家蠶二分濃核病毒NS1蛋白表達分析及其互作蛋白研究
發(fā)布時間:2021-07-24 13:40
家蠶二分濃核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)歸屬于新設定的二分DNA病毒科二分濃核病毒屬,是目前唯一一個編碼DNA聚合酶的單鏈二分體DNA病毒。該病毒曾歸屬于細小病毒科濃核病毒亞科,與家蠶濃核病毒Ⅰ相似,病毒粒子為二十面體非囊膜包裹結構,主要感染家蠶中腸柱狀上皮細胞,并引發(fā)家蠶濃核癥。Bm BDV基因組包括兩個節(jié)段的單鏈DNA分子VD1 6.6 kb和VD26.0 kb,獨立包裝。BmBDV NS1由VD1-ORF2編碼,具有316個氨基酸殘基,其理論分子量大小為36 KDa,等電點8.70,生物信息學結果表明Bm BDV NS1蛋白與細小病毒NS1蛋白同源。先前的研究發(fā)現(xiàn)NS1蛋白是一個多功能蛋白,具有ATPase、解旋酶及綁定特定DNA序列的活性。然而,該蛋白的表達模式及其與宿主或病毒蛋白的相互作用還未闡明。在本研究中,我們首先設計了12條含12個氨基酸的短肽抗原,制備NS1的單克隆抗體,其中一個抗體具有較高的特異性和效價,能特異識別大腸桿菌中表達的NS1和病毒感染的家蠶中腸中的NS1,抗原表位為DIPPEEYRELRT。然后分析了ns1基因在病...
【文章來源】:江蘇大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
家蠶感染BmBDV后的病理現(xiàn)象[8]
編碼非結構蛋白 NS3,VD2-ORF2 包括 3483 nts,編碼次要結構蛋白 P133(其基因組結構圖1.2 所示)。此外,通過序列分析發(fā)現(xiàn),在這些 ORFs 的上下游區(qū)域都存在有各類保守的啟動子元件 TATA 盒子、CAGT 盒子和多聚的腺苷酸化信號序列[7, 10, 11]。BmBDV 是動物病毒中唯一的具有兩個節(jié)段的單鏈 DNA 基因組結構且編碼DNA 聚合酶的病毒[12],并且該病毒還具有不同于其相似病毒細小病毒基因組結構,復制模式也未可知。因此,研究 BmBDV 復制相關蛋白對研究該病毒的復制機制具有重要意義。
家蠶二分濃核病毒 NS1 蛋白表達分析及其互作蛋白研究SKPSSLISNISSPST)。T45 是一個堿性的絲氨酸/蘇氨酸激酶的磷酸化位點Baso-ST-kin,Basophilic serine/threonine kinase group),其保守氨基酸序列為QKSAKRLTISSLESG)。Y160 是一個絡氨酸激酶磷酸化位點(Y-kin,Tyrosineinase group),其保守氨基酸序列為(SKFCEALYSIFTMSD)及 Y116 是一個SH2,Src homology 2 group)結構的酪氨酸位點,其保守氨基酸序列為INYQEYYYEEV NNRL)。SH2(Src 同源域 2)結構域是 Src 癌蛋白和許多他細胞內信號轉導蛋白質中結構保守的蛋白質結構域[14, 15],SH2 結構域和含有些結構域的蛋白質與其他蛋白質上的磷酸化酪氨酸殘基相互作用,有助于受體氨酸激酶途徑的信號轉導(如圖 1.5)?傊,NS1 結構的多樣性,保證了 NS1白功能的多樣性(如圖 1.6)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達及定位[J]. 張清,張曉龍,李國輝,姚勤,胡朝陽. 生物技術. 2015(03)
[2]家蠶二分濃核病毒綜述[J]. 胡朝陽,李國輝,李光田,姚勤,陳克平. 科學通報. 2013(19)
[3]細小病毒非結構蛋白NS1功能的研究進展[J]. 張俊紅,李國輝,陳慧卿,黃國平,姚勤. 安徽農業(yè)科學. 2010(22)
[4]我國桑蠶業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[J]. 張晴,周振亞,羅其友. 農業(yè)經(jīng)濟問題. 2008(01)
[5]家蠶病毒的特性和對蠶的侵染[J]. 楊大楨. 四川蠶業(yè). 1987(03)
[6]家蠶作為模式生物在現(xiàn)代生物學中的應用[J]. 朱曉蘇,宋艷,徐世清. 實驗動物與比較醫(yī)學. 2009 (01)
碩士論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達及細胞毒性研究[D]. 徐五.江蘇大學 2016
[2]家蠶絲氨酸蛋白酶BmSP142在抗病毒侵染中的作用[D]. 周倩.江蘇大學 2016
[3]家蠶二分濃核病毒感染的家蠶連續(xù)病理變化研究[D]. 張曉龍.江蘇大學 2016
本文編號:3300757
【文章來源】:江蘇大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
家蠶感染BmBDV后的病理現(xiàn)象[8]
編碼非結構蛋白 NS3,VD2-ORF2 包括 3483 nts,編碼次要結構蛋白 P133(其基因組結構圖1.2 所示)。此外,通過序列分析發(fā)現(xiàn),在這些 ORFs 的上下游區(qū)域都存在有各類保守的啟動子元件 TATA 盒子、CAGT 盒子和多聚的腺苷酸化信號序列[7, 10, 11]。BmBDV 是動物病毒中唯一的具有兩個節(jié)段的單鏈 DNA 基因組結構且編碼DNA 聚合酶的病毒[12],并且該病毒還具有不同于其相似病毒細小病毒基因組結構,復制模式也未可知。因此,研究 BmBDV 復制相關蛋白對研究該病毒的復制機制具有重要意義。
家蠶二分濃核病毒 NS1 蛋白表達分析及其互作蛋白研究SKPSSLISNISSPST)。T45 是一個堿性的絲氨酸/蘇氨酸激酶的磷酸化位點Baso-ST-kin,Basophilic serine/threonine kinase group),其保守氨基酸序列為QKSAKRLTISSLESG)。Y160 是一個絡氨酸激酶磷酸化位點(Y-kin,Tyrosineinase group),其保守氨基酸序列為(SKFCEALYSIFTMSD)及 Y116 是一個SH2,Src homology 2 group)結構的酪氨酸位點,其保守氨基酸序列為INYQEYYYEEV NNRL)。SH2(Src 同源域 2)結構域是 Src 癌蛋白和許多他細胞內信號轉導蛋白質中結構保守的蛋白質結構域[14, 15],SH2 結構域和含有些結構域的蛋白質與其他蛋白質上的磷酸化酪氨酸殘基相互作用,有助于受體氨酸激酶途徑的信號轉導(如圖 1.5)?傊,NS1 結構的多樣性,保證了 NS1白功能的多樣性(如圖 1.6)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達及定位[J]. 張清,張曉龍,李國輝,姚勤,胡朝陽. 生物技術. 2015(03)
[2]家蠶二分濃核病毒綜述[J]. 胡朝陽,李國輝,李光田,姚勤,陳克平. 科學通報. 2013(19)
[3]細小病毒非結構蛋白NS1功能的研究進展[J]. 張俊紅,李國輝,陳慧卿,黃國平,姚勤. 安徽農業(yè)科學. 2010(22)
[4]我國桑蠶業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[J]. 張晴,周振亞,羅其友. 農業(yè)經(jīng)濟問題. 2008(01)
[5]家蠶病毒的特性和對蠶的侵染[J]. 楊大楨. 四川蠶業(yè). 1987(03)
[6]家蠶作為模式生物在現(xiàn)代生物學中的應用[J]. 朱曉蘇,宋艷,徐世清. 實驗動物與比較醫(yī)學. 2009 (01)
碩士論文
[1]家蠶二分濃核病毒NS1蛋白的表達及細胞毒性研究[D]. 徐五.江蘇大學 2016
[2]家蠶絲氨酸蛋白酶BmSP142在抗病毒侵染中的作用[D]. 周倩.江蘇大學 2016
[3]家蠶二分濃核病毒感染的家蠶連續(xù)病理變化研究[D]. 張曉龍.江蘇大學 2016
本文編號:3300757
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