巴基斯坦begomovirus和煙粉虱的遺傳多樣性及地理分布
發(fā)布時(shí)間:2020-06-05 08:24
【摘要】:煙粉虱(Bemisiata baci)是一種世界范圍內(nèi)廣泛分布的隱種復(fù)合體。除通過刺吸直接傷害農(nóng)作物外,煙粉虱還傳播一類非常重要的植物病毒,即begomoviruses.Begomoviruses包括322多個(gè)種,在溫帶和熱帶地區(qū)引起多種雙子葉植物病害。在巴基斯坦,begomoviruses嚴(yán)重威脅農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。例如,幾種begomoviruses造成的木爾坦棉花曲葉病(CLCuD)在上世紀(jì)90年代重創(chuàng)了巴基斯坦棉花產(chǎn)業(yè)。直到現(xiàn)在,CLCuD每年給棉花生產(chǎn)造成的產(chǎn)量損失仍可達(dá)30%。雖然具有明顯的經(jīng)濟(jì)重要性,巴基斯坦全國(guó)范圍內(nèi)煙粉虱和begomoviruses的群體結(jié)構(gòu)還沒有報(bào)道。本研究在2016-2017年間從巴基斯坦所有4個(gè)省份中,選擇了 41個(gè)不同地點(diǎn)進(jìn)行煙粉虱樣品采集。通過mtCOI基因測(cè)序進(jìn)行煙粉虱隱種鑒定,通過簡(jiǎn)并引物PCR鑒定這些煙粉虱攜帶的begomoviruses。然后,本研究對(duì)所得序列進(jìn)行分析,研究巴基斯坦煙粉虱和begomoviruses的種群結(jié)構(gòu)。本研究獲得了 124條煙粉虱mtCOI序列。分析表明,在巴基斯坦存在5種煙粉虱隱種,即AsiaⅡ-1,AsiaⅡ-5,AsiaⅡ-7。AsiaⅡ-8和MEAM-1。其中,AsiaⅡ-8為在巴基斯坦的首次報(bào)道。另外,在早期的研究中,只在少數(shù)幾個(gè)地區(qū)發(fā)現(xiàn)過Asia Ⅱ-1。但是,本研究表明,該煙粉虱隱種目前已在全國(guó)流行:在本研究所鑒定的樣品中,88.7%的煙粉虱屬于此隱種。從地域上看,旁遮普省煙粉虱的多態(tài)性最高,本研究在該省發(fā)現(xiàn)了4種煙粉虱隱種(Asia Ⅱ-1,Asia Ⅱ-5,Asia Ⅱ-7 and MEAM-1);信德省其次,該省有2種煙粉虱隱種(Asia Ⅱ-1 and Asia Ⅱ-8),其它兩個(gè)省只有1種煙粉虱隱種(Asia Ⅱ-1)。進(jìn)化學(xué)分析表明,5種煙粉虱隱種的兩兩遺傳差異在0.35%到19.54%之間。在隱種水平上,Asia Ⅱ-1的遺傳多樣性最高:為2.55%,Asia Ⅱ-7次之,為1.54%,而MEAM-1只有0.35%。兩兩平均遺傳距離最大的是 Asia Ⅱ-1(0.89%),其次是 Asia Ⅱ-7(0.61%)和 MEAM-1(0.16%)。從上述煙粉虱中,本研究共獲得begomovirus序列177條(每條約570 bp)。BLASTn結(jié)果表明,這些序列分別對(duì)應(yīng)14種不同的begomoviruses。其中,有5種begomoviruses還從未在巴基斯坦被報(bào)道過,它們是黃麻黃脈病毒(CoYVV),喀拉拉邦番茄曲葉病毒(ToLCKeV),卡納塔克邦番茄曲葉病毒(ToLCKV),番茄耳突曲葉病毒(ToELCV)和煙草曲莖病毒(TbCSV)。另外,本研究還發(fā)現(xiàn)兩個(gè)病毒,即CoYVV和辣椒曲葉病毒(ChiLCV),的新株系,因?yàn)橄鄳?yīng)的序列與已知序列的同源率小于90%。多種番茄begomoviruses在全國(guó)范圍內(nèi)廣泛分布,包括ToLCKeV,ToLCKV,ToELCV,櫻桃番茄曲葉病毒(CToLCV),帕蘭波番茄曲葉病毒(ToLCPMV)和番茄黃花曲葉病毒(TYLCV)。另外一個(gè)在全國(guó)范圍內(nèi)廣泛分布的病毒是蓬子草黃脈病毒(AYVV)。相反,另外一些病毒僅在少數(shù)一些地區(qū)被發(fā)現(xiàn),如TbCSV僅存在于旁遮普省蜀葵黃脈病毒(HoYVMV)和紅雀珊瑚曲葉病毒僅存在于旁遮普省中部,而木瓜曲葉病毒(PLCV)僅在信德省的木瓜種植區(qū)被發(fā)現(xiàn)。由于繁殖力強(qiáng),食性雜和抗藥性強(qiáng),煙粉虱難防難控。同樣,由于不斷地進(jìn)化,begomovirus的控制也極具挑戰(zhàn)性。近年來關(guān)于煙粉虱與begomovirus互作的研究為控制該復(fù)合體的蔓延提供了許多新的思路。本研究首次在整個(gè)國(guó)家水平上研究煙粉虱和begomovirus在巴基斯坦的種群結(jié)構(gòu),所得數(shù)據(jù)有助于制定新的措施,減少煙粉虱和begomovirus在巴基斯坦的危害。
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S43
本文編號(hào):2697774
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
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【學(xué)位授予年份】:2018
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,本文編號(hào):2697774
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