發(fā)布時(shí)間：2021-06-24 13:25

　　哺乳動(dòng)物腸道內(nèi)存在著大量的細(xì)菌群落,其與宿主對(duì)食物資源的消化和吸收、能量代謝、免疫和腸道發(fā)育等生命活動(dòng)密切相關(guān)。作為動(dòng)物體內(nèi)重要的“器官”,野生動(dòng)物腸道菌群已經(jīng)獲得了越來越多的關(guān)注。鼢鼠屬嚙齒目鼴形鼠科鼢鼠亞科,主要通過挖掘洞道采食植物根系為生,是我國北方地區(qū)農(nóng)田、草原及林區(qū)的主要地下害鼠之一。目前對(duì)鼢鼠對(duì)食物消化的研究主要集中在腸道組織結(jié)構(gòu)等形態(tài)生理學(xué)方面,而腸道微生物的研究尚未報(bào)道。本文通過細(xì)菌16S rRNA的Illumina高通量測序技術(shù),對(duì)不同地區(qū)的鼢鼠的盲腸細(xì)菌群落組成和多樣性進(jìn)行了研究,首先分析了甘肅鼢鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)和多樣性,確定了甘肅鼢鼠腸道細(xì)菌群落的組成特征,其次探討了地域、性別和季節(jié)三個(gè)因素對(duì)甘肅鼢鼠腸道細(xì)菌群落和多樣性的影響,最后明確了高原鼢鼠、甘肅鼢鼠、羅氏鼢鼠和草原鼢鼠等四種鼢鼠腸道組成分布、群落結(jié)構(gòu)與多樣性。主要研究結(jié)果如下:一、甘肅鼢鼠腸道細(xì)菌群落組成的分布特征在門水平上,甘肅鼢鼠腸道菌群的核心菌為厚壁菌門（Firmicutes）和擬桿菌門（Bacteroidetes）,二者之和占總腸道菌的88%左右;在科水平上,核心菌為瘤胃菌科（Ruminococcac... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

屬水平上甘肅粉鼠腸道優(yōu)勢(shì)細(xì)菌分布的熱圖(右邊:科類菌名稱;左邊:不同顏色對(duì)應(yīng)的相對(duì)豐度;最下面:樣品編號(hào))

（3）雌雄鼠間β多樣性差異分析為進(jìn)一步了解腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在雌雄鼠間的差異性，基于加權(quán)的 UniFrac 距離矩進(jìn)行 NMDS 分析，結(jié)果顯示：雌性組樣品在 NMDS 分析圖中分布較聚集，樣品間距接近，而雄性組樣品分散，樣品間距離較遠(yuǎn)，說明雌性甘肅鼢鼠腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相性高，而雄性細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在樣品間差異較大（圖 3-5）。表 3-1. 雌雄鼠間腸道細(xì)菌的樣品 OTUs 和α多樣性指數(shù)表Table 3-1. OTUs richness and diversity indices for Female and MaleSampleOTU數(shù)目OTUsα-多樣性指數(shù)Alpha diversityChao1 指數(shù)Chao1 IndexAce 指數(shù)Ace Index辛普森指數(shù)Simpson Index香濃指數(shù)Shannon IndexFamle2772 1342.61±72.83 2037.88±157.92 0..99±0.00 8.44±0.18Male2666 1339.22±67.29 2110.71±170.44 0..99±0.00 8.56±0.12p0.446 0.973 0.762 0.704 0.622

性的分析解甘肅鼢鼠腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在 6 縣（區(qū)）的分布特征 NMDS 分析方法，通過對(duì)樣本距離進(jìn)行等級(jí)排序，使樣之間的距離遠(yuǎn)近的關(guān)系，NMDS 分析中兩點(diǎn)之間的距離結(jié)構(gòu)相似度越高，差異越小。UniFrac 距離矩陣 NMD源縣三縣樣品間距離接近，說明這三個(gè)縣樣品組間的腸縣樣品組內(nèi)距離相對(duì)較小，說明海原縣甘肅鼢鼠腸道細(xì)與彭陽縣、隆德縣和涇源縣三縣樣品間距離較遠(yuǎn)，細(xì)菌品組內(nèi)距離較大，細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似度低，沒有規(guī)律

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]鼢鼠挖掘活動(dòng)及爪趾幾何特征量化分析[J]. 王洪昌,涂鳴,劉念,曾榮,王忠民,佟金.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(09)
[2]甘肅鼢鼠適應(yīng)地下生活的消化道形態(tài)和結(jié)構(gòu)的季節(jié)可塑性[J]. 王倩,楊佐娟,李金鋼,何建平.  動(dòng)物學(xué)雜志. 2016(04)
[3]高原鼢鼠的消化對(duì)策[J]. 張守棟,林恭華,楊傳華,崔雪峰,覃雯,張同作,蘇建平.  四川動(dòng)物. 2014(05)
[4]基于16S rRNA基因序列分析梅花鹿瘤胃細(xì)菌多樣性[J]. 李志鵬,劉晗璐,崔學(xué)哲,荊祎,鮑坤,徐超,楊福合,李光玉.  動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2013(09)
[5]甘肅鼢鼠消化道的組織結(jié)構(gòu)[J]. 王劍,樊魏偉,楊佐娟,何建平.  陜西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[6]微生物菌群多樣性分析方法的研究進(jìn)展[J]. 許文濤,郭星,羅云波,黃昆侖.  食品科學(xué). 2009(07)
[7]中華鼢鼠防治技術(shù)研究[J]. 周昱.  山西林業(yè)科技. 2006(03)
[8]林區(qū)嚙齒動(dòng)物群落管理中的生態(tài)閾值研究[J]. 韓崇選,楊學(xué)軍,王明春,卜書海,張宏利,楊清娥.  西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(01)
[9]籠養(yǎng)條件下甘肅鼢鼠夏秋季行為活動(dòng)節(jié)律[J]. 李金鋼,何建平,王廷正.  西北大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(02)
[10]主要嚙齒動(dòng)物的特異性研究[J]. 韓崇選,楊學(xué)軍,王明春,楊清娥.  西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2002(03)

博士論文
[1]社群環(huán)境下的短尾猴腸道微生物群落結(jié)構(gòu)及適應(yīng)進(jìn)化[D]. 孫丙華.安徽大學(xué) 2016
[2]不同鼠種的腸道菌群在不同飲食結(jié)構(gòu)干預(yù)中的組成改變[D]. 谷莉.中南大學(xué) 2014
[3]綿羊瘤胃主要纖維降解細(xì)菌的分離鑒定及不同氮源對(duì)其纖維降解能力的影響[D]. 劉占英.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]奶牛腸道微生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性研究[D]. 高鳳.河北工程大學(xué) 2017
[2]甘肅鼢鼠活動(dòng)節(jié)律及其食性研究[D]. 王瑾.延安大學(xué) 2016
[3]黃土高原林地鼢鼠發(fā)生規(guī)律研究[D]. 辛?xí)暂x.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3247183