害的預測模型研究[D]. 郭春強.河南農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號:3358528

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