中國落葉松-楊柵銹菌SSR遺傳多樣性分析及特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
發(fā)布時間:2021-05-07 11:39
落葉松-楊柵銹菌(Melampsora larici-populina,簡稱MLP)是一種在世界范圍內(nèi)廣泛傳播并產(chǎn)生嚴(yán)重危害的轉(zhuǎn)主寄生真菌,主要分布在我國西北、東北、華北等地區(qū),危害青楊派、黑楊派及其雜交種等多種楊樹。該菌繁殖速度快,群體數(shù)量大,致病性變異頻率高,遺傳現(xiàn)象復(fù)雜。為深入了解該菌群體分化現(xiàn)狀,本研究利用微衛(wèi)星(SSR)分子標(biāo)記對63個落葉松-楊柵銹菌菌系進(jìn)行遺傳多樣性分析,主要研究結(jié)果如下:(1)從27對引物中篩選出了10對多態(tài)性較好的引物,共檢測到98個等位基因,其中MLP4、MLP12、MLP43引物分別檢測到13個等位基因,MLP57檢測到6個等位基因。平均觀察等位基因數(shù)(Na)9.8000,平均有效等位基因(Ne)5.9878。菌系總體遺傳多樣性較高,基因型豐富,平均觀測雜合度0.4109,平均期望雜合度0.8267,10個位點中有7個近交系數(shù)為正值,親代群體的雜合體數(shù)目偏少,整體純合體偏多。(2)11個MLP菌群間平均遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.3505,遺傳分化的水平總體較高,群體間的基因型多樣。菌系群體間平均基因流0.4634,有8個位點基因流Nm<1,...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 落葉松-楊柵銹菌的生物學(xué)特征
1.2 落葉松-楊柵銹菌的寄主范圍
1.3 分子標(biāo)記技術(shù)及SSR標(biāo)記技術(shù)在落葉松-楊柵銹菌中的應(yīng)用
1.3.1 分子標(biāo)記技術(shù)
1.3.2 SSR標(biāo)記技術(shù)在落葉松-楊柵銹菌研究中的應(yīng)用
1.4 研究目的及意義
第二章 材料與方法
2.1 供試菌系及試劑儀器
2.1.1 供試菌系
2.1.2 生化試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 方法與步驟
2.2.1 供試菌系的擴(kuò)繁
2.2.2 SSR標(biāo)記引物篩選
2.2.3 提取菌系基因組DNA
2.2.4 基因組DNA的 PCR擴(kuò)增與電泳
2.2.5 凝膠銀染
2.2.6 數(shù)據(jù)處理分析
2.2.7 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
第三章 結(jié)果與分析
3.1 供試菌種的擴(kuò)繁
3.2 SSR標(biāo)記引物篩選
3.3 提取菌系基因組DNA
3.3.1 菌系基因組DNA提取方法
3.3.2 提取菌系基因組DNA的質(zhì)量檢測
3.4 落葉松-楊柵銹菌遺傳多樣性
3.4.1 落葉松-楊柵銹菌引物多樣性分析
3.4.2 落葉松-楊柵銹菌菌群遺傳多樣性分析
3.4.3 落葉松-楊柵銹菌群體結(jié)構(gòu)分化
3.5 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.1 陜西關(guān)中地區(qū)特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.2 秦嶺火地塘地區(qū)特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.3 引物的靈敏度檢測
第四章 結(jié)論與討論
4.1 基于多個位點的等位基因分析
4.2 落葉松-楊柵銹菌的遺傳多樣性分析
4.3 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)的分析
參考文獻(xiàn)
附錄A 10條引物擴(kuò)增的落葉松-楊柵銹菌電泳圖
附錄B “1”、“0”格式的微衛(wèi)星電泳圖譜統(tǒng)計數(shù)據(jù)表
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]楊樹病蟲害發(fā)病癥狀與防治對策[J]. 楊麗宏. 種子科技. 2019(02)
[2]小麥條銹菌看家基因SNP引物的開發(fā)及多態(tài)性位點研究[J]. 李明菊,Md.Ashraful Alam,李昊星,程加省,丁明亮. 分子植物育種. 2018(05)
[3]蘋果抗炭疽菌葉枯病基因SNP和InDel標(biāo)記的HRM篩選[J]. 劉源霞,蘭進(jìn)好,柏素花,孫曉紅,劉春曉,張玉剛,戴洪義. 園藝學(xué)報. 2017(02)
[4]RFLP技術(shù)在作物育種中的應(yīng)用與展望[J]. 高欣,藺娜. 環(huán)渤海經(jīng)濟(jì)瞭望. 2016(06)
[5]基于SNP標(biāo)記小麥自然群體遺傳多樣性及復(fù)合圖譜的構(gòu)建[J]. 陳廣鳳,田紀(jì)春. 分子植物育種. 2015(07)
[6]松楊柵銹菌擔(dān)孢子萌發(fā)的數(shù)學(xué)模型研究[J]. 王阿川,龔文強(qiáng),王淑君,甕岳太,薛煜. 中國森林病蟲. 2014(06)
[7]小麥條銹菌3個看家基因SNP引物的首次報道(英文)[J]. 李明菊,陳萬權(quán),段霞瑜,劉太國,高利,劉博. 植物病理學(xué)報. 2014(05)
[8]中國落葉松-楊柵銹菌遺傳多樣性研究[J]. 曹支敏,杜林,王秦虎,余仲東. 菌物學(xué)報. 2012(04)
[9]淺談楊樹造林技術(shù)措施與有害生物防治[J]. 張季,單珊. 黑龍江科技信息. 2012(16)
[10]利用熒光SSR標(biāo)記鑒別楊樹品種[J]. 馮錦霞,張川紅,鄭勇奇,孫榮喜. 林業(yè)科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]楊樹耐干旱脅迫的生理機(jī)制及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 胡晨陽.武漢輕工大學(xué) 2016
[2]落葉松—楊柵銹菌生理小種分化與遺傳多樣性分析[D]. 洪瑩瑩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]落葉松—楊柵銹菌致病性及其遺傳多樣性分化研究[D]. 張浩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]落葉松—楊柵銹菌生理小種遺傳多樣性研究[D]. 杜林.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
[5]落葉松—楊柵銹菌生理小種鑒定[D]. 劉春梅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[6]中國小麥條銹菌主要流行小種DNA多態(tài)性分析[D]. 賈瑞祥.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:3173326
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 落葉松-楊柵銹菌的生物學(xué)特征
1.2 落葉松-楊柵銹菌的寄主范圍
1.3 分子標(biāo)記技術(shù)及SSR標(biāo)記技術(shù)在落葉松-楊柵銹菌中的應(yīng)用
1.3.1 分子標(biāo)記技術(shù)
1.3.2 SSR標(biāo)記技術(shù)在落葉松-楊柵銹菌研究中的應(yīng)用
1.4 研究目的及意義
第二章 材料與方法
2.1 供試菌系及試劑儀器
2.1.1 供試菌系
2.1.2 生化試劑
2.1.3 主要儀器
2.2 方法與步驟
2.2.1 供試菌系的擴(kuò)繁
2.2.2 SSR標(biāo)記引物篩選
2.2.3 提取菌系基因組DNA
2.2.4 基因組DNA的 PCR擴(kuò)增與電泳
2.2.5 凝膠銀染
2.2.6 數(shù)據(jù)處理分析
2.2.7 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
第三章 結(jié)果與分析
3.1 供試菌種的擴(kuò)繁
3.2 SSR標(biāo)記引物篩選
3.3 提取菌系基因組DNA
3.3.1 菌系基因組DNA提取方法
3.3.2 提取菌系基因組DNA的質(zhì)量檢測
3.4 落葉松-楊柵銹菌遺傳多樣性
3.4.1 落葉松-楊柵銹菌引物多樣性分析
3.4.2 落葉松-楊柵銹菌菌群遺傳多樣性分析
3.4.3 落葉松-楊柵銹菌群體結(jié)構(gòu)分化
3.5 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.1 陜西關(guān)中地區(qū)特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.2 秦嶺火地塘地區(qū)特異性DNA標(biāo)記開發(fā)
3.5.3 引物的靈敏度檢測
第四章 結(jié)論與討論
4.1 基于多個位點的等位基因分析
4.2 落葉松-楊柵銹菌的遺傳多樣性分析
4.3 特異性DNA標(biāo)記開發(fā)的分析
參考文獻(xiàn)
附錄A 10條引物擴(kuò)增的落葉松-楊柵銹菌電泳圖
附錄B “1”、“0”格式的微衛(wèi)星電泳圖譜統(tǒng)計數(shù)據(jù)表
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]楊樹病蟲害發(fā)病癥狀與防治對策[J]. 楊麗宏. 種子科技. 2019(02)
[2]小麥條銹菌看家基因SNP引物的開發(fā)及多態(tài)性位點研究[J]. 李明菊,Md.Ashraful Alam,李昊星,程加省,丁明亮. 分子植物育種. 2018(05)
[3]蘋果抗炭疽菌葉枯病基因SNP和InDel標(biāo)記的HRM篩選[J]. 劉源霞,蘭進(jìn)好,柏素花,孫曉紅,劉春曉,張玉剛,戴洪義. 園藝學(xué)報. 2017(02)
[4]RFLP技術(shù)在作物育種中的應(yīng)用與展望[J]. 高欣,藺娜. 環(huán)渤海經(jīng)濟(jì)瞭望. 2016(06)
[5]基于SNP標(biāo)記小麥自然群體遺傳多樣性及復(fù)合圖譜的構(gòu)建[J]. 陳廣鳳,田紀(jì)春. 分子植物育種. 2015(07)
[6]松楊柵銹菌擔(dān)孢子萌發(fā)的數(shù)學(xué)模型研究[J]. 王阿川,龔文強(qiáng),王淑君,甕岳太,薛煜. 中國森林病蟲. 2014(06)
[7]小麥條銹菌3個看家基因SNP引物的首次報道(英文)[J]. 李明菊,陳萬權(quán),段霞瑜,劉太國,高利,劉博. 植物病理學(xué)報. 2014(05)
[8]中國落葉松-楊柵銹菌遺傳多樣性研究[J]. 曹支敏,杜林,王秦虎,余仲東. 菌物學(xué)報. 2012(04)
[9]淺談楊樹造林技術(shù)措施與有害生物防治[J]. 張季,單珊. 黑龍江科技信息. 2012(16)
[10]利用熒光SSR標(biāo)記鑒別楊樹品種[J]. 馮錦霞,張川紅,鄭勇奇,孫榮喜. 林業(yè)科學(xué). 2011(06)
碩士論文
[1]楊樹耐干旱脅迫的生理機(jī)制及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 胡晨陽.武漢輕工大學(xué) 2016
[2]落葉松—楊柵銹菌生理小種分化與遺傳多樣性分析[D]. 洪瑩瑩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]落葉松—楊柵銹菌致病性及其遺傳多樣性分化研究[D]. 張浩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]落葉松—楊柵銹菌生理小種遺傳多樣性研究[D]. 杜林.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
[5]落葉松—楊柵銹菌生理小種鑒定[D]. 劉春梅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[6]中國小麥條銹菌主要流行小種DNA多態(tài)性分析[D]. 賈瑞祥.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號:3173326
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