甘薯內(nèi)生細(xì)菌的分離及鑒定
發(fā)布時間:2021-07-24 13:49
我國是甘薯生產(chǎn)大國,甘薯在福建省是第二大糧食作物,對保障糧食安全起著重要的作用。甘薯具有適應(yīng)性廣、抗逆性強(qiáng)的特點(diǎn),這可能與其內(nèi)生菌的作用有關(guān)。研究表明,內(nèi)生菌對許多作物具有促進(jìn)生長、提高抗逆性、固氮、對病原菌拮抗等作用。但迄今為止,國內(nèi)對于甘薯內(nèi)生菌的分離與研究還鮮有報道。本研究通過對田間采集的甘薯進(jìn)行清洗、消毒,用組織切塊法分離到了甘薯內(nèi)生菌,并對內(nèi)生菌進(jìn)行了分類與功能鑒定,從中篩選出了對甘薯蔓割病具有拮抗作用、具有溶磷能力的內(nèi)生菌,并開展了內(nèi)生菌生物特性的研究,具體結(jié)果如下:(1)分離到了17株甘薯內(nèi)生細(xì)菌,其中從甘薯的莖段中分離到了12株,從甘薯的根中分離到了5株。經(jīng)過革蘭氏染色鑒定,所分離菌株中12株為革蘭氏陽性,5株為革蘭氏陰性。(2)通過擴(kuò)增內(nèi)生菌的16S rDNA基因序列并進(jìn)行比對,初步鑒定它們分別屬于萊利奧蒂亞腸桿菌(Lelliottia nimipressuralis)、煙草腸桿菌(Enterobacter tabaci)、偽單胞菌(Pseudomonas oryzihabitans)、河生腸桿菌(Lelliottia amnigena)、阿氏芽胞桿菌(Bacillu...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1分離到的17個甘薯內(nèi)生細(xì)菌Figure3-117sweetpotatoendophyticbacteriaisolated
甘薯內(nèi)生細(xì)菌的分離及鑒定3.3 甘薯內(nèi)生菌的分子生物學(xué)鑒定3.3.1 甘薯內(nèi)生菌株的 16S rDNA 序列擴(kuò)增使用細(xì)胞基因組 DNA 提取試劑盒提取甘薯內(nèi)生菌的基因組 DNA 后,分別以 17 株內(nèi)生菌株的基因組 DNA 為模板,用 16S rDNA 引物,通過 PCR 擴(kuò)增后,通過電泳檢測到特異性條帶(圖 3-2)。
圖 3-3 SP-01 菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3-3 Phylogenetic tree of SP-01 strain驗(yàn)證次數(shù)為1000;樹枝上的數(shù)值為驗(yàn)證可信度;圖左下端標(biāo)尺表示堿基置ootstrap verification number is 1000; the value on the branch is the ve lower left scale shows the base replacement frequency. The same below-4 所示,菌株 SP-02 與煙草腸桿菌(Enterobacter tabaci)位于同相似率最高,為 99.13%,結(jié)合菌株形態(tài)及革蘭氏染色,可初草腸桿菌(Enterobacter tabaci)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥赤霉病菌拮抗菌的分離及鑒定[J]. 夏雨晨,朱永興,馬東方,劉樂承,尹軍良. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]基于宏基因組的茉莉花內(nèi)生細(xì)菌多樣性分析[J]. 陳梅春,朱育菁,劉波,王階平,劉曉港,楊文靖. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2018(06)
[3]基于高通量測序技術(shù)的懷山藥與菜山藥內(nèi)生細(xì)菌多樣性比較[J]. 劉元,文春南,劉淼,李文,洪利亞,麻兵繼. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(10)
[4]三葉鬼針草內(nèi)生細(xì)菌群體多樣性及重金屬耐受和吲哚乙酸產(chǎn)生潛力[J]. 胡澤瑞,劉媛,彭長連,李淑彬. 微生物學(xué)通報. 2019(01)
[5]竹肉球內(nèi)生菌多肽的分離及抑菌活性[J]. 韓英乾,邱水,陶虎. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[6]植物內(nèi)生菌研究進(jìn)展[J]. 方珍娟,張曉霞,馬立安. 長江大學(xué)學(xué)報(自科版). 2018(10)
[7]紅三葉根際促生菌中具生防效果菌株篩選、鑒定及特性研究[J]. 李海云,姚拓,張榕,榮良燕,馬亞春,張惠榮,羅慧琴,李政璇,高亞敏,張建貴. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2018(03)
[8]大蒜內(nèi)生菌的分離及拮抗菌株的篩選與鑒定[J]. 李樂溪,李丹,張亮,王軍娟,楊緒勤,蔣繼宏. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[9]植物根部內(nèi)生細(xì)菌多樣性及其生防作用研究進(jìn)展[J]. 曹焜,王曉楠,孫宇峰,李振偉,潘冬梅,趙越. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(17)
[10]堿蓬內(nèi)生菌的研究進(jìn)展[J]. 方靖靖,李春陽,賈成琦,祁海春,閆征. 科技經(jīng)濟(jì)導(dǎo)刊. 2017(10)
博士論文
[1]中國糧食進(jìn)出口問題研究[D]. 張樹淼.武漢大學(xué) 2015
碩士論文
[1]甘薯新品種金薯3號特性鑒定及其輕簡化栽培技術(shù)研究[D]. 陳海洲.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[2]藥用植物(黃精和黃芪)內(nèi)生菌的的分離鑒定及胞外多糖結(jié)構(gòu)和生物活性的研究[D]. 宋穎娟.山東大學(xué) 2017
[3]苜蓿內(nèi)生菌的分離及生防菌株的篩選與鑒定[D]. 陳孝利.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[4]甘薯蔓割病水培鑒定體系的建立與病菌致病相關(guān)基因的克隆[D]. 林羽立.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[5]小麥赤霉病菌拮抗內(nèi)生菌的分離篩選及抑菌活性研究[D]. 周苗苗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]拮抗青枯病菌的茄科植物內(nèi)生菌篩選鑒定與控病研究[D]. 王玲.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]小麥溶磷內(nèi)生菌的篩選鑒定及其溶磷特性的初步研究[D]. 蔣國彪.四川師范大學(xué) 2012
[8]抗FOC4香蕉內(nèi)生菌的篩選及菌株DB09208的鑒定和防治效果研究[D]. 陳博.海南大學(xué) 2010
本文編號:3300772
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1分離到的17個甘薯內(nèi)生細(xì)菌Figure3-117sweetpotatoendophyticbacteriaisolated
甘薯內(nèi)生細(xì)菌的分離及鑒定3.3 甘薯內(nèi)生菌的分子生物學(xué)鑒定3.3.1 甘薯內(nèi)生菌株的 16S rDNA 序列擴(kuò)增使用細(xì)胞基因組 DNA 提取試劑盒提取甘薯內(nèi)生菌的基因組 DNA 后,分別以 17 株內(nèi)生菌株的基因組 DNA 為模板,用 16S rDNA 引物,通過 PCR 擴(kuò)增后,通過電泳檢測到特異性條帶(圖 3-2)。
圖 3-3 SP-01 菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3-3 Phylogenetic tree of SP-01 strain驗(yàn)證次數(shù)為1000;樹枝上的數(shù)值為驗(yàn)證可信度;圖左下端標(biāo)尺表示堿基置ootstrap verification number is 1000; the value on the branch is the ve lower left scale shows the base replacement frequency. The same below-4 所示,菌株 SP-02 與煙草腸桿菌(Enterobacter tabaci)位于同相似率最高,為 99.13%,結(jié)合菌株形態(tài)及革蘭氏染色,可初草腸桿菌(Enterobacter tabaci)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小麥赤霉病菌拮抗菌的分離及鑒定[J]. 夏雨晨,朱永興,馬東方,劉樂承,尹軍良. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]基于宏基因組的茉莉花內(nèi)生細(xì)菌多樣性分析[J]. 陳梅春,朱育菁,劉波,王階平,劉曉港,楊文靖. 熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2018(06)
[3]基于高通量測序技術(shù)的懷山藥與菜山藥內(nèi)生細(xì)菌多樣性比較[J]. 劉元,文春南,劉淼,李文,洪利亞,麻兵繼. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(10)
[4]三葉鬼針草內(nèi)生細(xì)菌群體多樣性及重金屬耐受和吲哚乙酸產(chǎn)生潛力[J]. 胡澤瑞,劉媛,彭長連,李淑彬. 微生物學(xué)通報. 2019(01)
[5]竹肉球內(nèi)生菌多肽的分離及抑菌活性[J]. 韓英乾,邱水,陶虎. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[6]植物內(nèi)生菌研究進(jìn)展[J]. 方珍娟,張曉霞,馬立安. 長江大學(xué)學(xué)報(自科版). 2018(10)
[7]紅三葉根際促生菌中具生防效果菌株篩選、鑒定及特性研究[J]. 李海云,姚拓,張榕,榮良燕,馬亞春,張惠榮,羅慧琴,李政璇,高亞敏,張建貴. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2018(03)
[8]大蒜內(nèi)生菌的分離及拮抗菌株的篩選與鑒定[J]. 李樂溪,李丹,張亮,王軍娟,楊緒勤,蔣繼宏. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(05)
[9]植物根部內(nèi)生細(xì)菌多樣性及其生防作用研究進(jìn)展[J]. 曹焜,王曉楠,孫宇峰,李振偉,潘冬梅,趙越. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2017(17)
[10]堿蓬內(nèi)生菌的研究進(jìn)展[J]. 方靖靖,李春陽,賈成琦,祁海春,閆征. 科技經(jīng)濟(jì)導(dǎo)刊. 2017(10)
博士論文
[1]中國糧食進(jìn)出口問題研究[D]. 張樹淼.武漢大學(xué) 2015
碩士論文
[1]甘薯新品種金薯3號特性鑒定及其輕簡化栽培技術(shù)研究[D]. 陳海洲.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[2]藥用植物(黃精和黃芪)內(nèi)生菌的的分離鑒定及胞外多糖結(jié)構(gòu)和生物活性的研究[D]. 宋穎娟.山東大學(xué) 2017
[3]苜蓿內(nèi)生菌的分離及生防菌株的篩選與鑒定[D]. 陳孝利.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[4]甘薯蔓割病水培鑒定體系的建立與病菌致病相關(guān)基因的克隆[D]. 林羽立.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[5]小麥赤霉病菌拮抗內(nèi)生菌的分離篩選及抑菌活性研究[D]. 周苗苗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]拮抗青枯病菌的茄科植物內(nèi)生菌篩選鑒定與控病研究[D]. 王玲.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]小麥溶磷內(nèi)生菌的篩選鑒定及其溶磷特性的初步研究[D]. 蔣國彪.四川師范大學(xué) 2012
[8]抗FOC4香蕉內(nèi)生菌的篩選及菌株DB09208的鑒定和防治效果研究[D]. 陳博.海南大學(xué) 2010
本文編號:3300772
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