產(chǎn)酶溶桿菌中與全局性調(diào)控因子Clp蛋白互作的轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-07 12:16
產(chǎn)酶溶桿菌OH11(Lysobacter enzymogenes OH11)是本實(shí)驗(yàn)室從辣椒根際土壤中分離得到的一株具有廣闊應(yīng)用前景的重要生防細(xì)菌,其能產(chǎn)生多種胞外酶和次生抗菌代謝產(chǎn)物,對多種植物病原真菌、卵菌和革蘭氏陽性細(xì)菌均有較強(qiáng)的抗菌活性。Clp(cAMP-receptor like protein)是產(chǎn)酶溶桿菌中鑒定的一個轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白,屬于CRP(cyclic AMP receptor protein)蛋白家族。之前的研究發(fā)現(xiàn),將clp缺失突變以后其產(chǎn)HSAF的能力顯著降低,并且HSAF生物合成的關(guān)鍵基因pks/nrps的轉(zhuǎn)錄表達(dá)也顯著下降。本實(shí)驗(yàn)室研究發(fā)現(xiàn)Clp可以通過直接結(jié)合在pks/nrps基因的啟動子區(qū)來調(diào)控HSAF的生物合成。為深入揭示產(chǎn)酶溶桿菌中Clp調(diào)控HSAF生物合成的分子機(jī)制,本研究通過篩選與Clp蛋白互作的轉(zhuǎn)錄因子,從中發(fā)現(xiàn)調(diào)控HSAF生物合成的目標(biāo)轉(zhuǎn)錄因子。在此基礎(chǔ)上,研究該目標(biāo)轉(zhuǎn)錄因子是如何通過與Clp蛋白互作來調(diào)控HSAF生物合成的。在本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的OH11轉(zhuǎn)錄因子pTRG文庫的基礎(chǔ)上,本研究通過細(xì)菌雙雜交系統(tǒng)篩選到14個與Clp蛋白存在相互作用的轉(zhuǎn)錄...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1溶桿菌屬幾個代表種的細(xì)胞形態(tài)??Fig.?1-1?Cell?shapes?of?several?representing?species?of?Lysobactcr{^^:^,?2006).??
借助于質(zhì)譜(MS)和核磁并振技術(shù)(NMR),Yu等人鑒定了HSAF的化學(xué)結(jié)構(gòu)(Yu?et?al.,??2007)。該物質(zhì)山一個獨(dú)特的大環(huán)內(nèi)酰胺體系、一個四胺酸結(jié)構(gòu)單元和一個5,5,6-三環(huán)??骨架構(gòu)成(圖1_3),其結(jié)構(gòu)與dihydromaltophilin類似。??H?!??!?HSAF?/n-a?j??I?^5????H0?(Dihydromaltophilin)?|??一?—?一—?—?一一—一一?—?—?一一一?—?—?—?一一一?_?—?—?一?———??圖1-3產(chǎn)酶溶桿菌C3中熱穩(wěn)定抗真菌因子HSAF的化學(xué)結(jié)構(gòu)??Fig.?1-3?Chemical?structure?of?HSAF?identified?from?L.?enzymogenesCi?(Yu?et?al,?2007).??利用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)等手段,Yu等鑒定了HSAF生物合成基因簇及其生??物合成的關(guān)鍵基因PKS/NRPS(圖1-4A),并推導(dǎo)出其生物合成的可能途徑(圖1-4B)?(Yu??et?al.
1-6A),對革蘭氏陽性細(xì)菌有著很好的生防效果。得到產(chǎn)酶溶桿菌OH11全基因組后,??Zhang等借助分子生物學(xué)手段確定了產(chǎn)酶溶桿菌0H11中合成WAP-8294A2的基因簇及??其中的兩個關(guān)鍵基因:WAPS1和WAPS2(圖1-6B)。通過質(zhì)譜(MS)和核磁共振技術(shù)??(NMR)?Zhang等人分析確定了該物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與WAP-8294A2相同,并借助生物信息學(xué)??和分子生物學(xué)手段推測出了WAP-8294A2可能的生物合成途徑(圖l-6C)(Zhang?et?al.,??2011)。??6??
本文編號:3069077
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1溶桿菌屬幾個代表種的細(xì)胞形態(tài)??Fig.?1-1?Cell?shapes?of?several?representing?species?of?Lysobactcr{^^:^,?2006).??
借助于質(zhì)譜(MS)和核磁并振技術(shù)(NMR),Yu等人鑒定了HSAF的化學(xué)結(jié)構(gòu)(Yu?et?al.,??2007)。該物質(zhì)山一個獨(dú)特的大環(huán)內(nèi)酰胺體系、一個四胺酸結(jié)構(gòu)單元和一個5,5,6-三環(huán)??骨架構(gòu)成(圖1_3),其結(jié)構(gòu)與dihydromaltophilin類似。??H?!??!?HSAF?/n-a?j??I?^5????H0?(Dihydromaltophilin)?|??一?—?一—?—?一一—一一?—?—?一一一?—?—?—?一一一?_?—?—?一?———??圖1-3產(chǎn)酶溶桿菌C3中熱穩(wěn)定抗真菌因子HSAF的化學(xué)結(jié)構(gòu)??Fig.?1-3?Chemical?structure?of?HSAF?identified?from?L.?enzymogenesCi?(Yu?et?al,?2007).??利用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)等手段,Yu等鑒定了HSAF生物合成基因簇及其生??物合成的關(guān)鍵基因PKS/NRPS(圖1-4A),并推導(dǎo)出其生物合成的可能途徑(圖1-4B)?(Yu??et?al.
1-6A),對革蘭氏陽性細(xì)菌有著很好的生防效果。得到產(chǎn)酶溶桿菌OH11全基因組后,??Zhang等借助分子生物學(xué)手段確定了產(chǎn)酶溶桿菌0H11中合成WAP-8294A2的基因簇及??其中的兩個關(guān)鍵基因:WAPS1和WAPS2(圖1-6B)。通過質(zhì)譜(MS)和核磁共振技術(shù)??(NMR)?Zhang等人分析確定了該物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與WAP-8294A2相同,并借助生物信息學(xué)??和分子生物學(xué)手段推測出了WAP-8294A2可能的生物合成途徑(圖l-6C)(Zhang?et?al.,??2011)。??6??
本文編號:3069077
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