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無乳鏈球菌的耐藥性及耐藥機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-27 23:09
【摘要】:無乳鏈球菌(Streptococcus agalactiae)又名 B 群鏈球菌(Group B Streptococcus,GBS),是一種寄生于人類下消化道及泌尿生殖道的條件致病菌。在宿主免疫力下降、泌尿生殖道微生態(tài)失衡、無乳鏈球菌定植部位改變等情況下,可以導(dǎo)致無乳鏈球菌的感染。無乳鏈球菌感染給人類健康尤其是孕產(chǎn)婦及新生兒健康造成極大的危害,美國疾病預(yù)防與控制中心(CDC)發(fā)布的指南建議對(duì)所有的妊娠35-37周的孕婦進(jìn)行陰道和直腸無乳鏈球菌定植的產(chǎn)前篩查,并對(duì)確定攜帶有無乳鏈球菌的婦女或存在危險(xiǎn)因素的婦女進(jìn)行產(chǎn)時(shí)抗生素預(yù)防。隨著抗生素的使用,細(xì)菌的耐藥情況不容忽視。本課題的目的是研究無乳鏈球菌的耐藥性及耐藥機(jī)制,以期為臨床防治無乳鏈球菌感染用藥提供依據(jù)。本課題共分為以下兩個(gè)部分:一、無乳鏈球菌的耐藥性研究本研究為回顧性分析,收集了南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院2008年至2018年臨床分離出的共計(jì)620株(已剔除同一患者分離出的相同菌株)無乳鏈球菌的藥物敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果及菌株信息。菌株自住院部或門診就診者陰道分泌物、血液、尿液或者腦脊液等臨床標(biāo)本中分離后,經(jīng)鑒定并行藥物敏感性試驗(yàn)。用WHONET進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),并分別按年份、就診者年齡、標(biāo)本來源、菌株為定植菌或感染菌將菌株進(jìn)行分組,分析無乳鏈球菌耐藥率及不同組間耐藥率的差異。用SPSS20.0作統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn),以P0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。620株菌中未分離出對(duì)青霉素G、氨芐西林、萬古霉素、利萘唑胺和喹奴普丁/達(dá)福普丁耐藥的菌株,對(duì)四環(huán)素、紅霉素、克林霉素及左氧氟沙星的耐藥率分別為86.8%、57.4%、38.6%、25.3%。青霉素仍可作為本院防治無乳鏈球菌的首選藥物。紅霉素及克林霉素作為防治無乳鏈球菌感染的二線用藥,臨床應(yīng)對(duì)其應(yīng)用價(jià)值重新評(píng)估。2008-2018年間,無乳鏈球菌對(duì)紅霉素、克林霉素、四環(huán)素、左氧氟沙星的耐藥率在不同年份間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。無乳鏈球菌對(duì)紅霉素、克林霉素、四環(huán)素、左氧氟沙星的耐藥率在不同年齡患者、菌株是定植菌還是感染菌之間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。無乳鏈球菌對(duì)紅霉素、克林霉素、四環(huán)素的耐藥率在不同來源標(biāo)本之間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),生殖道分泌物、尿液較血液及腦脊液中分離出的無乳鏈球菌對(duì)左氧氟沙星的耐藥率高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。臨床防治無乳鏈球菌感染用藥時(shí)應(yīng)當(dāng)完善藥敏試驗(yàn),針對(duì)藥敏結(jié)果個(gè)體化用藥。二、無乳鏈球菌的耐藥機(jī)制研究對(duì)2012.9-2017.9南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院分離出的無乳鏈球菌中的29株進(jìn)行了全基因組測(cè)序,其中15株來自分泌物,9株源自血液,4株源于腦脊液,1株源自胎膜。通過藥物敏感性試驗(yàn)及生信分析對(duì)這29株菌的耐藥表型及耐藥基因進(jìn)行分析,研究本組無乳鏈球菌的耐藥機(jī)制。結(jié)果顯示29株菌對(duì)紅霉素及克林霉素的耐藥表型主要是cMLSB型,其次是M型和iMLSB型,同時(shí)有L型檢出。29株菌中26株對(duì)四環(huán)素耐藥,5株對(duì)左氧氟沙星耐藥。本組無乳鏈球菌對(duì)紅霉素耐藥的機(jī)制主要為erm(B)基因介導(dǎo)23SrRNA結(jié)合位點(diǎn)的甲基化和mef(A)基因介導(dǎo)的大環(huán)內(nèi)酯類外排泵。本研究中有8株菌有mef(A)基因且距其110-120bp處的下游均有msr(D)基因,7株菌有林可酰胺類耐藥基因lnu(B)且距其53bp處的上游均有Isa(E)基因,目前這方面的研究少見。無乳鏈球菌對(duì)紅霉素及克林霉素的耐藥受多個(gè)基因調(diào)控,其相互作用機(jī)制及分子特征有待深入探討。本組無乳鏈球菌對(duì)四環(huán)素耐藥主要是由tet(M)和tet(O)基因編碼核糖體保護(hù)蛋白導(dǎo)致,同時(shí)有編碼外排泵蛋白的tet(L)和編碼核糖體保護(hù)蛋白的tet(S)檢出。另外檢出一株含有嵌合基因tet(O/W/32/0)的耐四環(huán)素菌株,目前在無乳鏈球菌中尚未見報(bào)道。對(duì)左氧氟沙星耐藥的5株菌均未檢出氟喹諾酮類耐藥基因,推測(cè)對(duì)喹諾酮類的耐藥由喹諾酮耐藥性決定區(qū)(quinolone resistance determining regions,QRDRs)GyrA亞基(由gyrA編碼)和(或)ParC亞基(由parC編碼)發(fā)生氨基酸突變引起,或者存在其他的耐藥機(jī)制,這有待下一步驗(yàn)證。
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R446.5
【圖文】:

無乳鏈球菌,耐藥率


探宄不同類型標(biāo)本中分離出的無乳鏈球菌的耐藥率差異。因分離自腦逡逑脊液中的菌株數(shù)較少,考慮到腦脊液與血液同為無菌體液,故與血液一同歸類逡逑分析。不同類型標(biāo)本中分離出的無乳鏈球菌的耐藥率見表1-6及圖1-2。結(jié)果顯逡逑示不同標(biāo)本之間,無乳鏈球菌對(duì)紅霉素、克林霉素、四環(huán)素的耐藥率差異無統(tǒng)逡逑計(jì)學(xué)意義(P>0.05),對(duì)左氧氟沙星的耐藥率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。逡逑進(jìn)一步兩兩比較不同標(biāo)本分離出的無乳鏈球菌對(duì)左氧氟沙星的耐藥率,結(jié)果顯逡逑示生殖道分泌物與尿液中無乳鏈球菌對(duì)左氧氟沙星的耐藥率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義逡逑(X2=0.165,P=0.685),生殖道分泌物與血液及腦脊液中無乳鏈球菌對(duì)左氧氟沙逡逑星的耐藥率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(X2=8.383,邋P=0.004),尿液與血液及腦脊液標(biāo)本逡逑中無乳鏈球菌對(duì)左氧氟沙星的耐藥率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(X2=9.644,邋P=0.002)。逡逑13逡逑

無乳鏈球菌,耐藥率


定植與人體中不引起任何癥狀,又可致機(jī)體感染。將本實(shí)驗(yàn)菌株分為定植菌與逡逑感染菌并比較其耐藥性差別,分析耐藥性在菌株是定植菌還是感染菌之間有無逡逑差異。無乳鏈球菌定植菌與感染菌的耐藥率見表1-8及圖1-4。結(jié)果表明,無乳逡逑鏈球菌為定植菌或感染菌兩種情況下,其對(duì)紅霉素、克林霉素、四環(huán)素和左氧逡逑氟沙星的耐藥率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均有P>0.05)。逡逑表1-8無乳鏈球菌為定植菌或感染菌的耐藥率(%)逡逑Table邋1-8邋Antimicrobial邋resistance邋rates邋of邋colonized邋or邋infected邋Streptococcus邋agalactiae邋(%)逡逑抗菌藥物邐定植菌邐感染菌邐七邐戶值逡逑紅霉素邐68.4邋(13/19)邐56.4邋(115/204)邐1.032邐0.310逡逑克林霉素邐36.1邋(39/108)邐39.3邋(158/402)邐0.366邐0.545逡逑四環(huán)素邐86.9邋(93/107)邐86.8(329/379)邐0.001邐0.977逡逑左氧氟沙星邐27.1(36/133)邐24.8(

分布圖,測(cè)序,產(chǎn)量統(tǒng)計(jì),質(zhì)控


1)質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)逡逑菌株A766的質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)見表2-6。逡逑表2-6邋A766質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)逡逑Table邋2-6邋Quality邋control邋data邋production邋statistics邋of邋A766逡逑ple—name邐total_reads邐totalbase(bp)邐Q20_base邐Q20(%)逡逑66.fq邐15035644邐2071514770邐1751569995邐0.84555逡逑2)測(cè)序堿基的含量分布逡逑根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,G/C、A/T含量應(yīng)該分別相等,并在整個(gè)測(cè)序基本保持穩(wěn)定,呈水平線。菌株A766的測(cè)序堿基含量分布見圖2-1。從堿量分布圖來看,在Reads的頭端和末端出現(xiàn)GC和AT含量不相等的情況,逡逑間部分G/C、A/T含量基本接近。頭端不相等可能是由于隨機(jī)打斷時(shí)接頭錯(cuò)誤匹配,末端不相等可能是由于測(cè)序長度越長,堿基錯(cuò)誤率越高的原因致。逡逑Sequence邋content邋across邋all邋bases逡逑

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