介體/非介體麥蚜對(duì)植物病毒響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-05 20:12
小麥Triticum aestivum L.是世界上主要的糧食作物之一,蟲害和病害是影響小麥產(chǎn)量重要因素。在我國(guó),麥二叉蚜Schizaphis graminum(Rondani)、麥長(zhǎng)管蚜Sitobion avenae(Fabricius)和禾谷縊管蚜Rhopalosiphum padi(Linnaeus)是影響小麥產(chǎn)量的重要害蟲,不僅可以通過(guò)直接取食造成小麥減產(chǎn),還可通過(guò)傳播植物病毒對(duì)小麥產(chǎn)量造成影響。由蚜蟲傳播的小麥黃矮。ú≡瓰榇篼滭S矮病毒Barley yellow dwarf virus,BYDV)和葉蟬傳播的小麥矮縮病(病原為小麥矮縮病毒W(wǎng)heat dwarf virus,WDV)是影響小麥產(chǎn)量的重要病毒病。在農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中,植物病毒與介體、非介體昆蟲同時(shí)發(fā)生,維持著復(fù)雜的互作關(guān)系。前人研究表明,植物病毒可直接或間接對(duì)介體/非介體昆蟲適合度造成有利或有害的影響。為了從轉(zhuǎn)錄組水平分析介體/非介體麥蚜對(duì)小麥病毒響應(yīng)機(jī)制,本研究對(duì)分別取食BYDV主流株系GAV、WDV及未感染的小麥植株的三種麥蚜進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。對(duì)得到的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制之后進(jìn)行組裝、功能注釋及分析;通過(guò)處理組與...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物病毒與介體/非介體昆蟲互作
1.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其應(yīng)用
1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)
1.2.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在昆蟲上的應(yīng)用
1.3 麥蚜概述
1.4 大麥黃矮病毒及小麥矮縮病毒研究現(xiàn)狀
1.4.1 大麥黃矮病毒
1.4.2 小麥矮縮病毒
1.5 BYDV/WDV對(duì)麥蚜影響研究進(jìn)展
1.6 研究意義和主要內(nèi)容
第二章 基于高通量測(cè)序解析BYDV/WDV對(duì)麥蚜的影響
2.1 材料和方法
2.1.1 供試蟲源
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 小麥傳毒/無(wú)毒處理
2.1.4 RT-PCR檢測(cè)植株是否帶毒
2.1.5 昆蟲處理
2.1.6 蚜蟲RNA提取
2.1.7 RNA質(zhì)量控制
2.1.8 文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序組裝
2.1.9 生物信息學(xué)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 小麥葉片RNA提取及帶毒性檢測(cè)
2.2.2 蚜蟲RNA提取及質(zhì)量控制
2.2.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及組裝
2.2.4 三種麥蚜轉(zhuǎn)錄組序列功能注釋
2.3 結(jié)論與討論
第三章 BYDV/WDV影響下蚜蟲差異表達(dá)基因分析及驗(yàn)證
3.1 材料和方法
3.1.1 試劑與儀器
3.1.2 差異表達(dá)基因篩選
3.1.3 差異表達(dá)基因的驗(yàn)證
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 麥二叉蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.2 麥長(zhǎng)管蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.3 禾谷縊管蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.4 差異表達(dá)基因驗(yàn)證
3.3 結(jié)論與討論
第四章 STAT5B和 CUL2 克隆及表達(dá)分析
4.1 材料和方法
4.1.1 供試蟲源
4.1.2 儀器及試劑
4.1.3 STAT5B和 CUL2 克隆
4.1.4 序列分析
4.1.5 STAT5B和 CUL2 取食BYDV/WDV感染的小麥后基因表達(dá)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 STAT5B和 CUL2 基因的克隆與序列分析
4.2.2 STAT5B和 CUL2 多序列比對(duì)及進(jìn)化分析
4.2.3 BYDV/WDV侵染對(duì)RpSTAT5B和 SaCUL2 表達(dá)量影響
4.3 結(jié)論與討論
第五章 結(jié)論與研究展望
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
5.3 問(wèn)題與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙粉虱取食感染TYLCV番茄對(duì)其解毒酶和保護(hù)酶活性的影響[J]. 曹增,王金娜,張友軍,吳青君,謝文,王少麗. 植物保護(hù). 2015(06)
[2]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選介體異沙葉蟬中與小麥矮縮病毒外殼蛋白互作的蛋白質(zhì)[J]. 趙藝澤,劉艷,王錫鋒. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(12)
[3]基于新一代測(cè)序技術(shù)的昆蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 張棋麟,袁明龍. 昆蟲學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]媒介昆蟲-病毒-植物互作對(duì)生物入侵的影響[J]. 欒軍波,劉樹生. 生物多樣性. 2010(06)
[5]我國(guó)小麥病毒病害發(fā)生現(xiàn)狀與趨勢(shì)分析[J]. 王錫鋒,劉艷,韓成貴,吳云峰,趙中華. 植物保護(hù). 2010(03)
[6]大麥黃矮病毒運(yùn)動(dòng)蛋白及其介導(dǎo)的小麥抗病性研究進(jìn)展[J]. 夏宗良,曹汝菲,王美平. 麥類作物學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]中國(guó)小麥黃矮病的發(fā)生及綜合防控研究進(jìn)展[J]. 張文斌,安德榮,任向輝. 麥類作物學(xué)報(bào). 2009(02)
[8]陜西韓城嚴(yán)重發(fā)生的小麥矮縮病病原鑒定與原因分析[J]. 王江飛,柳樹賓,吳蓓蕾,謝家建,王錫鋒. 植物保護(hù). 2008(02)
[9]小麥抗大麥黃矮病毒育種研究綜述[J]. 范紹強(qiáng),謝咸生,李峰,宋保林. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(01)
[10]小麥黃矮病抗性基因及其鑒定研究進(jìn)展[J]. 王黎明,劉樹兵,李興鋒,王洪剛. 麥類作物學(xué)報(bào). 2003(03)
碩士論文
[1]大麥黃矮病毒三種株系的特異性檢測(cè)及PAV株系的群體遺傳變異[D]. 劉雙清.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3019509
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物病毒與介體/非介體昆蟲互作
1.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其應(yīng)用
1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)
1.2.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在昆蟲上的應(yīng)用
1.3 麥蚜概述
1.4 大麥黃矮病毒及小麥矮縮病毒研究現(xiàn)狀
1.4.1 大麥黃矮病毒
1.4.2 小麥矮縮病毒
1.5 BYDV/WDV對(duì)麥蚜影響研究進(jìn)展
1.6 研究意義和主要內(nèi)容
第二章 基于高通量測(cè)序解析BYDV/WDV對(duì)麥蚜的影響
2.1 材料和方法
2.1.1 供試蟲源
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 小麥傳毒/無(wú)毒處理
2.1.4 RT-PCR檢測(cè)植株是否帶毒
2.1.5 昆蟲處理
2.1.6 蚜蟲RNA提取
2.1.7 RNA質(zhì)量控制
2.1.8 文庫(kù)構(gòu)建及測(cè)序組裝
2.1.9 生物信息學(xué)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 小麥葉片RNA提取及帶毒性檢測(cè)
2.2.2 蚜蟲RNA提取及質(zhì)量控制
2.2.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及組裝
2.2.4 三種麥蚜轉(zhuǎn)錄組序列功能注釋
2.3 結(jié)論與討論
第三章 BYDV/WDV影響下蚜蟲差異表達(dá)基因分析及驗(yàn)證
3.1 材料和方法
3.1.1 試劑與儀器
3.1.2 差異表達(dá)基因篩選
3.1.3 差異表達(dá)基因的驗(yàn)證
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 麥二叉蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.2 麥長(zhǎng)管蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.3 禾谷縊管蚜取食BYDV/WDV后差異表達(dá)基因分析
3.2.4 差異表達(dá)基因驗(yàn)證
3.3 結(jié)論與討論
第四章 STAT5B和 CUL2 克隆及表達(dá)分析
4.1 材料和方法
4.1.1 供試蟲源
4.1.2 儀器及試劑
4.1.3 STAT5B和 CUL2 克隆
4.1.4 序列分析
4.1.5 STAT5B和 CUL2 取食BYDV/WDV感染的小麥后基因表達(dá)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 STAT5B和 CUL2 基因的克隆與序列分析
4.2.2 STAT5B和 CUL2 多序列比對(duì)及進(jìn)化分析
4.2.3 BYDV/WDV侵染對(duì)RpSTAT5B和 SaCUL2 表達(dá)量影響
4.3 結(jié)論與討論
第五章 結(jié)論與研究展望
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
5.3 問(wèn)題與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙粉虱取食感染TYLCV番茄對(duì)其解毒酶和保護(hù)酶活性的影響[J]. 曹增,王金娜,張友軍,吳青君,謝文,王少麗. 植物保護(hù). 2015(06)
[2]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選介體異沙葉蟬中與小麥矮縮病毒外殼蛋白互作的蛋白質(zhì)[J]. 趙藝澤,劉艷,王錫鋒. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(12)
[3]基于新一代測(cè)序技術(shù)的昆蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 張棋麟,袁明龍. 昆蟲學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]媒介昆蟲-病毒-植物互作對(duì)生物入侵的影響[J]. 欒軍波,劉樹生. 生物多樣性. 2010(06)
[5]我國(guó)小麥病毒病害發(fā)生現(xiàn)狀與趨勢(shì)分析[J]. 王錫鋒,劉艷,韓成貴,吳云峰,趙中華. 植物保護(hù). 2010(03)
[6]大麥黃矮病毒運(yùn)動(dòng)蛋白及其介導(dǎo)的小麥抗病性研究進(jìn)展[J]. 夏宗良,曹汝菲,王美平. 麥類作物學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]中國(guó)小麥黃矮病的發(fā)生及綜合防控研究進(jìn)展[J]. 張文斌,安德榮,任向輝. 麥類作物學(xué)報(bào). 2009(02)
[8]陜西韓城嚴(yán)重發(fā)生的小麥矮縮病病原鑒定與原因分析[J]. 王江飛,柳樹賓,吳蓓蕾,謝家建,王錫鋒. 植物保護(hù). 2008(02)
[9]小麥抗大麥黃矮病毒育種研究綜述[J]. 范紹強(qiáng),謝咸生,李峰,宋保林. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(01)
[10]小麥黃矮病抗性基因及其鑒定研究進(jìn)展[J]. 王黎明,劉樹兵,李興鋒,王洪剛. 麥類作物學(xué)報(bào). 2003(03)
碩士論文
[1]大麥黃矮病毒三種株系的特異性檢測(cè)及PAV株系的群體遺傳變異[D]. 劉雙清.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3019509
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