灰皮支黑豆抗大豆胞囊線蟲轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)研究
發(fā)布時間：2021-07-11 07:55
大豆胞囊線蟲（Heterodera glycines,Soybean cyst nematode,SCN）是全球范圍影響大豆生產(chǎn)的重要病害,防治大豆胞囊線蟲的方法包括物理防治、化學(xué)防治、生物防治及應(yīng)用抗病品種;而抗線蟲品種則是環(huán)境友好,防效顯著的方法。大豆原產(chǎn)中國,因此我國具有豐富的抗線蟲資源�；移ぶШ诙棺鳛橐环N優(yōu)秀的抗線蟲品種可用于抗線蟲育種的抗原材料,為了明確其抗大豆胞囊線蟲的分子機(jī)制,開展了如下五部分的研究。一、SCN脅迫下灰皮支黑豆轉(zhuǎn)錄組分析:利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序?qū)移ぶШ诙菇臃N大豆胞囊線蟲5 d、10 d和15 d的樣本進(jìn)行研究,對測序得到的reads標(biāo)準(zhǔn)化處理、基因組匹配、差異表達(dá)分析和功能富集分析。在接種大豆胞囊線蟲后5 d、10 d和15 d分別檢測到740、1165和2925條差異表達(dá)基因。其中有225條差異基因在全部三個測序時間表達(dá)。大豆胞囊線蟲侵染灰皮支黑豆5 d、10 d和15 d差異表達(dá)基因參與了眾多的生物學(xué)功能類型。上調(diào)表達(dá)基因富集在防御反應(yīng)、激素介導(dǎo)的信號過程和脅迫的響應(yīng)。為了驗證GO和KEGG富集的結(jié)果;分析生物脅迫代謝途徑中激素對大豆胞囊線蟲的影響,水楊酸...
【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：107 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)的gRNA介導(dǎo)的基因組編輯(ShanQ.etal.,2014)
豆有效的降低大豆胞囊線蟲的繁殖能力和胞囊中卵的數(shù)量�；移ぶg幼蟲 5 d、10 d 和 15 d 后根內(nèi)部不同齡期幼蟲、以及 35 d 后的胞囊數(shù)量以及 10 次生物學(xué)重復(fù)（t-test，*表示 p<0.05，**表示 p-value < 0.005，***表示 p<0豆胞囊線蟲 35 d 后的胞囊數(shù)量�；疑硎具|豆 15，黑色表示灰皮支黑豆，結(jié)果低于遼豆 15 中胞囊中卵的數(shù)量。Mean ± SD 包含了 10 次生物學(xué)重復(fù)（t-test，表示 p-value < 0.005，***表示 p<0.001）。izhi Heidou could reduce SCN reproduction and decreased the eggs per cformation on Huipizhi Heidou and Liaodou15 at 35 days post infection: the gray colun Liao15 as control, and the black column represents number of cysts on Huipizhi Hng data from 10 biological replicates (t-test, *p-value < 0.05, *** p-value<0.001, andeen Huipizhi Heidou and Liaodou15: the result showed that the eggs per cyst betwe different. Mean and SD were examined using data from 2 biological replicates (t-te**p-value < 0.005, ***p-value<0.001, and n = 10).q 的質(zhì)量檢測和基因組 mapping灰皮支黑豆抑制大豆胞囊線蟲的分子生物學(xué)機(jī)制，利用 R
胞囊線蟲侵染后的差異表達(dá)基因。A）火山圖所示灰皮支黑豆上調(diào)與下調(diào)表達(dá)的基因在三樣本中的分布 （padj<0.05）和維恩圖所示上調(diào)和下調(diào)表達(dá)基因在每個測序樣本中的分布2 Differentially expressed genes after SCN infection. A). The volcano plots show the numbers differentially expressed genes in each comparison group (padj < 0.05). B). Venn diagrams show the disof up- and down-regulated genes at each time point (padj < 0.05).CR 鑒定 RNA Seq 數(shù)據(jù)鑒定 RNA-Seq 數(shù)據(jù)，利用 qPCR 來分析在全部檢測時間點共同表達(dá)的 條差異基因序列用于該部分的驗證，結(jié)果表明 qPCR 的結(jié)果與 RNA-Se相同的表達(dá)趨勢（圖 2-3）；qPCR 的引物詳見附表 2-1。
本文編號：3277675
【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：107 頁
【學(xué)位級別】：博士
【部分圖文】：
利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)的gRNA介導(dǎo)的基因組編輯(ShanQ.etal.,2014)
豆有效的降低大豆胞囊線蟲的繁殖能力和胞囊中卵的數(shù)量�；移ぶg幼蟲 5 d、10 d 和 15 d 后根內(nèi)部不同齡期幼蟲、以及 35 d 后的胞囊數(shù)量以及 10 次生物學(xué)重復(fù)（t-test，*表示 p<0.05，**表示 p-value < 0.005，***表示 p<0豆胞囊線蟲 35 d 后的胞囊數(shù)量�；疑硎具|豆 15，黑色表示灰皮支黑豆，結(jié)果低于遼豆 15 中胞囊中卵的數(shù)量。Mean ± SD 包含了 10 次生物學(xué)重復(fù)（t-test，表示 p-value < 0.005，***表示 p<0.001）。izhi Heidou could reduce SCN reproduction and decreased the eggs per cformation on Huipizhi Heidou and Liaodou15 at 35 days post infection: the gray colun Liao15 as control, and the black column represents number of cysts on Huipizhi Hng data from 10 biological replicates (t-test, *p-value < 0.05, *** p-value<0.001, andeen Huipizhi Heidou and Liaodou15: the result showed that the eggs per cyst betwe different. Mean and SD were examined using data from 2 biological replicates (t-te**p-value < 0.005, ***p-value<0.001, and n = 10).q 的質(zhì)量檢測和基因組 mapping灰皮支黑豆抑制大豆胞囊線蟲的分子生物學(xué)機(jī)制，利用 R
胞囊線蟲侵染后的差異表達(dá)基因。A）火山圖所示灰皮支黑豆上調(diào)與下調(diào)表達(dá)的基因在三樣本中的分布 （padj<0.05）和維恩圖所示上調(diào)和下調(diào)表達(dá)基因在每個測序樣本中的分布2 Differentially expressed genes after SCN infection. A). The volcano plots show the numbers differentially expressed genes in each comparison group (padj < 0.05). B). Venn diagrams show the disof up- and down-regulated genes at each time point (padj < 0.05).CR 鑒定 RNA Seq 數(shù)據(jù)鑒定 RNA-Seq 數(shù)據(jù)，利用 qPCR 來分析在全部檢測時間點共同表達(dá)的 條差異基因序列用于該部分的驗證，結(jié)果表明 qPCR 的結(jié)果與 RNA-Se相同的表達(dá)趨勢（圖 2-3）；qPCR 的引物詳見附表 2-1。
本文編號：3277675
本文鏈接：http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3277675.html
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