中國(guó)凹距飛虱族DNA條形碼研究
【學(xué)位單位】:貴州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S433.3
【部分圖文】:
表 3-4 各數(shù)據(jù)組的序列堿基替換對(duì)統(tǒng)計(jì)ble 3-4 The sequence bases of each data group are substituted for statiii si sv R TT TC TA TG CC CA CG 群 387 36 37 0.97 145 29 25 2 55 9 1 1tal 387 35 37 0.95 145 29 25 2 55 9 0 1ii = Identical Pairs si = Transitionsal Pairs sv = Transversional Pairs R = Ts/Tv發(fā)育信號(hào)檢測(cè)P 距離與 R 值的關(guān)系分析 MEGA6.0 軟件對(duì)數(shù)據(jù)組的 P 距離與 R 值的關(guān)系進(jìn)行分析, 可知,數(shù)據(jù)組的 R 值隨 P 距離的增加而變化,其 R 值隨遺傳下降趨勢(shì),最終趨向于與橫坐標(biāo)平行。
圖 3-2 COI 堿基替換飽和性分析Fig. 3-2 Relationship between P-distance and Tv/Ts based on COI gene由以上可知,COI 飽和性分析的結(jié)果顯示轉(zhuǎn)換和顛換的趨勢(shì)線為一條直上升趨勢(shì),說(shuō)明轉(zhuǎn)換和顛換均不存在飽和的趨勢(shì),因此能夠提供進(jìn)化信 分子系統(tǒng)樹基于 NJ 法應(yīng)用 Kimura 2-parameter 模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖 3-3。結(jié)果顯示:高原飛虱屬 Paranectopia 位于系統(tǒng)樹的最基部構(gòu)成單系群,形成的一支互為姐妹群;之后其余屬分為數(shù)支。按分出的先后順序?yàn)椋簩?Carinofrons、匙頂飛虱屬 Tropidocephala、((羅里飛虱屬 Laurian虱屬 Epeurysa)+異脈飛虱屬 Specinervures)、((圓翅飛虱屬 Yuanc虱屬 Bambusiphaga)+角顏飛虱屬 Arcofaciella)、((葉角飛虱屬 Puro脊飛虱屬 Neocarinodelphax)+隆脊飛虱屬 Carinodelphax)、小頭飛
圖 3-3 基于 COI 構(gòu)建凹距飛虱族系統(tǒng)發(fā)育樹(NJ 法)Fig. 3-3 Phylogenetic tree based on COI for Tropidocephalini (NJ method)3 小結(jié)與討論小結(jié):本研究基于 COI 基因序列,以長(zhǎng)突飛虱屬 Stenocranus 作為外群,對(duì)凹距飛虱族 18 個(gè)屬的屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,凹距飛虱族的原始類群為高原飛虱屬 Paranectopia;羅里飛虱屬 Lauriana 和短頭飛虱屬Epeurysa、竹飛虱屬 Bambusiphaga 和圓翅飛虱屬 Yuanchia、葉角飛虱屬 Purohita和新隆脊飛虱屬 Neocarinodelphax、馬來(lái)飛虱屬 Malaxa 和簇角飛虱屬 Belocera、突額飛虱屬 Arcifrons 和類簇角飛虱屬 Parabelocera 互為姐妹群,表明他們之間的親緣關(guān)系較近。COI 基因序列的 R 值為 0.97;P 距離與 R 值的關(guān)系分析顯示:R 值隨遺傳
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2868543
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