螺蟲乙酯影響扶桑綿粉蚧蠟酯合成機(jī)理的研究
【學(xué)位授予單位】:浙江農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:TQ453
【圖文】:
死亡率較低,但是其體表蠟粉明顯減少并表現(xiàn)出生長發(fā)育受到抑制的表型變化(如圖 2.1 所示)。圖2.1 扶桑綿粉蚧取食經(jīng)螺蟲乙酯處理的植物葉片后表型隨時(shí)間的變化Fig. 2.1 The phenotypic changes of the P.solenopsis feeeding the plant leaves treated withspirotetramat2.2.2 Illumina 測序組裝及 Unigenes 同源性分析和功能注釋對125 mg/L螺蟲乙酯處理后的扶桑綿粉蚧樣本和對照組扶桑綿粉蚧樣本建立cDNA文庫。經(jīng)測序拼接后共獲得156425個(gè) transcriptors 和78302個(gè) unigenes,其中Blast結(jié)果中e<1e-5的unigenes有10208個(gè)(具體結(jié)果如表2.2所示)。在所獲得unigenes中,長度大于500bp的unigenes占總數(shù)的70%以上,說明測序結(jié)果良好。
螺蟲乙酯影響扶桑綿粉蚧蠟酯合成機(jī)理的研究18圖2.2 扶桑綿粉蚧Nr庫 unigenes 同源性分析(A)E值分布; (B) 同源性分布; (C) 物種分布Fig. 2.2 Homology analysis against the NCBI non-redundant with a E-value cut-off of 1E-5base on the P.solesis unigenes.(A) E-value distribution; (B) Similarity distribution; (C) Species distribution對獲得的 unigenes 進(jìn)行 GO 注釋之后,將注釋成功的基因按照 GO 三個(gè)大類(BP Biological process, CC Cellular component, MF Molecular Function)的下一層級(jí)進(jìn)行分類,其中在BP類中,與cellular process、metabolic process、single-organismprocess 功能相關(guān)的基因數(shù)較多,其次是 biological regulation、regulation ofbiological process 和 localization、 reponse to stimulus,在 CC 類中,與行使 cell
和 cell junction 功能相關(guān)的基因數(shù)最多,其次是 organelle、macromolecularcomplex、membrane;在 MF 類中,與 binding 和 catalytic activity 功能相關(guān)的基因數(shù)較多,其次是與 transporter activity 相關(guān)的基因,分類結(jié)果如圖 2.3 所示。KOG分類將獲得的unigenes分為26個(gè)group,將KOG注釋成功的基因按KOG的group進(jìn)行分類,基因總量前 10 的組為 R(General function prediction only)、T(Signaltransduction mechanisms) 、 O(Posttranslational modification, protein turnover,chaperones) 、 J(Translation, ribosomal structure and biogenesis) 、 S(Functionunknown)、K(Transcription)、U(Intracellular trafficking, secretion, and vesiculartransport)、I(Lipid transport and metabolism)、Z(Cytoskeleton)、A(RNA processingand modification),具體結(jié)果見圖 2.4。對基因做 KO 注釋后,根據(jù)它們參與的KEGG 通路進(jìn)行分類,如圖 2.5 所示,在所分的五類中,與新陳代謝過程及有機(jī)系統(tǒng)相關(guān)的基因數(shù)量占較大比例。所涉及的代謝過程包括能量代謝、多糖的生物合成與代謝、脂質(zhì)代謝、碳?xì)浠衔锎x以及氨基酸代謝等,其中與脂質(zhì)代謝相關(guān)的基因數(shù)量最多,有 652 個(gè)。
【參考文獻(xiàn)】
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