甜菜壞死黃脈病毒侵染本生煙和大果甜菜的microRNA組群及致病機(jī)理研究
發(fā)布時(shí)間:2021-02-05 18:40
microRNA在植物生長(zhǎng)發(fā)育和抵御病原物侵染的過程中發(fā)揮著重要的作用,其表達(dá)受植物病毒侵染的影響。對(duì)microRNA表達(dá)譜的分析可以為病原物致病機(jī)理的研究提供新的見解。甜菜壞死黃脈病毒(Beetnecrotic yellow vein virus,BNYVV)是甜菜生產(chǎn)上的毀滅性病害--甜菜叢根病的病原,現(xiàn)已廣泛存在于世界各甜菜產(chǎn)區(qū),造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。該多分體病毒由4-5條+ssRNA組成,其不同組合在同一寄主植物上或者同一組合在不同寄主植物上致病性不盡相同,致病機(jī)理仍不清楚。本論文在已有的研究基礎(chǔ)上,從microRNA組學(xué)的角度切入,對(duì)BNYVV侵染本生煙和大果甜菜的致病原因進(jìn)行了研究。結(jié)果如下:①被BNYVV侵染的本生煙表現(xiàn)出矮化卷葉、根和花器官發(fā)育缺陷等癥狀,本研究通過microRNA表達(dá)譜芯片和RT-qPCR試驗(yàn)分析和驗(yàn)證了 miRNAs和靶標(biāo)基因的差異表達(dá),找到8條本生煙物種特異性miRNAs;發(fā)現(xiàn)129條miRNAs的差異表達(dá)與BNYVV的侵染相關(guān)。與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):GA、IAA和JA信號(hào)通路被抑制,乙烯和SA信號(hào)通路被激活;GA-GRF1-miR396通路...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:148 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物microRNA的研究進(jìn)展
1.2 植物病毒致病機(jī)理的研究進(jìn)展
1.3 甜菜壞死黃脈病毒的研究進(jìn)展
1.4 研究目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 試劑配制
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
第三章 BNYVV侵染本生煙的microRNA組群研究
3.1 花器官和根發(fā)育缺陷是BNYVV RNA4侵染引起的特異性癥狀
3.2 microRNA表達(dá)譜芯片分析
3.3 靶標(biāo)基因分析
3.4 激素信號(hào)系統(tǒng)中的miRNAs/靶標(biāo)基因在癥狀形成過程中的作用
3.5 miR398上調(diào)表達(dá)有利于本生煙抗BNYVV
3.6 小結(jié)與討論
第四章 乙烯信號(hào)通路在BNYVV致病過程中的作用
4.1 沉默EIN3減緩BNYVV積累,減輕卷葉癥狀
4.2 沉默ACO抑制BNYVV的積累
4.3 外用1-甲基環(huán)丙烯減緩BNYVV積累,減輕卷葉癥狀
4.4 小結(jié)與討論
第五章 BNYVV侵染對(duì)本生煙光合和抗病系統(tǒng)的影響
5.1 BNYVV侵染破壞了本生煙光合系統(tǒng)
5.2 BNYVV侵染誘導(dǎo)本生煙的抗病系統(tǒng)
5.3 小結(jié)與討論
第六章 BNYVV侵染大果甜菜的microRNA組群研究
6.1 大果甜菜的small RNA深度測(cè)序
6.2 大果甜菜microRNA組群的系統(tǒng)進(jìn)化分析
6.3 miRNAs的差異表達(dá)分析
6.4 大果甜菜差異表達(dá)miRNAs的可能靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)
6.5 BNYVV侵染本生煙和大果甜菜的microRNA組學(xué)比較分析
6.6 小結(jié)與討論
第七章 結(jié)論與展望
7.1 結(jié)論
7.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄Ⅰ BNYVV RNA3編碼p25蛋白致病性的研究
附錄Ⅱ 雙抗BNYVV與BBSV轉(zhuǎn)基因本生煙的創(chuàng)制
附錄Ⅲ 引物列表
附錄Ⅳ 大果甜菜物種特異性miRNA-5P/-3P序列
個(gè)人簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用小RNA深度測(cè)序和組裝技術(shù)鑒定紫藤花葉病病原[J]. 蘇秀,徐毅,陳莎,傅帥,錢亞娟,張立欽,周雪平. 植物病理學(xué)報(bào). 2015(01)
[2]煙草T-DNA插入位點(diǎn)側(cè)翼序列擴(kuò)增方法的篩選與優(yōu)化[J]. 劉慧,劉貫山,劉峰,龔達(dá)平,張雪峰,崔萌萌,路鐵剛,王元英. 中國煙草科學(xué). 2014(01)
[3]蕪菁花葉病毒對(duì)不結(jié)球白菜內(nèi)源激素含量及代謝相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平的影響[J]. 王淑敏,侯喜林,李英,曹學(xué)偉,張碩,王楓. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(05)
[4]UGPase和反義4CL基因?qū)D(zhuǎn)基因煙草纖維素和木質(zhì)素合成的調(diào)控[J]. 梁海泳,夏秀英,馮雪松. 植物生理學(xué)通訊. 2006(06)
[5]甜菜黑色焦枯病毒經(jīng)甘藍(lán)油壺菌傳播的研究[J]. 蔣軍喜,張景鳳,車少臣,羊大進(jìn),于嘉林,蔡祝南,劉儀. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1999(04)
[6]甜菜黑色焦枯型病毒病原、cDNA合成、光生物素標(biāo)記及探針制備[J]. 蔡祝南,陳定虎,吳茂森,崔星明,于嘉林,劉儀. 北京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1993(03)
[7]甜菜叢根病癥狀類型的研究[J]. 崔星明,劉儀,蔡祝南,武堅(jiān). 植物保護(hù). 1991(05)
博士論文
[1]甜菜壞死黃脈病毒侵染本生煙和大果甜菜的生物學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 范慧艷.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3019394
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:148 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 植物microRNA的研究進(jìn)展
1.2 植物病毒致病機(jī)理的研究進(jìn)展
1.3 甜菜壞死黃脈病毒的研究進(jìn)展
1.4 研究目的與意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 試劑配制
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
第三章 BNYVV侵染本生煙的microRNA組群研究
3.1 花器官和根發(fā)育缺陷是BNYVV RNA4侵染引起的特異性癥狀
3.2 microRNA表達(dá)譜芯片分析
3.3 靶標(biāo)基因分析
3.4 激素信號(hào)系統(tǒng)中的miRNAs/靶標(biāo)基因在癥狀形成過程中的作用
3.5 miR398上調(diào)表達(dá)有利于本生煙抗BNYVV
3.6 小結(jié)與討論
第四章 乙烯信號(hào)通路在BNYVV致病過程中的作用
4.1 沉默EIN3減緩BNYVV積累,減輕卷葉癥狀
4.2 沉默ACO抑制BNYVV的積累
4.3 外用1-甲基環(huán)丙烯減緩BNYVV積累,減輕卷葉癥狀
4.4 小結(jié)與討論
第五章 BNYVV侵染對(duì)本生煙光合和抗病系統(tǒng)的影響
5.1 BNYVV侵染破壞了本生煙光合系統(tǒng)
5.2 BNYVV侵染誘導(dǎo)本生煙的抗病系統(tǒng)
5.3 小結(jié)與討論
第六章 BNYVV侵染大果甜菜的microRNA組群研究
6.1 大果甜菜的small RNA深度測(cè)序
6.2 大果甜菜microRNA組群的系統(tǒng)進(jìn)化分析
6.3 miRNAs的差異表達(dá)分析
6.4 大果甜菜差異表達(dá)miRNAs的可能靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)
6.5 BNYVV侵染本生煙和大果甜菜的microRNA組學(xué)比較分析
6.6 小結(jié)與討論
第七章 結(jié)論與展望
7.1 結(jié)論
7.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄Ⅰ BNYVV RNA3編碼p25蛋白致病性的研究
附錄Ⅱ 雙抗BNYVV與BBSV轉(zhuǎn)基因本生煙的創(chuàng)制
附錄Ⅲ 引物列表
附錄Ⅳ 大果甜菜物種特異性miRNA-5P/-3P序列
個(gè)人簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用小RNA深度測(cè)序和組裝技術(shù)鑒定紫藤花葉病病原[J]. 蘇秀,徐毅,陳莎,傅帥,錢亞娟,張立欽,周雪平. 植物病理學(xué)報(bào). 2015(01)
[2]煙草T-DNA插入位點(diǎn)側(cè)翼序列擴(kuò)增方法的篩選與優(yōu)化[J]. 劉慧,劉貫山,劉峰,龔達(dá)平,張雪峰,崔萌萌,路鐵剛,王元英. 中國煙草科學(xué). 2014(01)
[3]蕪菁花葉病毒對(duì)不結(jié)球白菜內(nèi)源激素含量及代謝相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平的影響[J]. 王淑敏,侯喜林,李英,曹學(xué)偉,張碩,王楓. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(05)
[4]UGPase和反義4CL基因?qū)D(zhuǎn)基因煙草纖維素和木質(zhì)素合成的調(diào)控[J]. 梁海泳,夏秀英,馮雪松. 植物生理學(xué)通訊. 2006(06)
[5]甜菜黑色焦枯病毒經(jīng)甘藍(lán)油壺菌傳播的研究[J]. 蔣軍喜,張景鳳,車少臣,羊大進(jìn),于嘉林,蔡祝南,劉儀. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1999(04)
[6]甜菜黑色焦枯型病毒病原、cDNA合成、光生物素標(biāo)記及探針制備[J]. 蔡祝南,陳定虎,吳茂森,崔星明,于嘉林,劉儀. 北京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1993(03)
[7]甜菜叢根病癥狀類型的研究[J]. 崔星明,劉儀,蔡祝南,武堅(jiān). 植物保護(hù). 1991(05)
博士論文
[1]甜菜壞死黃脈病毒侵染本生煙和大果甜菜的生物學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 范慧艷.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3019394
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