為避免我國有限北極狐種群遺傳多樣性的流失,推動我國圈養(yǎng)小種群的遺傳管理工作,本研究將利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記,以北極狐為例,根據(jù)后代遺傳質(zhì)量的預(yù)測判定最佳的配對方案,為圈養(yǎng)小種群遺傳多樣性保護(hù)工作提供參考。此外,雖然微衛(wèi)星標(biāo)記在近緣物種間具有一定通用性,可被跨物種使用,但測試其多態(tài)性的過程非常繁瑣。本研究亦將采用混合模板擴(kuò)增的方法,快速簡便地測試微衛(wèi)星位點的多態(tài)性,為開展群體遺傳學(xué)分析獲得有用的微衛(wèi)星標(biāo)記。主要結(jié)果如下:1.用10個四堿基微衛(wèi)星位點的引物,以10只北極狐的DNA為材料,分別隨機(jī)抽取2個、3個、5個、8個和全部10個樣品進(jìn)行等量混合作為模板,擴(kuò)增產(chǎn)物用全自動測序儀進(jìn)行電泳分型。所有等位基因的電泳信號峰都清晰可辨。與單一模板擴(kuò)增相比,混合模板擴(kuò)增時,所有位點的復(fù)等位基因都能穩(wěn)定地顯示出來,不同批次試驗之間的重現(xiàn)性達(dá)到100%。信號峰面積與等位基因頻率呈線性正相關(guān),由此可以推斷待測位點的基因頻率分布情況。最高信號峰與最低信號峰的面積的比值與混合樣品數(shù)呈正相關(guān),與多態(tài)信息含量呈負(fù)相關(guān),提示混合樣品的數(shù)量存在一定限度,到一定限度時低頻等位基因無法檢出。同時,通過這一關(guān)系,也可以推測位點... 

【文章來源】：東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－］部分樣本的總ＤＮＡ提取電泳圖??Ｍ：分子量標(biāo)記（ＤＬ５０００?Ｍａｒｋｅｒ）??

?東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文???３．２．２信號峰面積隨基因頻率的變化趨勢??為了確定信號峰面積與基因頻率的關(guān)系，根據(jù)２２０６、２１４０、２１６８三個位點的４組??混合擴(kuò)增產(chǎn)物（不包括ＭＴ１０擴(kuò)增產(chǎn)物）中各等位基因的基因頻率和信號峰面積，做二??者的回歸分析。結(jié)果顯示，信號峰面積與基因頻率呈線性關(guān)系（圖３－６），也就是說，在??］〇個樣品以內(nèi)，不同混合樣品中等位基因的頻率影響著擴(kuò)增產(chǎn)物的量，即頻率較高的等??位基因因有效模板數(shù)較多，可以表現(xiàn)為較大的信號峰面積，根據(jù)等位基因信號峰的面積??粗略地估算等位基因的頻率。但是，２２０６、２］４０、２１６８三個位點的Ｒ２值分別為０．５５９、??０．６８５、０．３３０，且Ｐ值均等于０．０００，說明不同的位點因為擴(kuò)增效率的差異，回歸方程的??參數(shù)也有所不同，如果把三個位點的數(shù)據(jù)合并起來，這種關(guān)系就變得非常微弱??（Ｒ２＝０．２８０，?Ｐ＝０．０００），即等位基因頻率的估算很難建立通用的模型。??１６０００??＊?２２０６??１－４０００?ｉ?＃?？??？?＊１１４０??１２０００?：?？?？?．：１６Ｓ??ｒｅ?＊?■．??＾?Ｉ?１００００?＃?＃?＊??）ｇ?＾?？?Ｘ’?？??＾?１?８０００?－Ｉ?＃?，?＼?．??＾?？?｜?？?’?匿?？?＊??５２?５，?＜５０００?１＊１??５５?＃?Ｉ?：，?！?＊?＿??４０００?＾?ｆ?？?＊?＊??！?．?？?＊?ｒ?．?？??０?０．２?０．４?０?６?０?８?１??基因頻率??Ａｌｌｄｅｆｉｅｃｐｅｎｃ＼－??圖３－６三個位點四組混合模板擴(kuò)增產(chǎn)物

？?？?２１－１０??Ｓ?？??？?１２０００?．?？２１６８??Ｓ．?１００００?Ｊ?？??＾?２?？、乂??妒?３，?ｓｏｏｏ?？?＇?？?？??１５?｜??姬；ｉ?６０００?？?？??＿?１．?Ｉ－－、．？．?？??＂５?４０００?？?？?？??Ｐ?，》?５??２０００?｜?ｌ?Ｉ???〇－?．?．??０?２?－Ｉ?６?Ｓ?１０??混合模板數(shù)??Ｎｍｎｂｅｉ?ｏｆ?ｕｉＬＸｅｄ?．ｓａｍｐｌｅｓ：??圖３－７三個位點四組混合模板擴(kuò)增產(chǎn)物的最高信號峰面積與混合模板數(shù)的關(guān)系??三個位點都顯示線性回歸關(guān)系（２２０６：?Ｒ２＝０．２２８，?Ｐ＝０．０１８：?２１４０：?Ｒ２＝０．２１２，?Ｐ＝０．０２４：?２】６８：??Ｒ２＝０．０２０，?Ｐ＝０．５２０）??Ｆｉｇ．?３－７?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ?ｓｉｇｎａｌ?ｐｅａｋ?ａｒｅａ?ａｎｄ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｏｆ?ｆｏｕｒ?ｇｒｏｕｐｓ??ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｔｅｍｐｌａｔｅ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｎ?ｔｈｒｅｅ?ｌｏｃｉ??Ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ?ｓｉｇｎａｌ?ｐｅａｋ?ａｒｅａｓ?ａｒｅ?ｌｉｎｅａｒｌｙ?ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ?ｗｉｔｈ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｍｉｘｅｄ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｔｈｅ?ｔｈｒｅｅ?ｌｏｃｉ??（２２０６：?Ｒ：＝０．２２８．?Ｐ＝０．０１８；?２１４０：?Ｒ２＝０．２１２，?Ｐ＝０．０２４；?２１６８：?Ｒ２＝０．０２０，?Ｐ＝０．５２０）??３．２．３．２最高峰與最低峰的面積

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本文編號：3048286