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家蠶二分濃核病毒NS1蛋白表達(dá)分析及其互作蛋白研究

發(fā)布時間:2021-07-24 13:40
  家蠶二分濃核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)歸屬于新設(shè)定的二分DNA病毒科二分濃核病毒屬,是目前唯一一個編碼DNA聚合酶的單鏈二分體DNA病毒。該病毒曾歸屬于細(xì)小病毒科濃核病毒亞科,與家蠶濃核病毒Ⅰ相似,病毒粒子為二十面體非囊膜包裹結(jié)構(gòu),主要感染家蠶中腸柱狀上皮細(xì)胞,并引發(fā)家蠶濃核癥。Bm BDV基因組包括兩個節(jié)段的單鏈DNA分子VD1 6.6 kb和VD26.0 kb,獨立包裝。BmBDV NS1由VD1-ORF2編碼,具有316個氨基酸殘基,其理論分子量大小為36 KDa,等電點8.70,生物信息學(xué)結(jié)果表明Bm BDV NS1蛋白與細(xì)小病毒NS1蛋白同源。先前的研究發(fā)現(xiàn)NS1蛋白是一個多功能蛋白,具有ATPase、解旋酶及綁定特定DNA序列的活性。然而,該蛋白的表達(dá)模式及其與宿主或病毒蛋白的相互作用還未闡明。在本研究中,我們首先設(shè)計了12條含12個氨基酸的短肽抗原,制備NS1的單克隆抗體,其中一個抗體具有較高的特異性和效價,能特異識別大腸桿菌中表達(dá)的NS1和病毒感染的家蠶中腸中的NS1,抗原表位為DIPPEEYRELRT。然后分析了ns1基因在病... 

【文章來源】:江蘇大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】:77 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

家蠶二分濃核病毒NS1蛋白表達(dá)分析及其互作蛋白研究


家蠶感染BmBDV后的病理現(xiàn)象[8]

基因組結(jié)構(gòu)


編碼非結(jié)構(gòu)蛋白 NS3,VD2-ORF2 包括 3483 nts,編碼次要結(jié)構(gòu)蛋白 P133(其基因組結(jié)構(gòu)圖1.2 所示)。此外,通過序列分析發(fā)現(xiàn),在這些 ORFs 的上下游區(qū)域都存在有各類保守的啟動子元件 TATA 盒子、CAGT 盒子和多聚的腺苷酸化信號序列[7, 10, 11]。BmBDV 是動物病毒中唯一的具有兩個節(jié)段的單鏈 DNA 基因組結(jié)構(gòu)且編碼DNA 聚合酶的病毒[12],并且該病毒還具有不同于其相似病毒細(xì)小病毒基因組結(jié)構(gòu),復(fù)制模式也未可知。因此,研究 BmBDV 復(fù)制相關(guān)蛋白對研究該病毒的復(fù)制機制具有重要意義。

序列,同源蛋白,在線分析


家蠶二分濃核病毒 NS1 蛋白表達(dá)分析及其互作蛋白研究SKPSSLISNISSPST)。T45 是一個堿性的絲氨酸/蘇氨酸激酶的磷酸化位點Baso-ST-kin,Basophilic serine/threonine kinase group),其保守氨基酸序列為QKSAKRLTISSLESG)。Y160 是一個絡(luò)氨酸激酶磷酸化位點(Y-kin,Tyrosineinase group),其保守氨基酸序列為(SKFCEALYSIFTMSD)及 Y116 是一個SH2,Src homology 2 group)結(jié)構(gòu)的酪氨酸位點,其保守氨基酸序列為INYQEYYYEEV NNRL)。SH2(Src 同源域 2)結(jié)構(gòu)域是 Src 癌蛋白和許多他細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白質(zhì)中結(jié)構(gòu)保守的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域[14, 15],SH2 結(jié)構(gòu)域和含有些結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)上的磷酸化酪氨酸殘基相互作用,有助于受體氨酸激酶途徑的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(如圖 1.5)?傊,NS1 結(jié)構(gòu)的多樣性,保證了 NS1白功能的多樣性(如圖 1.6)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達(dá)及定位[J]. 張清,張曉龍,李國輝,姚勤,胡朝陽.  生物技術(shù). 2015(03)
[2]家蠶二分濃核病毒綜述[J]. 胡朝陽,李國輝,李光田,姚勤,陳克平.  科學(xué)通報. 2013(19)
[3]細(xì)小病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NS1功能的研究進展[J]. 張俊紅,李國輝,陳慧卿,黃國平,姚勤.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(22)
[4]我國桑蠶業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[J]. 張晴,周振亞,羅其友.  農(nóng)業(yè)經(jīng)濟問題. 2008(01)
[5]家蠶病毒的特性和對蠶的侵染[J]. 楊大楨.  四川蠶業(yè). 1987(03)
[6]家蠶作為模式生物在現(xiàn)代生物學(xué)中的應(yīng)用[J]. 朱曉蘇,宋艷,徐世清.  實驗動物與比較醫(yī)學(xué). 2009 (01)

碩士論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達(dá)及細(xì)胞毒性研究[D]. 徐五.江蘇大學(xué) 2016
[2]家蠶絲氨酸蛋白酶BmSP142在抗病毒侵染中的作用[D]. 周倩.江蘇大學(xué) 2016
[3]家蠶二分濃核病毒感染的家蠶連續(xù)病理變化研究[D]. 張曉龍.江蘇大學(xué) 2016



本文編號:3300757

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