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外周血細胞分類與計數(shù)在深度學習中的應用

發(fā)布時間:2020-11-15 16:43
【摘要】:在醫(yī)學檢驗科,外周血細胞檢測(血常規(guī))作為一種采樣方便、檢測準確的檢測方法,一直對疾病判斷有著非常重要的意義。外周血細胞檢測主要通過識別血液中各類細胞、并計算各類細胞的比例是否在正常范圍內(nèi),從而判斷被檢測者是否患有某種疾病。不同的血細胞檢查結果揭示了多種重要的血液病原理。在醫(yī)學圖像處理領域,隨著成像技術的極大進步,用計算機圖形學輔助醫(yī)學診斷成為一大趨勢,一方面,成像技術的發(fā)展帶來了海量的醫(yī)學數(shù)據(jù),另一方面,計算機圖形學輔助診斷可以生成血液樣本的圖像,帶來更精確、更高效的診斷結果?傊,如何將深度神經(jīng)網(wǎng)絡應用到醫(yī)學檢測上,將計算機拍出的血液樣本圖片用深度神經(jīng)網(wǎng)絡進行分類和計數(shù),代替醫(yī)生的手動操作成為一個廣泛關注的熱點課題。本課題與南京市鼓樓醫(yī)院合作,在醫(yī)學檢驗科采集臨床外周血細胞顯微圖像,建立外周血細胞數(shù)據(jù)集。本課題采用深度學習的方法對外周血血細胞進行分類和計數(shù)研究。主要研究內(nèi)容包括:1、在分析了外周血細胞圖像的采集難點后,建立了自己的血細胞數(shù)據(jù)集,這套數(shù)據(jù)集從實際入手,分類完備,比現(xiàn)有的5類白細胞數(shù)據(jù)集多出4類,為后續(xù)的分類和計數(shù)研究奠定了基礎。2、針對數(shù)據(jù)集類間數(shù)據(jù)量不平衡的問題,做了數(shù)據(jù)增強并隨機采樣訓練集。針對細胞類間特征差異過小的情況,設計出一種新的數(shù)據(jù)增強方法,加大差異間的采樣頻率,將測試準確率提高至99%。3、根據(jù)紅細胞計數(shù)的研究現(xiàn)狀,從圖像處理入手,采用基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的計數(shù)方法,結合特征金字塔(FPN)和深度殘差網(wǎng)絡ResNet,將紅細胞計數(shù)的準確率提高至97.5%。本課題基本完成了血細胞的分類和計數(shù)工作,解決了細胞類間相似度過高引起的分類困難問題,并且涵蓋了外周血中幾乎所有影響疾病判斷的細胞類型。該研究極大地節(jié)約了人力成本,并為后續(xù)的研究奠定了基礎。
【學位授予單位】:南京大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:TP391.41;R446.1
【圖文】:

流程圖,人工神經(jīng)元網(wǎng)絡,新領域,機器學習


圖1.1流式細胞計(左)細胞分析儀(右)(摘自[74])??nr??獲取ifil液樣本??血液分折儀??No??——??|?Yes??流式細胞計??。伲澹??人.1.檢測??得?l?l?i^i?論?f???圖1.2傳統(tǒng)血檢流程圖??深度學習是機器學習研宄中的一個新領域,深度神經(jīng)網(wǎng)絡模型是指一個多層??連接的人工神經(jīng)元網(wǎng)絡,這個網(wǎng)絡能夠從觀測數(shù)據(jù)中進行特征提取,學習數(shù)據(jù)特??征之間的復雜關系[6]。模型通常采用非線性單元,用多層結構來表達不同層次的??特征。層數(shù)越高,表達的特征越抽象。提取的特征隨后傳遞給分類器。深度神經(jīng)??網(wǎng)絡通過觀察各種輸入數(shù)據(jù)來學習,并在分類相應的標簽時最小化錯誤[7]。??在醫(yī)學圖像處理領域,隨著成像技術的極大進步,用計算機圖形學輔助醫(yī)學??診斷成為一大趨勢,一方面,成像技術的發(fā)展帶來了海量的醫(yī)學數(shù)據(jù),另一方面,??計算機圖形學輔助診斷可以生成血液樣本的圖像

示意圖,檢測方法,步驟,示意圖


在找到初始位置后,將蛇放入圖像中并執(zhí)行最小化過程。當收斂時,??每個輪廓的內(nèi)部被視為一個白細胞。為了找到核區(qū)域,改變了能量泛函的約束條??件。在前面的步驟中,最初的蛇被選擇為細胞的輪廓。這個過程如圖1.3所示(摘??自[17])。我為了達到分類的目的,該算法提取了各種基于形狀和紋理的特征。??支持向量機(SVM)分類器在大多數(shù)情況下都能獲得最佳效果。??(a)原始圖像?(b)二值化??(c)填充/裁剪?(d)初始位置??(e)初始輪廓?(f)?M終輪廓??圖1.3分割步驟示意圖(摘自[17])??Wang?Shitong等[18]提出了一種基于模糊細胞神經(jīng)網(wǎng)絡(FCNN)的檢測方法。??在這種檢測技術中,先對RGB圖像的三個通道用金字塔法單獨壓縮,然后取細??胞質(zhì)的平均灰度值作為閾值,進行二值分割,然后進行腐蝕或膨脹。這樣可以確??定細胞核的位置。接著使用正確的窗口大小來檢測白細胞。??4??

示意圖,監(jiān)督學習,監(jiān)督訓練,機器學習


?(聚類)?應對環(huán)境??圖2.1機器學習分類??1、監(jiān)督學習(supervised?learning)??監(jiān)督學習??AA??x2?o?AA??〇〇??〇??????xi??圖2.2監(jiān)督學習示意圖??監(jiān)督學習是從監(jiān)督訓練數(shù)據(jù)中推斷函數(shù)的機器學習任務。訓練數(shù)據(jù)由一組己??標記的數(shù)據(jù)組成。例如,對數(shù)字的識別中,標記“0”、“1”、“2”等;對花朵種類??的識別,標記“玫瑰”、“月季”、“山茶”等。在訓練數(shù)據(jù)中,每種類別的數(shù)量最好??大致相等,并且樣本數(shù)量足夠多。監(jiān)督學習算法分析訓練數(shù)據(jù)并生成一個推斷函??10??
【相似文獻】

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本文編號:2884975

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