【目的】通過蛋白質(zhì)組技術(shù)尋找抗線蟲油菜附加系EE和感病油菜接種根結(jié)線蟲后根系表達蛋白的差異,篩選出抗根結(jié)線蟲相關(guān)蛋白。【方法】以抗根結(jié)線蟲的油菜附加系EE和感根結(jié)線蟲的油菜根系為材料,通過蛋白質(zhì)組學雙向電泳技術(shù)和Image Master 5.0軟件分析篩選差異表達蛋白,經(jīng)MALDI-TOF-TOF/MS質(zhì)譜測序鑒定蛋白。另外,通過Gene Ontology, KEGG, WoLF PSORT和STRING生物信息學分析對鑒定蛋白進行功能分類、代謝途徑分析、亞細胞定位和蛋白互作分析�！窘Y(jié)果】Madora和油菜附加系EE分別有1184和1163個蛋白點。21個差異蛋白質(zhì)經(jīng)MALDI-TOF/TOF MS質(zhì)譜測序成功鑒定,其中一半以上定位于細胞外（52.38%）,其次為細胞質(zhì)（28.57%）,葉綠體（4.76%）,線粒體（4.76%）,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)（4.76%）,液泡（4.76%）。蛋白質(zhì)相互作用分析表明,與抗病相關(guān)的上調(diào)蛋白內(nèi)源性α-淀粉酶/枯草桿菌蛋白酶抑制劑與3-異丙基蘋果酸脫水酶大亞基,微管蛋白α-6鏈,表皮特異性分泌糖蛋白EP1,BnaC04g03560D和BnaC06g34210D 5... 

【文章來源】：西南農(nóng)業(yè)學報. 2020,33(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

植株根部的2-DE圖譜

為了明確差異表達蛋白參與的代謝途徑,KEGG用于確定它們屬于哪種類型的生化代謝途徑。結(jié)果顯示,共有7種蛋白質(zhì)參與代謝途徑,分別為XP_013676805.1和XP_013673398.1共同參與氧化磷酸化; XP_013748848.1參與檸檬酸循環(huán),半胱氨酸和蛋氨酸代謝,丙酮酸代謝,乙醛酸和二羧酸代謝,光合生物中的碳固定和碳代謝等多種代謝途徑; XP_013723181.1和XP_013722790.1共同參與了氨基酸的生物合成;另外,核苷二磷酸激酶1樣亞型X1(XP_013649391.1)參與了MAPK信號通路;微管蛋白α-6鏈(XP_013640865.1)參與了吞噬體。3 討 論

為了闡明差異表達蛋白的功能,通過GO功能分類系統(tǒng)鑒定了這些蛋白的生物過程,分子功能和細胞成分。 結(jié)果表明這些蛋白主要分為細胞成分中的細胞,細胞部分和細胞器,分子功能中的結(jié)合和催化作用,生物過程中的細胞過程,代謝過程和應(yīng)激反應(yīng)(圖2)。 WoLF PSORT預(yù)測了這些蛋白質(zhì)的亞細胞定位,其主要定位于細胞外(52.38 %),其次是細胞質(zhì)(28.57 %),葉綠體(4.76 %),線粒體(4.76 %),內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(4.76 %),液泡(4.76 %,圖3)。圖3 鑒定蛋白質(zhì)的亞細胞定位


本文編號：3094685