【摘要】：測(cè)序技術(shù)的發(fā)展帶動(dòng)了生命科學(xué)研究領(lǐng)域翻天覆地的改變,催生了生物大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái)。目前,已有300多種昆蟲(chóng)基因組被測(cè)序,大數(shù)據(jù)組學(xué)分析已經(jīng)成為科學(xué)研究重要的途徑。本文圍繞昆蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)挖掘,依托構(gòu)建的基因組數(shù)據(jù)InsectBase平臺(tái),分別以寄生性昆蟲(chóng)腰帶長(zhǎng)體繭蜂和入侵性昆蟲(chóng)蘋(píng)果蠹蛾為研究對(duì)象,測(cè)序獲得了基因組序列,開(kāi)展了比較基因組和功能基因組分析。主要工作如下:1、構(gòu)建了 InsectBase昆蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)平臺(tái)隨著昆蟲(chóng)基因組數(shù)據(jù)的快速增長(zhǎng),數(shù)據(jù)管理和共享成為制約.研究效率的瓶頸。通過(guò)收集整理已發(fā)表以及各數(shù)據(jù)庫(kù)可公開(kāi)獲得的昆蟲(chóng)基因組、轉(zhuǎn)錄組、miRNA和UTR等數(shù)據(jù),構(gòu)建了 InsectBase數(shù)據(jù)平臺(tái)(http://www.insect-genome.com),提供序列查詢、比對(duì)、基因組可視化、信號(hào)通路和注釋、進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建、數(shù)據(jù)下載等服務(wù)。通過(guò)文獻(xiàn)挖掘,基于“基因-研究者-昆蟲(chóng)物種”的相互關(guān)系建立了昆蟲(chóng)學(xué)領(lǐng)域的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)iFacebook,可促進(jìn)昆蟲(chóng)學(xué)研究人員之間的學(xué)術(shù)交流。作為綜合型生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),InsectBase數(shù)據(jù)種類齊全、功能全面、使用方便,對(duì)昆蟲(chóng)基因組學(xué)研究具有重要的推動(dòng)作用。2、腰帶長(zhǎng)體繭蜂內(nèi)寄生、多胚發(fā)育與被動(dòng)免疫的基因組分析腰帶長(zhǎng)體繭蜂是一種寄生玉米螟等害蟲(chóng)的寄生蜂,具有多胚發(fā)育和被動(dòng)免疫等生物學(xué)特性,在生物防治中具有較好的應(yīng)用前景。通過(guò)對(duì)腰帶長(zhǎng)體繭蜂的基因組分析,發(fā)現(xiàn)發(fā)育相關(guān)基因在多胚發(fā)育的真胚中表達(dá)水平更高,而營(yíng)養(yǎng)代謝相關(guān)基因在假胚中表達(dá)水平更高;miR-14b在多胚發(fā)育的早期特異性高表達(dá),靶標(biāo)預(yù)測(cè)和體外熒光素酶實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)其靶基因?yàn)镸BP-1、KMT2E和RUNT基因,這些基因與細(xì)胞增殖相關(guān),表明miR-14b可能通過(guò)調(diào)控細(xì)胞增殖來(lái)控制腰帶長(zhǎng)體繭蜂的多胚發(fā)育。比較分析了不同寄生蜂的Hemomucin基因,發(fā)現(xiàn)該基因mucin結(jié)構(gòu)域的氧糖基化在寄生蜂的被動(dòng)免疫中可能有重要作用。同時(shí),系統(tǒng)地分析了寄生蜂P450超基因家族的進(jìn)化,發(fā)現(xiàn)了在寄生蜂中1:1:1高度保守的CYP18和CYP314基因亞家族,以及繭蜂科特有的CYP304基因亞家族和內(nèi)寄生蜂特有的CYP28基因亞家族。研究結(jié)果初步揭示了多胚發(fā)育和被動(dòng)免疫逃避的分子機(jī)制,對(duì)遺傳改良和利用寄生蜂進(jìn)行生物防治具有指導(dǎo)意義。3、蘋(píng)果h畝昊蜃榧叭氡慊蜃樘匭云還藍(lán)曄瞧還�、缷谷水果掉[匾Τ

本文編號(hào)：2730521