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獼猴桃應(yīng)答潰瘍病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組研究及抗性相關(guān)基因挖掘

發(fā)布時(shí)間:2020-08-19 12:07
【摘要】:獼猴桃因其具有豐富的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)被譽(yù)為“水果之王”。近年來(lái),隨著獼猴桃栽培面積的不斷增長(zhǎng),其病害情況也日益嚴(yán)重,尤其是獼猴桃細(xì)菌性潰瘍病的發(fā)生,該病害致病性強(qiáng)、傳播速度快,能夠在短時(shí)間內(nèi)造成植株的大面積死亡,嚴(yán)重影響了世界獼猴桃產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。為了闡明獼猴桃應(yīng)答潰瘍病菌侵染的分子機(jī)制,本研究選取國(guó)家農(nóng)作物種質(zhì)資源平臺(tái)獼猴桃子平臺(tái)中29個(gè)獼猴桃品種(系),對(duì)其抗病性進(jìn)行評(píng)價(jià);選擇其中高抗品種‘華特’和高感品種‘紅陽(yáng)’作為材料,利用RNA-Seq測(cè)序技術(shù),分析了獼猴桃在受到病原菌Pseudomonas syringae pv.actinidiae(Psa)侵染后不同時(shí)間點(diǎn)的基因表達(dá)變化,篩選出了4類與抗病相關(guān)的基因;并在此基礎(chǔ)上,詳細(xì)研究了植物病程相關(guān)蛋白1(PR-1)的結(jié)構(gòu)和功能。主要研究結(jié)果如下:1.獼猴桃品種(系)潰瘍病抗性鑒定及不同評(píng)價(jià)指標(biāo)的相關(guān)性分析(1)對(duì)29個(gè)不同獼猴桃品種(系)離體枝條接種Psa,逐日觀察癥狀發(fā)現(xiàn):接種6天后,部分品種(系)開始發(fā)病,接種點(diǎn)變紅褐色,有少量或者溢出乳白色黏液,隨著接種時(shí)間的延長(zhǎng),病斑直徑也越來(lái)越大。在接種21天后,計(jì)算枝條的病情指數(shù),對(duì)其抗病性進(jìn)行評(píng)價(jià),結(jié)果發(fā)現(xiàn),C2-72、C紅陽(yáng)表現(xiàn)為高感(HS),D6-65、C1-74、CHort16-A、D14-57、D6-20表現(xiàn)為感病(S),C2-43、C金桃、C金艷、D優(yōu)系-52表現(xiàn)為耐病(T),D徐香、D海沃德、D布魯諾、A紅寶石星、ASE1-5、AP1-2、AP4-2、EN4-32、AP6-1、AP3-3、A11-17、EN4-25、EN14-9、D金魁和D陶木里表現(xiàn)為抗病(R),EN12-16、EN12-31和E華特表現(xiàn)為高抗(HR),以上結(jié)果表明不同獼猴桃品種(系)抗病性存在顯著性差異,其中中華獼猴桃抗病性最差,美味獼猴桃抗病性次之,軟棗和毛花獼猴桃抗病性最高。(2)對(duì)離體枝條病斑長(zhǎng)度和病情指數(shù)進(jìn)行了相關(guān)性分析,結(jié)果表明兩者呈現(xiàn)極顯著性正相關(guān),相關(guān)系數(shù)r為0.957,病情指數(shù)越高,病斑長(zhǎng)度越大,說(shuō)明病斑長(zhǎng)度也可以作為獼猴桃潰瘍病病害鑒定的重要指標(biāo)。(3)用流式細(xì)胞儀對(duì)29個(gè)獼猴桃品種(系)進(jìn)行倍性檢測(cè),結(jié)果表明4倍體中華類型品種抗病性要強(qiáng)于2倍體中華類型品種,而在種間,倍性對(duì)抗性的影響不大。2.高抗品種‘華特’和高感品種‘紅陽(yáng)’在受到Psa侵染后的轉(zhuǎn)錄組分析(1)從‘華特’和‘紅陽(yáng)’不同時(shí)間點(diǎn)差異表達(dá)基因分析可以看出,在受到Psa侵染后,抗病品種‘華特’能夠迅速的響應(yīng)Psa的侵染,推測(cè)獼猴桃對(duì)潰瘍病菌的防御反應(yīng)可能集中在侵染12h前的早期反應(yīng),早期的差異表達(dá)基因可能在抗病反應(yīng)中起到更重要的防御作用。(2)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果表明在‘華特’和‘紅陽(yáng)’中有5個(gè)模塊的基因表達(dá)存在著顯著的差異。對(duì)這5個(gè)模塊中的基因進(jìn)行了KEGG富集分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),MEgreenyellow模塊和MEyellow模塊的差異表達(dá)基因主要富集在植物-病原相互作用(Plant-pathogen interaction)、內(nèi)吞作用(Endocytosis),在MEblack模塊的差異表達(dá)基因主要富集在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白加工(Protein processing in endoplasmic reticulum)、植物-病原相互作用(Plant-pathogen interaction),這些可能都是與獼猴桃響應(yīng)抗病反應(yīng)密切相關(guān)的途徑。3.以高抗品種‘華特’和高感品種‘紅陽(yáng)’為材料,分別克隆其病程相關(guān)蛋白1基因的cDNA序列,命名為htPR-1和hyPR-1。(1)htPR-1和hyPR-1基因全長(zhǎng)都是522bp,不含內(nèi)含子,不同的是htPR-1和hyPR-1 cDNA序列有12個(gè)位點(diǎn)堿基發(fā)生了突變,導(dǎo)致其中編碼的7個(gè)氨基酸不同,即發(fā)生了非同義突變。但是最終都是編碼了173個(gè)氨基酸,這說(shuō)明堿基位點(diǎn)的突變并沒有導(dǎo)致翻譯的提前終止。(2)生物信息學(xué)分析表明,與擬南芥及煙草PR-1相似,htPR-1和hyPR-1都具有SCP-PR-1-like保守結(jié)構(gòu)域,N-端都具有一個(gè)26個(gè)氨基酸序列的信號(hào)肽,亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析其是一種分泌蛋白。不同的是,htPR-1二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)具有5個(gè)α-螺旋結(jié)構(gòu)和3個(gè)β-折疊結(jié)構(gòu),hyPR-1二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)則具有5個(gè)α-螺旋結(jié)構(gòu)和4個(gè)β-折疊結(jié)構(gòu),這表明htPR-1和hyPR-1基因就是PR-1在獼猴桃中的同源基因。(3)通過(guò)多序列比對(duì)和構(gòu)建進(jìn)化樹分析,發(fā)現(xiàn)htPR-1和hyPR-1基因與多種植物的PR-1基因具有很高的同源性,其中與番茄、馬鈴薯同源性較高,親緣關(guān)系較近,聚為一類,而與玉米的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。(4)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析結(jié)果顯示,在受到病原菌Psa侵染后,PR-1基因在‘華特’和‘紅陽(yáng)’中都被顯著誘導(dǎo),但是其在‘華特’中的表達(dá)量要顯著高于‘紅陽(yáng)’(5倍),這表明PR-1基因可能參與了獼猴桃響應(yīng)Psa侵染的免疫應(yīng)答反應(yīng)。(5)亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,pCAM35s-PR-1-GFP融合蛋白的綠色熒光主要分布在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜上。(6)為了研究htPR-1和hyPR-1基因的功能,分別構(gòu)建過(guò)表達(dá)載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法將htPR-1和hyPR-1基因瞬時(shí)表達(dá)到本氏煙草中,在接種Psa第14天時(shí)觀察癥狀,結(jié)果發(fā)現(xiàn)htPR-1和hyPR-1基因都可以增強(qiáng)煙草對(duì)Psa的抗性。
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S436.634.1
【圖文】:

感染細(xì)菌,癥狀,嫩枝,褐色斑


圖 1.1 紅陽(yáng)獼猴桃感染細(xì)菌性潰瘍病的癥狀(李黎等 2013)A-C:主干產(chǎn)生乳白色黏液;D:木質(zhì)部變紅褐色;E:葉片出現(xiàn)褐色斑點(diǎn),病斑周圍伴有黃色暈圈;F-G:花蕾、幼芽和嫩枝感病后枯萎。Fig.1.1 The symptoms of bacterial canker disease infection in Hongyang kiwifruitA-C: The trunk overflows milky white mucus; D: Reddening of the xylem; E: Leaf with brown spots surroundedby yellow halos; F-G: Buds, shoots and twigs wilting.

模型圖,植物,效應(yīng)因子,模型


物也進(jìn)化出了相應(yīng)的抗性蛋白(R 蛋白)直接或者間接的識(shí)別病原效應(yīng)因?qū)е参锂a(chǎn)生 ETI 反應(yīng),效應(yīng)因子被 R 蛋白識(shí)別后,又可通過(guò)自我修飾作用釋放出新的效應(yīng)因子繼續(xù)引發(fā)新的 ETS 反應(yīng),隨后植物也繼續(xù)進(jìn)化出新的白來(lái)特異性識(shí)別效應(yīng)因子,引起新的 ETI 反應(yīng)(圖 1.2)。

通路圖,免疫反應(yīng),抗性相關(guān)基因,轉(zhuǎn)錄組


獼猴桃應(yīng)答潰瘍病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組研究及抗性相關(guān)基因挖掘、激活 Ca2+離子通道、促進(jìn)蛋白質(zhì)的翻譯和次生代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生等,植物產(chǎn)生免疫應(yīng)答反應(yīng)(圖 1.3)。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前3條

1 劉瑩;番茄丁香假單胞菌抗病基因Pto互作蛋白功能分析[D];合肥工業(yè)大學(xué);2017年

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本文編號(hào):2797069

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