小菜蛾基因組中內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒元件PxERV的發(fā)現(xiàn)與特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-07 04:43
【目的】內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(endogenous retroviruses, ERVs)是一類在宿主基因組中世代留存的有類似病毒結(jié)構(gòu)的序列元件。本研究在通過前期小菜蛾P(guān)lutella xylostella精巢轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)一個(gè)小菜蛾內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒元件PxERV的基礎(chǔ)上,探究該逆轉(zhuǎn)錄病毒元件的序列特征及侵染活性,為探明內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒對(duì)小菜蛾的影響奠定基礎(chǔ)。【方法】利用生物信息學(xué)方法分析鑒定了PxERV在小菜蛾基因組上的序列及結(jié)構(gòu)特點(diǎn),并用基因克隆和測(cè)序得到PxERV的env基因序列;進(jìn)一步通過MEGA6軟件構(gòu)建了昆蟲env基因編碼的氨基酸序列與核型多角體病毒包膜糖蛋白的系統(tǒng)發(fā)育樹。利用qPCR技術(shù)檢測(cè)了env基因在小菜蛾G88品系不同發(fā)育時(shí)期蟲體和精巢中的表達(dá)模式及FZ品系成蟲和G88品系的成蟲和幼蟲中env基因拷貝數(shù)的變化。利用CRISPR/Cas9介導(dǎo)小菜蛾G88品系中env基因突變,檢測(cè)PxERV的獨(dú)立復(fù)制活性!窘Y(jié)果】PxERV有LTR-pol-env-LTR結(jié)構(gòu),其env基因與果蠅Drosophila buzzatii逆轉(zhuǎn)座子osvaldo和粉紋夜蛾Trichoplusia ...
【文章來源】:昆蟲學(xué)報(bào). 2020,63(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
小菜蛾內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒元件PxERV基因組結(jié)構(gòu)示意圖
基于氨基酸序列構(gòu)建的昆蟲內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒env基因編碼的氨基酸序列與核型多角體病毒包膜糖蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹(鄰接法, 1 000次重復(fù))
我們對(duì)5個(gè)發(fā)育時(shí)期的小菜蛾G88品系蟲體和精巢中env基因的表達(dá)情況進(jìn)行了qPCR檢測(cè),結(jié)果(圖3)顯示該env基因在成蟲精巢中特異性高表達(dá)(P<0.05),在其他發(fā)育時(shí)期的蟲體和精巢之間表達(dá)量都沒有顯著差異(P>0.05),但在成蟲時(shí)期的蟲體中比其他時(shí)期蟲體中表達(dá)量稍高;在精巢中的表達(dá)量總體比在蟲體中表達(dá)量稍高。2.4 env基因在小菜蛾不同品系中的拷貝數(shù)
本文編號(hào):3215888
【文章來源】:昆蟲學(xué)報(bào). 2020,63(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
小菜蛾內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒元件PxERV基因組結(jié)構(gòu)示意圖
基于氨基酸序列構(gòu)建的昆蟲內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒env基因編碼的氨基酸序列與核型多角體病毒包膜糖蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹(鄰接法, 1 000次重復(fù))
我們對(duì)5個(gè)發(fā)育時(shí)期的小菜蛾G88品系蟲體和精巢中env基因的表達(dá)情況進(jìn)行了qPCR檢測(cè),結(jié)果(圖3)顯示該env基因在成蟲精巢中特異性高表達(dá)(P<0.05),在其他發(fā)育時(shí)期的蟲體和精巢之間表達(dá)量都沒有顯著差異(P>0.05),但在成蟲時(shí)期的蟲體中比其他時(shí)期蟲體中表達(dá)量稍高;在精巢中的表達(dá)量總體比在蟲體中表達(dá)量稍高。2.4 env基因在小菜蛾不同品系中的拷貝數(shù)
本文編號(hào):3215888
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