色氨酸代謝與棉花抗黃萎病免疫調(diào)控
發(fā)布時(shí)間:2020-11-04 01:57
植物可以產(chǎn)生很多初生和次生代謝物以維持正常的生長(zhǎng)發(fā)育和抵御外界環(huán)境脅迫,而這些具有防御性的代謝物質(zhì)大多都來(lái)源于氨基酸合成和代謝路徑。雖然棉花含有豐富的次生代謝物質(zhì),但是這些物質(zhì)在棉花中的合成路徑以及在棉花生長(zhǎng)發(fā)育和防御反應(yīng)中的作用并不清楚。本研究前期通過(guò)擬南芥芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù),并結(jié)合棉花響應(yīng)黃萎病菌的RNA-Seq數(shù)據(jù)和抑制差減雜交文庫(kù),發(fā)現(xiàn)色氨酸合成路徑基因GbTSA1受多種真菌誘導(dǎo)表達(dá),推測(cè)該基因可能參與了植物廣譜響應(yīng)真菌侵染的抗病信號(hào)路徑或免疫調(diào)控。本研究基于以上結(jié)果對(duì)色氨酸合成路徑相關(guān)基因在棉花抗黃萎病中的功能進(jìn)行了解析,取得主要結(jié)果如下:1.GbTSA1表達(dá)模式分析組織表達(dá)模式分析顯示GbTSA1在棉花各個(gè)組織(根,莖稈,葉片,花瓣,0 d胚珠,5 d纖維)中均高量表達(dá);誘導(dǎo)表達(dá)模式分析顯示GbTSA1在棉花接種黃萎病菌初期表達(dá)顯著下降,在接種24 h后表達(dá)顯著上調(diào),同時(shí)該基因也受水楊酸處理誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá);亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示GbTSA1基因編碼的蛋白定位于葉綠體中。2.GbTSA1抑制表達(dá)材料增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病的抗性為了研究GbTSA1在棉花抗病中的功能,我們構(gòu)建了GbTSA1超量表達(dá)載體,RNAi抑制表達(dá)載體以及病毒誘導(dǎo)的基因沉默載體,并獲得超表達(dá)株系(OS-2,OS-3,OS-5,OS-8)和抑制表達(dá)株系si-1。研究發(fā)現(xiàn),抑制GbTSA1表達(dá)的轉(zhuǎn)基因株系si-1出現(xiàn)類病斑表型,同時(shí)伴隨SA合成路徑以及PR基因的顯著激活。利用病毒載體TRV:TSA1抑制GbTSA1表達(dá)后植株表現(xiàn)出與si-1相似的類病斑表型。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),抑制GbTSA1表達(dá)后增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性,而超量表達(dá)GbTSA1后對(duì)棉花黃萎病的抗性影響不大。3.GbTSA1抑制表達(dá)材料表型形成依賴于水楊酸合成和信號(hào)路徑為了研究si-1以及TRV:TSA1抑制表達(dá)植株類病斑的形成機(jī)制,本研究將水楊酸合成路徑關(guān)鍵基因GbICS1以及信號(hào)路徑關(guān)鍵基因GbNPR1分別與GbTSA1進(jìn)行共抑制,結(jié)果表明共抑制GbICS1和GbNPR1后可以恢復(fù)TRV:TSA1抑制表達(dá)植株引發(fā)的類病斑及抗病的表型,說(shuō)明水楊酸合成的組成型激活是導(dǎo)致TRV:TSA1抑制表達(dá)植株出現(xiàn)壞死的原因。4.吲哚激活棉花抗病免疫反應(yīng)和SA合成由于色氨酸合成路徑和水楊酸合成路徑共用前體底物分支酸,為了解析si-1以及TRV:TSA1抑制表達(dá)植株引發(fā)水楊酸含量升高的機(jī)制,我們對(duì)整個(gè)色氨酸合成路徑進(jìn)行了系統(tǒng)的研究,結(jié)果顯示類病斑表型的出現(xiàn)具有基因特異性,且不是由分支酸和色氨酸含量變化所致。此外,TRV:TSB1抑制表達(dá)植株也出現(xiàn)依賴于水楊酸信號(hào)路徑的類病斑表型。酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)表明GbTSB1可以和GbTSA1互作形成復(fù)合體催化色氨酸合成的最后一步反應(yīng);代謝組分析發(fā)現(xiàn)TRV:TSA1和TRV:TSB1抑制表達(dá)植株吲哚以及吲哚類代謝物顯著積累;轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn)吲哚可以激活抗病相關(guān)基因以及水楊酸合成相關(guān)基因GbSARD1,GbWRKY28等的表達(dá);雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)證明GbSARD1和GbWRKY28可以結(jié)合在GbICS1的啟動(dòng)子上,激活GbICS1的表達(dá);共抑制GbSARD1可以部分恢復(fù)TRV:TSA1和TRV:TSB1抑制表達(dá)植株類病斑表型;吲哚外施處理顯示吲哚可以增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性;以上結(jié)果表明,抑制GbTSA1和GbTSB1的表達(dá)能促進(jìn)其代謝底物吲哚以及吲哚類物質(zhì)在抑制表達(dá)植株中顯著積累,吲哚類物質(zhì)可以通過(guò)激活SA合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子GbSARD1以及GbWRKY28的表達(dá),最終導(dǎo)致TRV:TSA1和TRV:TSB1抑制表達(dá)植株中SA含量顯著升高,PR基因組成型激活,植株出現(xiàn)類病斑和抗病表型。5.GbTRP1抑制表達(dá)植株積累鄰氨基苯甲酸類物質(zhì)本研究還發(fā)現(xiàn)色氨酸合成路徑基因GbTRP1抑制表達(dá)植株以及GbTRP1-RNAi轉(zhuǎn)基因株系也會(huì)產(chǎn)生類病斑表型,但在TRV:TRP1抑制表達(dá)植株中SA含量顯著降低。代謝組分析發(fā)現(xiàn)鄰氨基苯甲酸及其衍生物在TRV:TRP1抑制表達(dá)植株中顯著積累。后續(xù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)一步探討TRV:TRP1抑制表達(dá)植株和GbTRP1-RNAi轉(zhuǎn)基因株系出現(xiàn)類病斑的機(jī)制以及鄰氨基苯甲酸與水楊酸(鄰羥基苯甲酸)在植物抗病反應(yīng)中的聯(lián)系。
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S435.621
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 前言
1.1 植物抗病機(jī)制
1.1.1 植物先天免疫系統(tǒng)
1.1.2 植物超敏反應(yīng)和類病斑突變體參與的抗病反應(yīng)
1.1.3 植物氨基酸代謝參與的抗病反應(yīng)
1.1.4 植物激素水楊酸介導(dǎo)的抗病反應(yīng)
1.2 棉花黃萎病及抗病機(jī)制解析
1.2.1 棉花黃萎病菌致病機(jī)制
1.2.2 棉花對(duì)黃萎病菌的組織結(jié)構(gòu)抗性
1.2.3 棉花中R基因介導(dǎo)的抗性及機(jī)制解析
1.2.4 激素信號(hào)路徑在棉花抗黃萎病菌中的作用
1.2.5 次生代謝物質(zhì)在棉花抗黃萎病菌中的作用
1.3 色氨酸合成和代謝路徑在植物抗病中的作用
1.3.1 色氨酸合成路徑研究進(jìn)展
1.3.2 色氨酸代謝路徑在抗病和抗蟲(chóng)反應(yīng)中的作用
1.4 研究問(wèn)題的由來(lái)與意義
2 材料方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料,載體和菌株
2.1.2 試劑
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 GbTSA1 基因的分離和克隆
2.2.2 載體構(gòu)建
2.2.3 棉花遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.4 棉花核酸提取和Southern雜交
2.2.5 反轉(zhuǎn)錄以及RT-qPCR基因表達(dá)量分析
2.2.6 黃萎病菌的活化和培養(yǎng)、接種、病指統(tǒng)計(jì)、恢復(fù)培養(yǎng)
2.2.7 水楊酸,色氨酸,吲哚處理棉花
2.2.8 病毒誘導(dǎo)的基因沉默(VIGS)
2.2.9 HPLC-MS法測(cè)量棉花內(nèi)源激素,色氨酸,以及分支酸含量
2.2.10 GC-MS法測(cè)量吲哚含量
2.2.11 GbTSA1 基因亞細(xì)胞定位
2.2.12 酵母雙雜交和雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)
2.2.13 吲哚處理轉(zhuǎn)錄組分析
3 結(jié)果分析
3.1 GbTSA1 基因的克隆及分子檢測(cè)
3.1.1 棉花中Gb TSA1 基因的分離和克隆
3.1.2 GbTSA1 基因蛋白亞細(xì)胞定位,組織表達(dá)模式和誘導(dǎo)表達(dá)模式
3.2 GbTSA1 轉(zhuǎn)基因材料的表型鑒定
3.2.1 GbTSA1 轉(zhuǎn)基因株系的獲得及表型鑒定
3.2.2 TRV:TSA1 抑制表達(dá)植株表型鑒定
3.3 GbTSA1 超表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株和抑制表達(dá)植株抗病性鑒定
3.4 GbTSA1-RNAi以及TRV:TSA1 植株類病斑形成依賴于SA合成和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)路徑
3.4.1 共沉默Gb ICS1或GbNPR1 抑制TRV:TSA1 植株類病斑表型
3.4.2 共沉默GbICS1或Gb NPR1 抑制TRV:TSA1 植株抗病表型
3.4.3 外施SA可以顯著增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性
3.5 類病斑表型在色氨酸合成路徑中具有基因特異性且不依賴于色氨酸
3.5.1 色氨酸合成路徑基因在棉花中的克隆和挖掘
3.5.2 TRV:Trp-synthesis related genes抑制表達(dá)植株的表型鑒定
3.5.3 外施色氨酸不能抑制TRV:TRP1,TRV:TSA1,TRV:TSB1 植株類病斑表型
3.6 TRV:TSB1 抑制表達(dá)植株類病斑表型依賴于SA信號(hào)路徑
3.7 外源施加吲哚可以增強(qiáng)植物抗病反應(yīng)以及SA信號(hào)路徑
3.7.1 TRV:TSA1和TRV:TSB1 抑制表達(dá)植株吲哚以及吲哚類衍生物含量測(cè)定..
3.7.2 外源施加吲哚增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性
3.7.3 吲哚處理轉(zhuǎn)錄組分析
3.7.4 吲哚激活SA合成相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子GbSARD以及GbWRKY28 的表達(dá)
3.7.5 外源施加吲哚不能抑制黃萎病菌的生長(zhǎng)
3.8 GbTRP1-RNAi和 TRV:TRP1 抑制表達(dá)植株增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌以及灰霉的抗性
3.9 TRV:TRP1 抑制表達(dá)植株中積累大量鄰氨基苯甲酸類物質(zhì)
3.10 TRV:Trp-synthesis related genes植株類病斑表型以及抗病表型形成機(jī)制總結(jié)
4 討論
4.1 VIGS技術(shù)在候選基因功能驗(yàn)證中的作用
4.2 色氨酸合成和代謝路徑與SA信號(hào)路徑之間的關(guān)系
4.3 植物類病斑突變體與SA信號(hào)路徑之間的關(guān)系
4.4 鄰氨基苯甲酸類物質(zhì)具有抑菌作用
4.5 吲哚類代謝物質(zhì)在棉花抗黃萎病中的作用
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 載體構(gòu)建
附錄2 DNA提取
附錄3 Sourthern雜交(地高辛標(biāo)記法)
附錄4 棉花RNA提取
附錄5 培養(yǎng)基配方
附錄6 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)
附錄7 原生質(zhì)體分離和轉(zhuǎn)化以及雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)
附表
攻讀學(xué)位期間已發(fā)表的論文和待發(fā)表的論文
申請(qǐng)專利
致謝
【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2869436
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S435.621
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
1 前言
1.1 植物抗病機(jī)制
1.1.1 植物先天免疫系統(tǒng)
1.1.2 植物超敏反應(yīng)和類病斑突變體參與的抗病反應(yīng)
1.1.3 植物氨基酸代謝參與的抗病反應(yīng)
1.1.4 植物激素水楊酸介導(dǎo)的抗病反應(yīng)
1.2 棉花黃萎病及抗病機(jī)制解析
1.2.1 棉花黃萎病菌致病機(jī)制
1.2.2 棉花對(duì)黃萎病菌的組織結(jié)構(gòu)抗性
1.2.3 棉花中R基因介導(dǎo)的抗性及機(jī)制解析
1.2.4 激素信號(hào)路徑在棉花抗黃萎病菌中的作用
1.2.5 次生代謝物質(zhì)在棉花抗黃萎病菌中的作用
1.3 色氨酸合成和代謝路徑在植物抗病中的作用
1.3.1 色氨酸合成路徑研究進(jìn)展
1.3.2 色氨酸代謝路徑在抗病和抗蟲(chóng)反應(yīng)中的作用
1.4 研究問(wèn)題的由來(lái)與意義
2 材料方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料,載體和菌株
2.1.2 試劑
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 GbTSA1 基因的分離和克隆
2.2.2 載體構(gòu)建
2.2.3 棉花遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.4 棉花核酸提取和Southern雜交
2.2.5 反轉(zhuǎn)錄以及RT-qPCR基因表達(dá)量分析
2.2.6 黃萎病菌的活化和培養(yǎng)、接種、病指統(tǒng)計(jì)、恢復(fù)培養(yǎng)
2.2.7 水楊酸,色氨酸,吲哚處理棉花
2.2.8 病毒誘導(dǎo)的基因沉默(VIGS)
2.2.9 HPLC-MS法測(cè)量棉花內(nèi)源激素,色氨酸,以及分支酸含量
2.2.10 GC-MS法測(cè)量吲哚含量
2.2.11 GbTSA1 基因亞細(xì)胞定位
2.2.12 酵母雙雜交和雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)
2.2.13 吲哚處理轉(zhuǎn)錄組分析
3 結(jié)果分析
3.1 GbTSA1 基因的克隆及分子檢測(cè)
3.1.1 棉花中Gb TSA1 基因的分離和克隆
3.1.2 GbTSA1 基因蛋白亞細(xì)胞定位,組織表達(dá)模式和誘導(dǎo)表達(dá)模式
3.2 GbTSA1 轉(zhuǎn)基因材料的表型鑒定
3.2.1 GbTSA1 轉(zhuǎn)基因株系的獲得及表型鑒定
3.2.2 TRV:TSA1 抑制表達(dá)植株表型鑒定
3.3 GbTSA1 超表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株和抑制表達(dá)植株抗病性鑒定
3.4 GbTSA1-RNAi以及TRV:TSA1 植株類病斑形成依賴于SA合成和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)路徑
3.4.1 共沉默Gb ICS1或GbNPR1 抑制TRV:TSA1 植株類病斑表型
3.4.2 共沉默GbICS1或Gb NPR1 抑制TRV:TSA1 植株抗病表型
3.4.3 外施SA可以顯著增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性
3.5 類病斑表型在色氨酸合成路徑中具有基因特異性且不依賴于色氨酸
3.5.1 色氨酸合成路徑基因在棉花中的克隆和挖掘
3.5.2 TRV:Trp-synthesis related genes抑制表達(dá)植株的表型鑒定
3.5.3 外施色氨酸不能抑制TRV:TRP1,TRV:TSA1,TRV:TSB1 植株類病斑表型
3.6 TRV:TSB1 抑制表達(dá)植株類病斑表型依賴于SA信號(hào)路徑
3.7 外源施加吲哚可以增強(qiáng)植物抗病反應(yīng)以及SA信號(hào)路徑
3.7.1 TRV:TSA1和TRV:TSB1 抑制表達(dá)植株吲哚以及吲哚類衍生物含量測(cè)定..
3.7.2 外源施加吲哚增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌的抗性
3.7.3 吲哚處理轉(zhuǎn)錄組分析
3.7.4 吲哚激活SA合成相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子GbSARD以及GbWRKY28 的表達(dá)
3.7.5 外源施加吲哚不能抑制黃萎病菌的生長(zhǎng)
3.8 GbTRP1-RNAi和 TRV:TRP1 抑制表達(dá)植株增強(qiáng)棉花對(duì)黃萎病菌以及灰霉的抗性
3.9 TRV:TRP1 抑制表達(dá)植株中積累大量鄰氨基苯甲酸類物質(zhì)
3.10 TRV:Trp-synthesis related genes植株類病斑表型以及抗病表型形成機(jī)制總結(jié)
4 討論
4.1 VIGS技術(shù)在候選基因功能驗(yàn)證中的作用
4.2 色氨酸合成和代謝路徑與SA信號(hào)路徑之間的關(guān)系
4.3 植物類病斑突變體與SA信號(hào)路徑之間的關(guān)系
4.4 鄰氨基苯甲酸類物質(zhì)具有抑菌作用
4.5 吲哚類代謝物質(zhì)在棉花抗黃萎病中的作用
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 載體構(gòu)建
附錄2 DNA提取
附錄3 Sourthern雜交(地高辛標(biāo)記法)
附錄4 棉花RNA提取
附錄5 培養(yǎng)基配方
附錄6 酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)
附錄7 原生質(zhì)體分離和轉(zhuǎn)化以及雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)
附表
攻讀學(xué)位期間已發(fā)表的論文和待發(fā)表的論文
申請(qǐng)專利
致謝
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2869436
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