發(fā)布時(shí)間：2022-12-04 02:05

　　目的:分析不明原因發(fā)熱患者肺泡灌洗液中的病毒譜。方法:將58例肺泡灌洗液樣本隨機(jī)分為5組分別構(gòu)建5個(gè)文庫(kù),利用病毒宏基因組學(xué)技術(shù)進(jìn)行病毒群落分析,并對(duì)獲得的細(xì)環(huán)病毒及鼻病毒進(jìn)行陽(yáng)性樣本篩選。結(jié)果:肺泡灌洗液病毒群落組成中,指環(huán)病毒科占主體地位（19.4%）,其次為圓環(huán)病毒科（11.0%）,藻去氧核糖核酸病毒科（11.0%）,人類(lèi)內(nèi)源性遞轉(zhuǎn)錄病毒科（10.2%）,痘病毒科（4.9%）,逆轉(zhuǎn)錄病毒科（3.2%）,帚狀病毒科（2.3%）,小RNA病毒科（0.6%）;并發(fā)現(xiàn)了4株序列較長(zhǎng)的細(xì)環(huán)病毒,根據(jù)細(xì)環(huán)病毒開(kāi)放閱讀框1進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,顯示其與已知的細(xì)環(huán)病毒在核酸水平上有一定的差異。通過(guò)對(duì)細(xì)環(huán)病毒及鼻病毒陽(yáng)性樣本的篩選,發(fā)現(xiàn)細(xì)環(huán)病毒陽(yáng)性率為11.3%,鼻病毒陽(yáng)性率為10.0%。結(jié)論:應(yīng)用病毒宏基因組學(xué)技術(shù)成功解析出不明原因發(fā)熱患者肺泡灌洗液中的病毒群落組成,病毒群落中指環(huán)病毒科占比最高,其中細(xì)環(huán)病毒因發(fā)熱導(dǎo)致的炎性環(huán)境以及患者免疫力低下而大量增殖。 

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 肺泡灌洗液樣本的采集
    1.2 病毒宏基因組文庫(kù)構(gòu)建及深度測(cè)序
        1.2.1 高通量文庫(kù)的構(gòu)建[4-5]
        1.2.2 文庫(kù)的擴(kuò)增、純化與測(cè)序
        1.2.3 文庫(kù)測(cè)序結(jié)果的生物信息學(xué)分析
    1.3 病毒基因組擴(kuò)增及陽(yáng)性樣本篩選
        1.3.1 肺泡灌洗液中病毒核酸的提取
        1.3.2 PCR引物設(shè)計(jì)及擴(kuò)增測(cè)序
2 結(jié)果
    2.1 肺泡灌洗液文庫(kù)中病毒群落組成
    2.2 細(xì)環(huán)病毒陽(yáng)性樣本篩選結(jié)果及系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.3 鼻病毒陽(yáng)性樣本篩選結(jié)果
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]人獸共患痘病毒病流行現(xiàn)狀及其宿主譜研究進(jìn)展[J]. 周濤,賈懷杰,何小兵,房永祥,景志忠.  中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(02)
[2]中西醫(yī)結(jié)合治療小兒流感病毒性肺炎臨床療效觀察[J]. 張桂菊,趙紅梅,吳金勇,襲雷鳴,張葆青.  山東醫(yī)藥. 2015(05)
[3]病毒宏基因組學(xué)方法鑒定出小熊貓糞便中一株新型指環(huán)狀病毒[J]. 郭靚驊,吳孔菊,華修國(guó),崔立,張文,齊敦武.  上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版). 2018(01)
[4]不明原因發(fā)熱流行病學(xué)及臨床特征分析[J]. 嵇瑋嘉,顏學(xué)兵.  中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2019(24)

碩士論文
[1]鼠腸道病毒宏基因組學(xué)研究[D]. 李旺.江蘇大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3707403