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道路廊道對紫莖澤蘭種群基因組結(jié)構(gòu)的影響

發(fā)布時間:2020-05-26 02:10
【摘要】:紫莖澤蘭(Ageratina adenophora)是一種危害嚴重的入侵性雜草,大概于20世紀40年代從滇緬邊境入侵至我國云南省南部,現(xiàn)已在中國西南部地區(qū)廣泛分布。道路廊道對紫莖澤蘭的傳播具有通道效應,促進其沿道路廊道快速擴散,對生態(tài)造成了嚴重影響。本文以道路沿線的紫莖澤蘭為研究材料,以滇緬公路和云南省內(nèi)213國道沿線區(qū)域,以及緬甸、貴州、廣西、四川與云南的交界區(qū)域作為研究區(qū),利用RAD-seq技術(shù)對研究區(qū)內(nèi)39個紫莖澤蘭種群的基因組結(jié)構(gòu)進行分析,以揭示道路廊道對紫莖澤蘭種群基因組結(jié)構(gòu)的影響,并推測其在我國定居擴散的歷史過程。研究結(jié)果概括如下:(1)云南省道路密度和連通度普遍較低,無道路分布和低密度區(qū)域占云南省總面積的83.3%。云南省的路網(wǎng)分布不均勻,中東部地區(qū)的道路密度整體高于西部地區(qū)和南部地區(qū),其中昆明市、曲靖市、玉溪市的道路密度最高。(2)39個紫莖澤蘭種群共181個體的核DNA經(jīng)簡化基因組測序后,共獲得125.88百萬序列(MReads),分析發(fā)現(xiàn)264375個SNPs。種群遺傳多樣性統(tǒng)計分析結(jié)果顯示,多態(tài)性位點百分比(PPB)平均值為64.56%(52.17%~68.46%),預期雜合度(He)、等位基因平均頻率(P)、核苷酸多樣性(Pi)平均值分別為0.2564、0.7855和0.2958。紫莖澤蘭種群的遺傳多樣性與經(jīng)度、道路密度具有顯著性負相關(guān)關(guān)系。(3)種群間的遺傳分化系數(shù)FsST和基因流(Nm)平均為0.0397和6.16,種群內(nèi)遺傳分化系數(shù)Fts平均為-0.24,種群間的遺傳分化較小,基因流強烈。PCA和Admixture分析表明,紫莖澤蘭種群的親緣關(guān)系較近,無明顯的種群遺傳結(jié)構(gòu)。Mantel分析顯示,紫莖澤蘭種群的遺傳分化和空間距離的相關(guān)性不顯著。道路廊道促進了種群沿路擴散,距離隔離效應對紫莖澤蘭種群基因組水平的遺傳多樣性無顯著影響,距離隔離效應小于景觀連通效應。
【圖文】:

采樣點,鹽津


采樣點邐ii邐植株數(shù)邐經(jīng)度(。)邐煒度(。)邐海拔(m)逡逑Sampling邋site邐Code邐Number邐Longitude邐Latitude邐Elevation逡逑尋甸邐XD邐5邐103.2322邐25.5428邐2030逡逑會澤邐HZ邐3邐103.4511邐26.4658邐1980逡逑大關(guān)(玉碗鎮(zhèn))邐DG邐5邐103.8681邐27.6717邐1230逡逑鹽津邐J邐5邐104.0886邐28.0375邐560逡逑永善邐YB邐5邐103.8711邐28.2478邐400逡逑綏江邐SJ邐5邐103.94邐28.6011邐390逡逑四川犍為邐QW邐5邐103.9144邐29.2267邐370逡逑廣西西林邐X邐5邐105.0842邐24.5997邐1470逡逑廣西隆林邐LL邐5邐105.4644邐24.7622邐510逡逑貴州興義邐Y邐5邐104.9139邐25.1547邐1085逡逑貴州盤縣邐PX邐2邐104.4678邐25.7411邐1700逡逑富源邐FY邐5邐104.2428邐25.6636邐1800逡逑曲靖邐GJ邐5邐103.7859邐25.4641邐1910逡逑昆明海口邐HK邐5邐102.5743邐24.8416邐2115逡逑9fi*_邋E邐E邐100;邋H邐102;邋E邐1M;邋E邐106;邋E邐108*邋E逡逑*1邐''邐1邐'邐1邐'

分布圖,紫莖澤蘭,采樣點,分布圖


圖2-2紫莖澤蘭基因組DNA質(zhì)量檢測結(jié)果逡逑-
【學位授予單位】:云南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S451

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號:2681109

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