基于血清拉曼光譜的丙肝診斷和1b亞型的鑒定
發(fā)布時(shí)間：2021-01-12 14:00
目的:初步建立基于血清拉曼光譜的丙型肝炎病毒（HCV）的診斷及1b亞型的鑒定方法。方法:應(yīng)用激光拉曼光譜儀檢測(cè)各樣品的血清,檢測(cè)波長(zhǎng)區(qū)間為300至300 0cm-1,采用airPLS-pls-svc算法處理拉曼光譜數(shù)據(jù)并分型鑒定,HCV診斷訓(xùn)練集,納入健康志愿者145例和HCV患者152例,HCV診斷測(cè)試集,納入健康志愿者55例和HCV患者72例。1b亞型鑒定的訓(xùn)練集為1b亞型患者88例和非1b亞型患者64例,1b亞型鑒定的測(cè)試集為1b亞型患者51例和非1b亞型患者15例。結(jié)果:HCV1b型和非1b亞型血清拉曼光譜拉曼峰型相似,在100 7 cm-1,115 4cm-1,151 9 cm-1波長(zhǎng)的拉曼光譜峰強(qiáng)度存在差異。應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)分析這些拉曼光譜,1b型鑒定準(zhǔn)確率為100%（51/51）,非1b亞型鑒定準(zhǔn)確率為93.333 3%（14/15）,誤診一例�？倻�(zhǔn)確率為98.48 4 8%,總誤診1例。結(jié)論:本研究初步證明拉曼光譜可應(yīng)用于HCV診斷和HCV1b亞型的鑒定,為研發(fā)HCV新型診斷和分型技術(shù)奠定了基礎(chǔ)。
【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】：38 頁
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
HCV診斷結(jié)果的評(píng)價(jià)
a 扣除背景前各個(gè)樣本平均光譜圖 b 扣除前每例樣本的光譜圖c 扣除背景后各個(gè)樣本平均光譜圖 d 1b 亞型與其他亞型拉曼光譜血清數(shù)據(jù)的差異圖.3 為 1b 型與其他分型的光譜圖Fig.3 shows the spectrum of type 1b and other types注：圖 3-a 中紅線表示 139 例 b 型樣本的平均譜圖，黑線表示其他數(shù)據(jù) 79 例（包括：2a 55 例，3a 17 例，3b 7 例）樣本平均譜圖，從圖中可以看出存在較大熒光背景噪聲干擾，因此使用 airPLS算法來扣除熒光背景，圖 3-b 顯示了扣除背景前所有光譜數(shù)據(jù)的譜圖，其中紅線表示在扣除背景前的 218 例樣本的譜圖，藍(lán)線表示扣除背景后的 218 例樣本譜圖
a 參數(shù)優(yōu)化等高線圖 b 分類結(jié)果圖圖.5 HCV1b 鑒定結(jié)果的評(píng)價(jià)Fig .5 Evaluation of HCV1b identification results注：圖（5-a）：不同的 c g 值對(duì)應(yīng)的是交叉驗(yàn)證準(zhǔn)確率，等高線圖越往右準(zhǔn)確率采用 SVM 算法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行判別分析，繪制測(cè)試集分類結(jié)果圖。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]PCR-熒光探針法在中國HCV常見基因型檢測(cè)中的意義[J]. 吳濤,梁華芳,熊璐,王姣,郭曉磊,林鋒. 中華臨床感染病雜志. 2017 (01)
[2]中國西南三地HCV基因型的分布及臨床特征[J]. 溫先勇,唐敏,鄧正華,李寶林. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2016(23)
[3]川南地區(qū)丙型肝炎病毒基因型的特征及其臨床價(jià)值[J]. 林江,溫先勇,唐敏. 四川醫(yī)學(xué). 2016(12)
[4]聚乙二醇干擾素聯(lián)合利巴韋林治療不同基因型慢性丙型肝炎療效分析[J]. 陳慶峰. 蚌埠醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2016(09)
[5]《丙型肝炎防治指南》2015年更新版[J]. 實(shí)用肝臟病雜志. 2016(04)
[6]反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)對(duì)丙型肝炎病毒可視化分型檢測(cè)[J]. 趙娜,劉金霞,孫殿興. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]新疆地區(qū)漢族、維吾爾族、哈薩克族丙肝患者基因型研究[J]. 陳兆云,劉繼文,孟存仁,張朝霞,張晨. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(07)
[8]HCV基因分型進(jìn)展及臨床意義[J]. 高麗,楊紹敏. 傳染病信息. 2013(02)
[9]宿主基因和直接抗病毒藥物:丙型肝炎個(gè)體化治療的新時(shí)代[J]. 魏來. 傳染病信息. 2012(02)
[10]HCV血清分型方法的建立及其評(píng)價(jià)[J]. 楊錫琴,修冰水,王國華,陳堃,宋曉國,李卓,嚴(yán)艷,張賀秋,彭瑞云. 傳染病信息. 2012(02)
本文編號(hào)：2972975
【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】：38 頁
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
HCV診斷結(jié)果的評(píng)價(jià)
a 扣除背景前各個(gè)樣本平均光譜圖 b 扣除前每例樣本的光譜圖c 扣除背景后各個(gè)樣本平均光譜圖 d 1b 亞型與其他亞型拉曼光譜血清數(shù)據(jù)的差異圖.3 為 1b 型與其他分型的光譜圖Fig.3 shows the spectrum of type 1b and other types注：圖 3-a 中紅線表示 139 例 b 型樣本的平均譜圖，黑線表示其他數(shù)據(jù) 79 例（包括：2a 55 例，3a 17 例，3b 7 例）樣本平均譜圖，從圖中可以看出存在較大熒光背景噪聲干擾，因此使用 airPLS算法來扣除熒光背景，圖 3-b 顯示了扣除背景前所有光譜數(shù)據(jù)的譜圖，其中紅線表示在扣除背景前的 218 例樣本的譜圖，藍(lán)線表示扣除背景后的 218 例樣本譜圖
a 參數(shù)優(yōu)化等高線圖 b 分類結(jié)果圖圖.5 HCV1b 鑒定結(jié)果的評(píng)價(jià)Fig .5 Evaluation of HCV1b identification results注：圖（5-a）：不同的 c g 值對(duì)應(yīng)的是交叉驗(yàn)證準(zhǔn)確率，等高線圖越往右準(zhǔn)確率采用 SVM 算法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行判別分析，繪制測(cè)試集分類結(jié)果圖。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]PCR-熒光探針法在中國HCV常見基因型檢測(cè)中的意義[J]. 吳濤,梁華芳,熊璐,王姣,郭曉磊,林鋒. 中華臨床感染病雜志. 2017 (01)
[2]中國西南三地HCV基因型的分布及臨床特征[J]. 溫先勇,唐敏,鄧正華,李寶林. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2016(23)
[3]川南地區(qū)丙型肝炎病毒基因型的特征及其臨床價(jià)值[J]. 林江,溫先勇,唐敏. 四川醫(yī)學(xué). 2016(12)
[4]聚乙二醇干擾素聯(lián)合利巴韋林治療不同基因型慢性丙型肝炎療效分析[J]. 陳慶峰. 蚌埠醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2016(09)
[5]《丙型肝炎防治指南》2015年更新版[J]. 實(shí)用肝臟病雜志. 2016(04)
[6]反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)對(duì)丙型肝炎病毒可視化分型檢測(cè)[J]. 趙娜,劉金霞,孫殿興. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]新疆地區(qū)漢族、維吾爾族、哈薩克族丙肝患者基因型研究[J]. 陳兆云,劉繼文,孟存仁,張朝霞,張晨. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(07)
[8]HCV基因分型進(jìn)展及臨床意義[J]. 高麗,楊紹敏. 傳染病信息. 2013(02)
[9]宿主基因和直接抗病毒藥物:丙型肝炎個(gè)體化治療的新時(shí)代[J]. 魏來. 傳染病信息. 2012(02)
[10]HCV血清分型方法的建立及其評(píng)價(jià)[J]. 楊錫琴,修冰水,王國華,陳堃,宋曉國,李卓,嚴(yán)艷,張賀秋,彭瑞云. 傳染病信息. 2012(02)
本文編號(hào)：2972975
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