基于神經(jīng)網(wǎng)絡的心室磁共振影像分割技術研究
發(fā)布時間:2020-11-05 16:47
隨著我國心血管疾病患者數(shù)量的持續(xù)增加及醫(yī)學影像技術的不斷發(fā)展,醫(yī)學影像在心血管疾病的臨床診斷、治療康復過程中扮演重要角色的同時,也帶來了巨大的醫(yī)學數(shù)據(jù)處理壓力。在心臟器官中,右心室的個體差異較大,且不同病癥、同病癥不同階段也存有差異,所以心臟影像的右心室分割任務更為艱難。此外,影像設備本身的差異導致其輸出圖像的技術參數(shù)不同,增加了專家、醫(yī)師手動分割難度。因此,發(fā)展魯棒、準確的計算機輔助分割系統(tǒng),以緩解醫(yī)學數(shù)據(jù)處理壓力、促進醫(yī)學影像信息的臨床應用,進而推動對心血管疾病的及早干預、治療具有重要意義。本文基于公開的心室核磁共振數(shù)據(jù)集,針對右心室分割任務展開以下研究:首先,通過包括翻轉(zhuǎn)、平移、拉伸等圖像變換算法的隨機組合,對現(xiàn)有數(shù)據(jù)集進行增強預處理,防止神經(jīng)網(wǎng)絡過擬合。其次,以全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡、U-Net為基線模型,對本數(shù)據(jù)集進行分割,探討經(jīng)典網(wǎng)絡中存在的問題。再次,從神經(jīng)網(wǎng)絡感受域角度討論擴展卷積結(jié)構(gòu)對網(wǎng)絡的影響,并構(gòu)建使用擴展卷積層后的擴展U-Net,測試擴展卷積思想在本分割任務中的作用。最后,討論殘差網(wǎng)絡和DenseNet在降低學習成本、實現(xiàn)特征復用方面的優(yōu)勢,構(gòu)建結(jié)合殘差學習模塊與稠密連接的U-Net神經(jīng)網(wǎng)絡,稱為Dense-U網(wǎng)絡;其中,殘差學習模塊具有“多核擴展”能力,稠密連接建立在輸入層與各下采樣層之間。實驗表明,Dense-U網(wǎng)絡殘差學習模塊的擴展卷積將Dense-U網(wǎng)絡的感受域擴展至與輸入圖像維度相當,對避免分割掩碼空洞及降低假陽率具有有效作用;Dense-U網(wǎng)絡的跳層連接使其在不同形態(tài)的右心室分割中具有較好的魯棒性。同時,殘差模塊中恒定的特征通道數(shù)量抑制了網(wǎng)絡參數(shù)的指數(shù)級增長,使得Dense-U網(wǎng)絡特征參數(shù)較擴展卷積U-Net減少一個量級。因此,綜合分割性能與網(wǎng)絡參數(shù)量級,Dense-U網(wǎng)絡具有明顯優(yōu)勢。此外,基于本文設計的神經(jīng)網(wǎng)絡模型,搭建了在線右心室分割系統(tǒng),本系統(tǒng)具有數(shù)據(jù)導入、圖像預處理、模型選擇與分割以及評估報告等人機交互功能,可較為穩(wěn)定、快速地實現(xiàn)心室的在線分割。
【學位單位】:海南大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:R445.2;R541;TP391.41;TP183
【部分圖文】:
患病率至今沒有得到緩解,仍處于增高的階段。預估中國CVD患者數(shù)量己經(jīng)達??到驚人的2.9億,與此同時2015年因CVD造成死亡的概率已經(jīng)高于腫瘤等其他??疾病,占據(jù)首位,如圖1-1所示。??由于CVD的患者數(shù)量的日益提高,以及其較高的死亡率,如今已經(jīng)成為全??世界的頭號健康問題,根據(jù)美國心臟協(xié)會(Americans?Heart?Association,AHA)??的統(tǒng)計,每天會因為心血管疾病造成超過2150名美國人死亡[5】。此外,美國心??臟協(xié)會的預測,到2030年,至少有40.5%的美國人,或大約1.16億人將患有某??種形式的心血管疾病。而根據(jù)最新報告,中國在17年左右,心血管疾病已經(jīng)占??據(jù)居民疾病死亡構(gòu)成的40%以上[6],形勢嚴峻。世界衛(wèi)生組織表明,這種困境在??全球蔓延,每年導致全球死亡人數(shù)估計為1730萬,超過任何其他死亡原因,占??全球死亡人數(shù)的30%。就發(fā)病率、死亡率和經(jīng)濟負擔而言
Angle55°,36(^420毫米的視野范圍,從基層到頂層進行掃描。其中有專業(yè)醫(yī)師已??經(jīng)手動標注了心內(nèi)膜和心外膜區(qū)域作為訓練數(shù)據(jù),每個病例中包含已手動分割的??15個結(jié)果,如圖1-2所示,其中小梁和乳頭肌也包括在右心室腔中。??右心室內(nèi)壁??(心內(nèi)膜)??—1綱外壁??(心外瞋)??一左心室內(nèi)壁??左心室I—m?(心內(nèi)膜)???左心室外壁??Vi?(心外膜)??圖1-2心室結(jié)構(gòu)??本次挑戰(zhàn),共提供了三組數(shù)據(jù)集,第一組包括訓練數(shù)據(jù),其由16個患者組??的DICOM圖像,由要分割的圖像和右心室輪廓的參照組成。第二組包括測試數(shù)??據(jù)(即Testl組),其由16個不同的患者組成,其中省略了參考輪廓。第三組包??4??
AlexNet神經(jīng)網(wǎng)絡架構(gòu),因為在比賽中取得了突出成績,現(xiàn)在己經(jīng)成為卷積??神經(jīng)網(wǎng)絡(Convolutional?Neural?Networks,CNN)在圖像分類上的經(jīng)典模型。??AlexNet網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)如圖2-1所示,為8層深度網(wǎng)絡,5層為卷積層,另外還有3層??為全連接層。??值得注意的是,AlexKrizhevsky教授指出,如果去掉任何一個卷積層,都會??使整個網(wǎng)絡的分類性能大幅下降。其原理是通過圖像輸入后對其進行層層轉(zhuǎn)換,??8??
【參考文獻】
本文編號:2871911
【學位單位】:海南大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:R445.2;R541;TP391.41;TP183
【部分圖文】:
患病率至今沒有得到緩解,仍處于增高的階段。預估中國CVD患者數(shù)量己經(jīng)達??到驚人的2.9億,與此同時2015年因CVD造成死亡的概率已經(jīng)高于腫瘤等其他??疾病,占據(jù)首位,如圖1-1所示。??由于CVD的患者數(shù)量的日益提高,以及其較高的死亡率,如今已經(jīng)成為全??世界的頭號健康問題,根據(jù)美國心臟協(xié)會(Americans?Heart?Association,AHA)??的統(tǒng)計,每天會因為心血管疾病造成超過2150名美國人死亡[5】。此外,美國心??臟協(xié)會的預測,到2030年,至少有40.5%的美國人,或大約1.16億人將患有某??種形式的心血管疾病。而根據(jù)最新報告,中國在17年左右,心血管疾病已經(jīng)占??據(jù)居民疾病死亡構(gòu)成的40%以上[6],形勢嚴峻。世界衛(wèi)生組織表明,這種困境在??全球蔓延,每年導致全球死亡人數(shù)估計為1730萬,超過任何其他死亡原因,占??全球死亡人數(shù)的30%。就發(fā)病率、死亡率和經(jīng)濟負擔而言
Angle55°,36(^420毫米的視野范圍,從基層到頂層進行掃描。其中有專業(yè)醫(yī)師已??經(jīng)手動標注了心內(nèi)膜和心外膜區(qū)域作為訓練數(shù)據(jù),每個病例中包含已手動分割的??15個結(jié)果,如圖1-2所示,其中小梁和乳頭肌也包括在右心室腔中。??右心室內(nèi)壁??(心內(nèi)膜)??—1綱外壁??(心外瞋)??一左心室內(nèi)壁??左心室I—m?(心內(nèi)膜)???左心室外壁??Vi?(心外膜)??圖1-2心室結(jié)構(gòu)??本次挑戰(zhàn),共提供了三組數(shù)據(jù)集,第一組包括訓練數(shù)據(jù),其由16個患者組??的DICOM圖像,由要分割的圖像和右心室輪廓的參照組成。第二組包括測試數(shù)??據(jù)(即Testl組),其由16個不同的患者組成,其中省略了參考輪廓。第三組包??4??
AlexNet神經(jīng)網(wǎng)絡架構(gòu),因為在比賽中取得了突出成績,現(xiàn)在己經(jīng)成為卷積??神經(jīng)網(wǎng)絡(Convolutional?Neural?Networks,CNN)在圖像分類上的經(jīng)典模型。??AlexNet網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)如圖2-1所示,為8層深度網(wǎng)絡,5層為卷積層,另外還有3層??為全連接層。??值得注意的是,AlexKrizhevsky教授指出,如果去掉任何一個卷積層,都會??使整個網(wǎng)絡的分類性能大幅下降。其原理是通過圖像輸入后對其進行層層轉(zhuǎn)換,??8??
【參考文獻】
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1 陳先昌;基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的深度學習算法與應用研究[D];浙江工商大學;2014年
本文編號:2871911
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