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利用RSV的“抓帽”鑒定TYLCV的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)

發(fā)布時(shí)間:2021-01-13 12:20
  多分體負(fù)義RNA病毒(segmented negative-sense RNA viruses,sNSV)普遍采取"抓帽機(jī)制"來(lái)合成含帽子結(jié)構(gòu)的信使RNA(mRNA),即它們從寄主mRNA抓取一段10~20個(gè)堿基的帽子序列,然后以這段帽子序列為引物,轉(zhuǎn)錄自身基因組,生成在5端含一段"異源"帽子序列的病毒mRNA。水稻條紋病毒(Rice stripe tenuivirus,RSV)是一種重要的植物sNSV。近年,本實(shí)驗(yàn)室建立了一種高通量測(cè)序技術(shù),可以方便且低成本地測(cè)取RSV抓取的帽子序列。番茄黃化曲葉病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)是一種重要的雙生病毒。雖然已知TYLCV基因組含6個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF),但TYLCV基因組上的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(transcription start sites,TSS),目前還不清楚。本研究首先建立了一種方法,可以穩(wěn)定地獲得RSV與TYLCV共侵染的本氏煙(Nicotiana benthamiana)。接著,本研究取RSV和TYLCV共侵染,或RSV單獨(dú)侵染的本氏煙(陰性對(duì)照),以高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)取了RSV抓取的... 

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