蘭州熊蜂不同級(jí)型microRNAs特性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-28 09:34
熊蜂傳粉在自然生態(tài)系統(tǒng)和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中發(fā)揮著重要作用。蘭州熊蜂(Bombus lantschouensis)是近年來(lái)我國(guó)篩選出的本土優(yōu)良蜂種,具有繁殖性狀好、傳粉效率高等優(yōu)點(diǎn)。在蘭州熊蜂繁育過(guò)程中,級(jí)型分化和蜂王產(chǎn)卵等影響蜂群發(fā)育的關(guān)鍵生物學(xué)過(guò)程的調(diào)控機(jī)制仍不明確,限制了蘭州熊蜂的規(guī);庇c傳粉利用。MicroRNAs(miRNAs)在生物體早期發(fā)育、組織分化等諸多生物學(xué)過(guò)程具有重要的調(diào)控作用,然而miRNAs在蘭州熊蜂蜂群生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的調(diào)控作用有待進(jìn)一步研究。本研究以蘭州熊蜂為材料,基于高通量測(cè)序數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)方法,對(duì)蘭州熊蜂三個(gè)級(jí)型成年蜂頭部、產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢miRNAs進(jìn)行預(yù)測(cè)和表達(dá)差異分析,使用熒光定量對(duì)差異表達(dá)顯著miRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,并分析其功能。主要取得以下結(jié)果:(1)蘭州熊蜂三個(gè)級(jí)型成年蜂頭部miRNAs分析。以蘭州熊蜂成年工蜂、雄蜂和蜂王的頭部為材料,基于高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析三個(gè)級(jí)型頭部miRNAs。結(jié)果表明,三型蜂頭部共鑒定出364種已知miRNAs和89種新miRNAs;在雄蜂與蜂王、雄蜂與工蜂,工蜂與蜂王之間表達(dá)量達(dá)到顯著差異水平的miRNAs分別有9種...
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
主要符號(hào)對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 熊蜂簡(jiǎn)介
1.1.1 熊蜂蜂群組成
1.1.2 熊蜂生活史
1.1.3 熊蜂人工繁育
1.1.4 熊蜂傳粉應(yīng)用
1.2 miRNAS簡(jiǎn)介
1.2.1 miRNAs研究概況
1.2.2 miRNAs作用機(jī)制
1.2.3 miRNAs的研究方法
1.3 miRNAS對(duì)昆蟲(chóng)的調(diào)控作用
1.4 miRNAS在蜜蜂和熊蜂中的研究
1.5 研究目的和意義
1.6 研究?jī)?nèi)容
第二章 蘭州熊蜂三型蜂頭部miRNAs特性分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試?yán)ハx(chóng)
2.1.2 主要數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
2.1.3 主要試劑
2.1.4 主要儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 頭部總RNA提取
2.2.2 頭部smallRNA文庫(kù)構(gòu)建及高通量測(cè)序
2.2.3 頭部測(cè)序結(jié)果處理及比對(duì)分析
2.2.4 頭部miRNAs預(yù)測(cè)
2.2.5 頭部miRNAs差異表達(dá)分析
2.2.6 頭部miRNAs靶基因功能預(yù)測(cè)和通路分析
2.2.7 頭部差異表達(dá)顯著miRNAs驗(yàn)證
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 頭部測(cè)序數(shù)據(jù)分析
2.3.2 頭部miRNAs
2.3.3 頭部差異表達(dá)miRNAs
2.3.4 頭部差異表達(dá)顯著miRNAs靶基因及其功能富集分析
2.3.5 RT-qPCR驗(yàn)證頭部差異表達(dá)顯著miRNAs
2.4 討論
第三章 蘭州熊蜂產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢miRNAs表達(dá)特性分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 供試?yán)ハx(chóng)
3.1.2 主要數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
3.1.3 主要試劑
3.1.4 主要儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 卵巢總RNA提取
3.2.2 卵巢smallRNA文庫(kù)構(gòu)建及高通量測(cè)序
3.2.3 卵巢測(cè)序結(jié)果處理及比對(duì)分析
3.2.4 卵巢miRNAs預(yù)測(cè)
3.2.5 卵巢miRNAs差異表達(dá)分析
3.2.7 卵巢差異表達(dá)顯著miRNAs驗(yàn)證
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
3.3.2 產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢miRNAs
3.3.3 產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢差異表達(dá)miRNAs
3.3.4 RT-qPCR驗(yàn)證卵巢差異表達(dá)顯著miRNAs
3.4 討論
第四章 全文結(jié)論
4.1 全文結(jié)論
4.2 前景展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)熊蜂多樣性、人工利用與保護(hù)策略[J]. 黃家興,安建東. 生物多樣性. 2018(05)
[2]蘭州熊蜂蜂王頭部產(chǎn)卵相關(guān)microRNA生物信息學(xué)分析[J]. 孫冬婷,董捷,黃家興,和紹禹,吳杰. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015 (12)
[3]河北地區(qū)熊蜂物種多樣性與蜂群繁育特性[J]. 安建東,黃家興,Paul H.WILLIAMS,吳杰,周冰峰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(06)
[4]熊蜂為溫室茄屬作物授粉的優(yōu)越性[J]. 黃家興,安建東,吳杰,國(guó)占寶. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[5]明亮熊蜂的生物學(xué)特性及其授粉應(yīng)用[J]. 安建東,彭文君,吳杰,國(guó)占寶,童越敏,李繼蓮. 昆蟲(chóng)知識(shí). 2006(01)
[6]熊蜂的生物學(xué)特性及其授粉應(yīng)用前景[J]. 安建東,彭文君,梁詩(shī)魁. 蜜蜂雜志. 1999(09)
博士論文
[1]五種昆蟲(chóng)非編碼RNA基因發(fā)現(xiàn)及miR-14的功能研究[D]. 肖花美.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]蜜蜂(Apis mellifera)microRNA的全基因組挖掘及在雌性蜜蜂級(jí)型分化關(guān)鍵時(shí)期轉(zhuǎn)錄組水平調(diào)控作用[D]. 陳璇.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3208006
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:58 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
主要符號(hào)對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 熊蜂簡(jiǎn)介
1.1.1 熊蜂蜂群組成
1.1.2 熊蜂生活史
1.1.3 熊蜂人工繁育
1.1.4 熊蜂傳粉應(yīng)用
1.2 miRNAS簡(jiǎn)介
1.2.1 miRNAs研究概況
1.2.2 miRNAs作用機(jī)制
1.2.3 miRNAs的研究方法
1.3 miRNAS對(duì)昆蟲(chóng)的調(diào)控作用
1.4 miRNAS在蜜蜂和熊蜂中的研究
1.5 研究目的和意義
1.6 研究?jī)?nèi)容
第二章 蘭州熊蜂三型蜂頭部miRNAs特性分析
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 供試?yán)ハx(chóng)
2.1.2 主要數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
2.1.3 主要試劑
2.1.4 主要儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 頭部總RNA提取
2.2.2 頭部smallRNA文庫(kù)構(gòu)建及高通量測(cè)序
2.2.3 頭部測(cè)序結(jié)果處理及比對(duì)分析
2.2.4 頭部miRNAs預(yù)測(cè)
2.2.5 頭部miRNAs差異表達(dá)分析
2.2.6 頭部miRNAs靶基因功能預(yù)測(cè)和通路分析
2.2.7 頭部差異表達(dá)顯著miRNAs驗(yàn)證
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 頭部測(cè)序數(shù)據(jù)分析
2.3.2 頭部miRNAs
2.3.3 頭部差異表達(dá)miRNAs
2.3.4 頭部差異表達(dá)顯著miRNAs靶基因及其功能富集分析
2.3.5 RT-qPCR驗(yàn)證頭部差異表達(dá)顯著miRNAs
2.4 討論
第三章 蘭州熊蜂產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢miRNAs表達(dá)特性分析
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 供試?yán)ハx(chóng)
3.1.2 主要數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
3.1.3 主要試劑
3.1.4 主要儀器
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 卵巢總RNA提取
3.2.2 卵巢smallRNA文庫(kù)構(gòu)建及高通量測(cè)序
3.2.3 卵巢測(cè)序結(jié)果處理及比對(duì)分析
3.2.4 卵巢miRNAs預(yù)測(cè)
3.2.5 卵巢miRNAs差異表達(dá)分析
3.2.7 卵巢差異表達(dá)顯著miRNAs驗(yàn)證
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
3.3.2 產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢miRNAs
3.3.3 產(chǎn)卵與未產(chǎn)卵蜂王卵巢差異表達(dá)miRNAs
3.3.4 RT-qPCR驗(yàn)證卵巢差異表達(dá)顯著miRNAs
3.4 討論
第四章 全文結(jié)論
4.1 全文結(jié)論
4.2 前景展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)熊蜂多樣性、人工利用與保護(hù)策略[J]. 黃家興,安建東. 生物多樣性. 2018(05)
[2]蘭州熊蜂蜂王頭部產(chǎn)卵相關(guān)microRNA生物信息學(xué)分析[J]. 孫冬婷,董捷,黃家興,和紹禹,吳杰. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015 (12)
[3]河北地區(qū)熊蜂物種多樣性與蜂群繁育特性[J]. 安建東,黃家興,Paul H.WILLIAMS,吳杰,周冰峰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(06)
[4]熊蜂為溫室茄屬作物授粉的優(yōu)越性[J]. 黃家興,安建東,吳杰,國(guó)占寶. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2007(03)
[5]明亮熊蜂的生物學(xué)特性及其授粉應(yīng)用[J]. 安建東,彭文君,吳杰,國(guó)占寶,童越敏,李繼蓮. 昆蟲(chóng)知識(shí). 2006(01)
[6]熊蜂的生物學(xué)特性及其授粉應(yīng)用前景[J]. 安建東,彭文君,梁詩(shī)魁. 蜜蜂雜志. 1999(09)
博士論文
[1]五種昆蟲(chóng)非編碼RNA基因發(fā)現(xiàn)及miR-14的功能研究[D]. 肖花美.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]蜜蜂(Apis mellifera)microRNA的全基因組挖掘及在雌性蜜蜂級(jí)型分化關(guān)鍵時(shí)期轉(zhuǎn)錄組水平調(diào)控作用[D]. 陳璇.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3208006
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3208006.html
最近更新
教材專著