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黑龍江大豆品種灰斑病7號(hào)小種抗性SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-18 10:19
【摘要】:大豆灰斑病能夠發(fā)生在大豆的不同部位和不同的生長(zhǎng)時(shí)期,嚴(yán)重影響著大豆的產(chǎn)量和品質(zhì)。大豆灰斑病的生理小種分化十分明顯,其中毒力較強(qiáng)的7號(hào)生理小種為黑龍江大豆生產(chǎn)上的優(yōu)勢(shì)生理小種之一,近幾年其出現(xiàn)頻率呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。發(fā)掘大豆灰斑病7號(hào)生理小種的抗性?xún)?yōu)異等位變異和載體材料可為高效培育抗病品種提供理論基礎(chǔ)。本研究以202份黑龍江栽培大豆為材料,接種大豆灰斑病7號(hào)生理小種并進(jìn)行抗病性鑒定。利用187對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)202份大豆品種進(jìn)行全基因組掃描,通過(guò)軟件PowerMarker version 3.25來(lái)計(jì)算SSR位點(diǎn)的等位片段數(shù)、每個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性信息量(PIC)和群體的平均基因多樣性指數(shù)(He);利用Structure 2.2軟件對(duì)202份大豆品種進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析;采用Ntsys 2.10軟件,對(duì)202份大豆材料的遺傳相似性系數(shù)(GS)進(jìn)行計(jì)算,以?xún)蓛善贩N間的遺傳相似系數(shù)矩陣為基礎(chǔ),獲得主坐標(biāo)分析聚類(lèi)圖;計(jì)算大豆品種單株材料間的遺傳距離(GD),運(yùn)用軟件MEGA7.0繪制鄰接聚類(lèi)圖;通過(guò)TASSEL軟件的GLM程序?qū)SR標(biāo)記和大豆灰斑病7號(hào)生理小種的抗性進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,在P㩳0.05時(shí),可認(rèn)為標(biāo)記與性狀關(guān)聯(lián)顯著,并計(jì)算等位變異的表型效應(yīng)值,發(fā)掘優(yōu)異等位變異和相應(yīng)的載體材料。主要結(jié)論如下:1、通過(guò)對(duì)202份大豆品種進(jìn)行抗灰斑病7號(hào)生理小種的鑒定分析發(fā)現(xiàn),在202份育成品種中,抗病品種13份,占供試品種的6.43%;中抗品種137份,占供試品種的67.82%;感病品種52份,占供試品種的25.74%;202份大豆品種的病情指數(shù)分布在34%~66%之間,平均值為55.92%,處于中抗水平,遺傳變異系數(shù)為13.94%。2、202份大豆品種共擴(kuò)增出多態(tài)性位點(diǎn)808個(gè),平均每對(duì)引物擴(kuò)增出多態(tài)性位點(diǎn)4.42個(gè);群體的平均多態(tài)性信息含量(PIC)為0.406;平均基因多樣性指數(shù)(He)為0.45。通過(guò)對(duì)10個(gè)不同育成單位的多樣性比較發(fā)現(xiàn),黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院佳木斯分院中的平均等位變異數(shù)最多且PIC值最高,分別為3.71和0.417。群體結(jié)構(gòu)分析中202份大豆品種分為三類(lèi)血緣,分別由90份、51份、61份大豆品種組成,不同血緣間存在一定程度的遺傳混雜。主坐標(biāo)分析中二維主坐標(biāo)和三維主坐標(biāo)分類(lèi)基本一致,均為3個(gè)類(lèi)群,并且187對(duì)SSR標(biāo)記可將202份大豆品種全部區(qū)分,其遺傳相似系數(shù)介于0.283~0.930之間,平均為0.519。聚類(lèi)分析中NJ聚類(lèi)將202份大豆品種分為三個(gè)亞群,同一個(gè)育種單位的部分品種親緣關(guān)系較近,多集中在一個(gè)亞群中。3、在關(guān)聯(lián)分析中,檢測(cè)到3個(gè)SSR標(biāo)記與灰斑病7號(hào)生理小種抗性為顯著關(guān)聯(lián),分別是位于3號(hào)染色體上的Satt549、10號(hào)染色體上的Satt478和17號(hào)染色體上的Satt372,三者對(duì)應(yīng)的貢獻(xiàn)率分別為15.47%、4.6%和7.23%。通過(guò)對(duì)找到的3個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)對(duì)抗性有增效作用的等位變異有5個(gè),對(duì)應(yīng)的載體品種有11個(gè),其中最優(yōu)等位變異是Satt549-263,表型效應(yīng)值是18.88,典型載體品種為合豐29。
【學(xué)位授予單位】:黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:S435.651
【圖文】:

品種,大豆品種,遺傳多樣性


圖 3-1 Satt652 對(duì) 202 份大豆資源中部分品種擴(kuò)增帶型Figure 3-1 Satt652 for some varieties of 202 soybean resources表 3-2 202 份大豆品種的遺傳多樣性Table 3-2 Genetic diversity of 202 soybean varieties

趨勢(shì)變化,群體結(jié)構(gòu),大豆品種


圖 3-2 K 值與 LnP(D)和 ΔK 趨勢(shì)變化Fig.3-2 K-values versus LnP (D) andΔK trend change利用軟件 Structure 2.2 計(jì)算出每個(gè)品種相應(yīng)的 Q 值,并將獲得的 3 個(gè)群體分別命名為 Q1、Q2、Q3,表 3-4 即為 202 份大豆品種的群體結(jié)構(gòu) Q 矩陣,可用于后

血緣,大豆品種,群體結(jié)構(gòu),大豆


圖 3-3 202 份大豆品種基于模型的 3 類(lèi)血緣Fig.3-3 Models of soybeans in 202 soybean varieties表 3-5 10 個(gè)不同類(lèi)型大豆的群體結(jié)構(gòu)分布Table 3-5 Population structure distribution of 10 different types of soybean

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本文編號(hào):2796103

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