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六種斑野螟亞科昆蟲全線粒體基因組的序列測定與分析

發(fā)布時間:2021-05-19 19:32
  本文采用PCR技術(shù)結(jié)合引物步移法測定了桃多斑野螟Conogethes punctiferalis(Guenee,1854),黃楊絹野螟Diaphaniaperspectalis(Walker,1859),白蠟絹須野螟 Palpita nigropnctalis(Bremer,1864),四目扇野螟 Pleuroptya infeior(Hampson,1898),乳翅卷野螟Pycnarmon lactiferalis(Walker,1859)豹紋卷野螟Pycnarmon pantherata(Butler,1878)6種斑野螟亞科昆蟲(螟蛾總科:草螟科)線粒體基因組全序列,并結(jié)合已測螟蛾總科昆蟲線粒體基因組對其進行了比較基因組學(xué)以及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的初步分析,主要結(jié)論如下:1.桃多斑野螟、黃楊絹野螟、白蠟絹須野螟、四目扇野螟、乳翅卷野螟、豹紋卷野螟線粒體基因組序列全長分別為15325 bp、15249 bp、15226 bp、15348 bp、15219 bp、15545 bp,其中豹紋卷野螟是已測螟蛾總科昆蟲線粒體基因組序列中最長的一個物種,其長度差異主要體現(xiàn)在控制區(qū)。6種斑野螟亞科昆蟲... 

【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 分類單元及研究物種的介紹
        1.1.1 鱗翅目及螟蛾總科概況
        1.1.2 研究物種的介紹
    1.2 線粒體基因組
        1.2.1 線粒體結(jié)構(gòu)特征
        1.2.2 線粒體基因組
        1.2.3 線粒體基因組各組分特征
    1.3 螟蛾總科線粒體基因組的研究現(xiàn)狀
    1.4 本研究的目的和意義
第2章 研究材料與方法
    2.1 標本的采集、保存與鑒定
    2.2 實驗主要儀器和試劑
    2.3 實驗方法
        2.3.1 總DNA提取和檢測
        2.3.2 PCR引物設(shè)計、擴增和測序
        2.3.3 數(shù)據(jù)處理及分析
    2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.4.1 數(shù)據(jù)來源及外群選擇
        2.4.2 系統(tǒng)發(fā)育分析方法
第3章 實驗結(jié)果及分析討論
    3.1 基因組的結(jié)構(gòu)和組成
        3.1.1 線粒體基因組的結(jié)構(gòu)
        3.1.2 核苷酸組成
    3.2 基因間隔區(qū)與重疊區(qū)
    3.3 蛋白質(zhì)編碼基因
        3.3.1 蛋白質(zhì)編碼基因的組成結(jié)構(gòu)
        3.3.2 蛋白質(zhì)編碼基因起始密碼子和終止密碼子的使用
        3.3.3 蛋白質(zhì)編碼基因密碼子的使用及氨基酸的組成
    3.4 tRNA基因
        3.4.1 tRNA基因的組成
        3.4.2 tRNA基因的二級結(jié)構(gòu)
    3.5 rRNA基因
        3.5.1 rRNA基因的組成
        3.5.2 rRNA基因的二級結(jié)構(gòu)
    3.6 A+T富集區(qū)
    3.7 討論
第4章 螟蛾總科系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的探討
    4.1 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
    4.2 系統(tǒng)發(fā)育樹的結(jié)果及討論
        4.2.1 貝葉斯法建樹結(jié)果分析
        4.2.2 最大似然法建樹結(jié)果分析
第5章 總結(jié)
參考文獻
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果


【參考文獻】:
期刊論文
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[8]PCR引物設(shè)計及軟件使用技巧[J]. 張新宇,高燕寧.  生物信息學(xué). 2004(04)
[9]玉米田桃蛀螟發(fā)生規(guī)律的研究[J]. 吳立民,陸化森.  昆蟲知識. 1995(04)



本文編號:3196323

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