目前,十字花科作物根腫病在國(guó)內(nèi)以及全世界廣泛蔓延,給十字花科作物生產(chǎn)帶來(lái)了嚴(yán)重的危害。根腫病的致病菌為蕓薹根腫菌,是十字花科作物根內(nèi)的專性寄生菌,通過(guò)侵染寄主的根毛,引起植物根部的異常增生而形成腫瘤。根腫菌存在高度遺傳分化和變異的特性,給根腫病的防治及抗病育種帶來(lái)了難題。本研究使用Williams鑒別系統(tǒng),對(duì)采集自國(guó)內(nèi)不同根腫病發(fā)病區(qū)域內(nèi)及1份韓國(guó)的共36份根腫病菌株材料進(jìn)行了生理小種種群鑒定;從NCBI公共數(shù)據(jù)庫(kù)中下載了根腫菌基因組全序列,利用SSRHunter軟件對(duì)其進(jìn)行SSR搜索及基因組SSR分布情況分析;通過(guò)SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)40份不同地區(qū)的根腫菌進(jìn)行基因組SSR引物的開(kāi)發(fā)及篩選,進(jìn)行了根腫菌遺傳多樣性的研究。主要研究結(jié)果如下:1.本試驗(yàn)采用Williams鑒別系統(tǒng)對(duì)從我國(guó)包括云南省、四川、重慶、安徽、遼寧、湖北省、陜西省、江蘇省以及韓國(guó)等地區(qū)采集到的36份根腫病根瘤材料進(jìn)行生理小種的鑒定,鑒定結(jié)果顯示主要致病菌群是蕓薹根腫菌4號(hào)生理小種,這與前人的研究結(jié)果相符。此外還鑒定出了2、7、11號(hào)生理小種。2.從根腫菌基因組中,共搜索到3174個(gè)SSR位點(diǎn),SSR的平均間隔距離為7... 

【文章來(lái)源】：沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

不同重復(fù)類型SSR的數(shù)目與SSR重復(fù)次數(shù)的關(guān)系

沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文菌的遺傳多樣性NA 提取結(jié)果基因組試劑盒對(duì)根腫菌 DNA 進(jìn)行提取，其 DNA 呈乳白色。經(jīng)對(duì) DNA 樣品進(jìn)行檢測(cè)。其結(jié)果顯示，所提 DNA 在凝膠電泳上整齊一致，無(wú)彌散單一無(wú)雜質(zhì)。表明所提 DNA 的純度高，完整本試驗(yàn)的后續(xù)需要。如圖 3-2，顯示了部分根腫菌 DNA 的凝膠

3 結(jié)果與分析3.3.4 SSR 引物的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果本研究中蕓薹根腫菌主要來(lái)自于中國(guó)的云南省、重慶市、四川省、湖北省、安徽省、江蘇省和遼寧省等 40 個(gè)菌種。用 32 對(duì) SSR 標(biāo)記進(jìn)行多態(tài)性分析，以區(qū)分不同的生理小種。從結(jié)果中可以看出，32 對(duì)引物在 40 種根腫菌 DNA 中均能擴(kuò)增出清晰明顯的條帶，并且取得良好的擴(kuò)增效果，多數(shù)樣品均表現(xiàn)出明顯的遺傳多態(tài)性，共擴(kuò)增出 98 條等位基因條帶。不同引物擴(kuò)增出可檢測(cè)到的條帶數(shù)不同，平均每對(duì)引物可檢測(cè)到 3.06 個(gè)等位基因，其中最多的為 5 個(gè)，最少的可檢測(cè)到 2 個(gè)。40 份病菌材料大多數(shù)都能擴(kuò)增出多態(tài)性位點(diǎn)，且擴(kuò)增出的條帶清晰穩(wěn)定，不同病根材料在不同引物下的擴(kuò)增結(jié)果存在顯著差異。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：2995962