近年來全基因組關聯(lián)分析(Genome Wide Association Studies,GWAS)發(fā)現(xiàn)了越來越多常見變異位點,用這些常見變異位點來篩選高風險患病人群成為全基因組關聯(lián)分析后續(xù)研究的一個重要方向。本研究的目的為通過基因填補發(fā)現(xiàn)發(fā)作性睡病易感位點,為后續(xù)研究提供依據(jù),同時在漢族人中建立一個發(fā)作性睡病多基因風險預測模型,并對模型的鑒別能力做評估。在該研究中,我們以1189個發(fā)作性睡病患者、1997個健康人群為研究隊列,并建立了兩個訓練集和一個測試集。在每個訓練集下我們分別篩選出9個易感位點,此外,我們又從已有的GWAS研究中篩選出9個與發(fā)作性睡病相關的位點納入風險預測模型中。我們對這18個位點的風險評分進行加權建立了遺傳風險預測模型,并選出最優(yōu)模型(ALL-SNP model,AUC:0.826)。同時,我們還發(fā)現(xiàn)在最優(yōu)模型下位于多基因風險得分最高四分位數(shù)組的人群患病風險遠高于多基因風險得分最低四分位數(shù)組的人群(OR=27.8,P<0.0001)。此外,我們還將最優(yōu)模型中的18個位點分為兩個部分分別構建模型(HLA model,AUC:0.806;NO-HLA model,...

【文章頁數(shù)】：47 頁

【學位級別】：碩士

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致謝
摘要
Abstract
縮略詞表
1.前言
    1.1 流行病學研究
    1.2 易感基因研究現(xiàn)狀
    1.3 臨床癥狀和診斷標準
    1.4 臨床誤診
    1.5 研究目的和意義
2.理論基礎
    2.1 全基因組關聯(lián)分析
    2.2 基因型填補
    2.3 PLINK
    2.4 遺傳風險評分
    2.5 評判遺傳風險評估模型的分辨能力
3材料和方法
    3.1 研究對象
    3.2 實驗試劑
    3.3 實驗儀器
    3.4 實驗方法
    3.5 SNP位點的篩選
    3.6 多基因風險得分
    3.7 統(tǒng)計分析
4.結果與分析
    4.1 研究人群的基本情況
    4.2 研究人群的基因型填補
    4.3 選取納入漢族人群遺傳風險預測模型的易感位點
    4.4 歐洲人群中的易感位點
    4.5 遺傳風險得分與發(fā)作性睡病患病風險
5.討論
參考文獻



本文編號：4012545