蚧科代表性物種的共生微生物多樣性
【圖文】:
72℃延伸 1min,30 個(gè)循環(huán);最后 72℃終延伸 10min,4℃保溫。PCR 產(chǎn)物用 1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后(圖2-1),將樣品分別送交北京百邁客生物科技有限公司、上海生工生物工程股份有限公司及上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行高通量測(cè)序(附表 S1)。圖 2-1 樣品 PCR 擴(kuò)增結(jié)果(部分)Figure 2-1 PCR amplification of scale insects注:左側(cè)為細(xì)菌引物 8F/1492R 擴(kuò)增結(jié)果,右側(cè)為真菌引物 ITS1F/ITS4 擴(kuò)增結(jié)果。CK:空白對(duì)照;Marker F:DNA 片段從上到下依次對(duì)應(yīng) 2000bp,1500bp,1000bp,700bp,400bp,200bp。Note: PCR amplification in the left used the primer pair 8F/1492R, and used ITS1F/ITS4 in theright. CK: Blank control; Marker F: Each DNAfragments represented 2000bp, 1500bp,1000bp, 700bp, 400bp, 200bp from top to bottom.2.3.3 蚧蟲體內(nèi)細(xì)菌 DNA 高通量測(cè)序不同公司進(jìn)行 Miseq 測(cè)序的流程有所差異
南洋臀紋粉蚧隸屬于蚧總科粉蚧科臀紋粉蚧屬 Planococcus,根據(jù)前人的研究臀紋粉蚧體內(nèi)具有特化形成庇護(hù)共生細(xì)菌的含菌胞,在含菌胞中定居著粉蚧的初級(jí)共生菌 CandidatusTremblayaprincep(sβ-變形菌綱,后文中省略 Candidatus),在 Tremblaya princeps 的細(xì)胞質(zhì)中還存在著次級(jí)共生菌 Candidatus Moranella sp.(γ-變形菌綱)[88][107]。29 種蚧蟲樣品的細(xì)菌主要?dú)w屬于 30 個(gè)門、82 個(gè)綱、136 個(gè)目、243 個(gè)科、481 個(gè)屬。在門水平上,樣品中的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌主要為變形菌門(Proteobacteria),在每種蚧蟲中的平均相對(duì)物種豐度為 55.56%;其次是厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門和放線菌門(Actinobacteria)的菌群,平均相對(duì)物種豐度分別為 14.92%、10.45%和7.65%。在南洋臀紋粉蚧的樣品中變形菌門菌群的相對(duì)豐度可達(dá)99.62%,而 Coccus praetermissus 樣品體內(nèi)的主要菌群與其他蚧蟲不同,歸屬于柔膜菌門(Tenericutes),相對(duì)物種豐度高達(dá) 99.36%。另外,酸桿菌門(Acidobacteria)菌群在日本龜蠟蚧的樣品中物種豐度可達(dá) 17.85%。
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S763.49
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,本文編號(hào):2610162
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