MiR394在植物與灰霉菌互作中的生物學功能及調控機制研究
發(fā)布時間:2020-09-29 18:26
植物在生長發(fā)育過程中很容易受到周圍環(huán)境的影響,由病原體灰霉菌(Botrytis cinerea)引起的番茄灰霉病是危害番茄生產的主要因素之一。根據課題組前期的研究結果顯示,miR394響應灰霉菌的感染。本研究利用過表達miR394的轉基因擬南芥和lcr突變株擬南芥,進一步明確了miR394在番茄防御灰霉病過程中的功能及其作用機制,主要研究結果如下:1、用灰霉菌處理Micro-Tom番茄,在不同時間點進行樣品采集,qRT-PCR結果表明,miR394參與植物對灰霉菌的防御。2、為了進一步確定miR394的功能作用,我們將過表達miR394的轉基因及其靶基因lcr的突變株擬南芥接種灰霉菌。發(fā)現與野生型相比,過表達miR394的轉基因擬南芥和lcr突變株擬南芥的葉片表面均出現較大的病變面積,且綜合臺盼藍染色的結果,說明擬南芥miR394通過直接作用于靶基因LCR作為擬南芥防御灰霉菌感染的負調節(jié)劑,使得植物對灰霉菌更加敏感。3、轉基因株系中miR394的過表達對其它脅迫相關miRNAs產生影響。利用qPCR檢測結果顯示除miR159以外,miR156、miR168以及miR172的表達水平在各個株系中均上調,表明這些miRNAs與miR394存在潛在聯(lián)系。4、對mi RNA合成和作用過程中的7個相關蛋白基因在轉基因株系中進行表達檢測,其中DDL、DRB4和AGO1共3個基因的表達上調,說明miR394的過表達對這些基因具有正反饋作用。5、植物中的兩條激素調節(jié)途徑:茉莉酸及水楊酸途徑中的4個關鍵基因在過表達miR394的轉基因植株和lcr突變株中被檢測,高水平的miR394或低水平的LCR均導致PDF1.2(Plant Defensin1.2)和PR4(Pathogenesis-Related protein 4)表達量的增加,這可能也作為一種潛在的影響因素,使得miR394/LCR對灰霉菌感染的敏感性增強。6、已有相關報道揭示mi R394參與植物的非生物脅迫應答,我們對此進行了驗證,并得到一致的結果,說明mi R394的過表達使得擬南芥耐旱而不耐鹽。本研究探討了miR394/LCR在擬南芥抵抗灰霉菌中的作用,明確了miR394/LCR在應答灰霉菌時可能協(xié)同JA/SA途徑的相關基因。這些研究將為進一步明確miR394/LCR的調控機制和灰霉菌的分子防治提供技術依據。
【學位單位】:浙江理工大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S436.412
【部分圖文】:
堿基切割以產生pre-miRNA發(fā)夾結構,并再次剪切生成miRNA/miRNA*雙鏈,DCL1 催化的第一次切割雖然遵循“l(fā)oop-last”,但 miR319 獨特且精密的“l(fā)oop-first”加工模式存在于天然的小立碗蘚,水稻和擬南芥,甚至基于擬南芥 miR319的骨架來構建人工 miRNA(artificial MIRNA, aMIRNA)[18, 21, 41-43]。大多數植物 pri-miRNA 發(fā)夾產生單個 miRNA / miRNA*雙鏈體,但是一些基因座(包括MIR159 和 MIR319)始終產生多個雙鏈體[21,41,42,44]。植物 miRNA 的生物合成在細胞核內完成,在特定的亞核區(qū)域被稱為 D-body[45-47]。最初的 miRNA / miRNA*雙鏈體的 3' 核苷酸需要被核 HEN1 蛋白質 2' -O-甲基化[48-50]。2'-O-甲基化標記可以防止 miRNA 免受 3' 末端尿苷化和 3'→5' 外切核酸降解[49, 51]。在植物中,HASTY作為一種動物Exportin-5轉運蛋白的同系物,被認為是將miRNA/miRNA*雙鏈體運輸到細胞質 AGO 蛋白中,其中 AGO1 是植物 miRNA 的主要載體[52,53]。在擬南芥中 AGO1 蛋白可使用固有的 RNaseH-like 活性來切割(“slicer”)靶標 mRNA,其它大多數植物 AGOs 也可能擁有切片功能[21, 54, 55]。
第三章 實驗結果1. MiR394 在番茄和擬南芥中的組織特異性表達1.1 MiR394 及其初級轉錄本在番茄不同組織中的表達我們希望對 miR394 的功能進行更深層次的分析,但是發(fā)現 miR394 在番中有兩種存在形式 miR394-5p 和 miR394-3p(miR394*),因此我們對 miR394 組織表達特異性進行了研究。使用 qPCR 在以下四種番茄組織:莖、葉、花和實中檢測了兩種成熟 miRNAs 及其初級轉錄本的表達水平。結果顯示兩miR394 及 pri-miR394 均存在于以上四種組織中,但在各個組織中表達水平有不同。Pri-miR394 的水平在果實中最低,莖中最高,葉和花中的表達水平居中(2A)。MiR394-5p 在花中最低,莖中最高,葉和果實居中(圖 2B)。而 miR393p 的水平在莖中最低,花中最高,在葉和果實居中(圖 2B)。與 miR394-5p 比,除了花以外,在番茄另外三個組織中 miR394-3p 的表達水平顯著降低(2B)。因此,綜合以上結果我們選擇了 miR394-5p 用于后續(xù)的實驗研究中。
4-5p 和 miR394-3p 在 4 個擬南芥組織中ion levels in 4 Arabidopsis tissues betwe3p的侵染錄本在接種灰霉菌的番茄葉片中 在接種了灰霉菌的番茄葉片中的應 miR394 及其初級轉錄本 pri-miR的番茄中,miR394 的表達沒有顯番茄品種 Micro-Tom 葉片中,不同之前在接種灰霉菌的番茄品種金棚結果[94]。其中 pri-miR394 除在接其它時間點都有所下降(圖 3C)。達量確實有所變化,說明 miR394
本文編號:2830093
【學位單位】:浙江理工大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S436.412
【部分圖文】:
堿基切割以產生pre-miRNA發(fā)夾結構,并再次剪切生成miRNA/miRNA*雙鏈,DCL1 催化的第一次切割雖然遵循“l(fā)oop-last”,但 miR319 獨特且精密的“l(fā)oop-first”加工模式存在于天然的小立碗蘚,水稻和擬南芥,甚至基于擬南芥 miR319的骨架來構建人工 miRNA(artificial MIRNA, aMIRNA)[18, 21, 41-43]。大多數植物 pri-miRNA 發(fā)夾產生單個 miRNA / miRNA*雙鏈體,但是一些基因座(包括MIR159 和 MIR319)始終產生多個雙鏈體[21,41,42,44]。植物 miRNA 的生物合成在細胞核內完成,在特定的亞核區(qū)域被稱為 D-body[45-47]。最初的 miRNA / miRNA*雙鏈體的 3' 核苷酸需要被核 HEN1 蛋白質 2' -O-甲基化[48-50]。2'-O-甲基化標記可以防止 miRNA 免受 3' 末端尿苷化和 3'→5' 外切核酸降解[49, 51]。在植物中,HASTY作為一種動物Exportin-5轉運蛋白的同系物,被認為是將miRNA/miRNA*雙鏈體運輸到細胞質 AGO 蛋白中,其中 AGO1 是植物 miRNA 的主要載體[52,53]。在擬南芥中 AGO1 蛋白可使用固有的 RNaseH-like 活性來切割(“slicer”)靶標 mRNA,其它大多數植物 AGOs 也可能擁有切片功能[21, 54, 55]。
第三章 實驗結果1. MiR394 在番茄和擬南芥中的組織特異性表達1.1 MiR394 及其初級轉錄本在番茄不同組織中的表達我們希望對 miR394 的功能進行更深層次的分析,但是發(fā)現 miR394 在番中有兩種存在形式 miR394-5p 和 miR394-3p(miR394*),因此我們對 miR394 組織表達特異性進行了研究。使用 qPCR 在以下四種番茄組織:莖、葉、花和實中檢測了兩種成熟 miRNAs 及其初級轉錄本的表達水平。結果顯示兩miR394 及 pri-miR394 均存在于以上四種組織中,但在各個組織中表達水平有不同。Pri-miR394 的水平在果實中最低,莖中最高,葉和花中的表達水平居中(2A)。MiR394-5p 在花中最低,莖中最高,葉和果實居中(圖 2B)。而 miR393p 的水平在莖中最低,花中最高,在葉和果實居中(圖 2B)。與 miR394-5p 比,除了花以外,在番茄另外三個組織中 miR394-3p 的表達水平顯著降低(2B)。因此,綜合以上結果我們選擇了 miR394-5p 用于后續(xù)的實驗研究中。
4-5p 和 miR394-3p 在 4 個擬南芥組織中ion levels in 4 Arabidopsis tissues betwe3p的侵染錄本在接種灰霉菌的番茄葉片中 在接種了灰霉菌的番茄葉片中的應 miR394 及其初級轉錄本 pri-miR的番茄中,miR394 的表達沒有顯番茄品種 Micro-Tom 葉片中,不同之前在接種灰霉菌的番茄品種金棚結果[94]。其中 pri-miR394 除在接其它時間點都有所下降(圖 3C)。達量確實有所變化,說明 miR394
【參考文獻】
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3 趙紅霞;茍萍;;灰葡萄孢菌致病機理研究進展[J];生物技術;2014年01期
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本文編號:2830093
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