cgMLST在甲氧西林耐藥金黃色葡萄球菌克隆變遷中的應(yīng)用研究
發(fā)布時間:2020-06-18 07:09
【摘要】:目的:甲氧西林耐藥金黃色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)是引起醫(yī)院感染的重要多重耐藥菌之一,能夠引起手術(shù)部位感染及其他嚴(yán)重侵襲性感染。在過去幾十年,社區(qū)獲得性MRSA(community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus,CA-MRSA)迅速傳播,有報道 CA-MRSA克隆可進(jìn)入院內(nèi)造成傳播。本研究采用核心基因組多位點序列分型(core-genome multilocus sequence typing,cgMLST)技術(shù)分析教學(xué)醫(yī)院內(nèi)MRSA的流行病學(xué)變化。方法:分離2013年1月至2015年12月期間浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院不同標(biāo)本類型的MRSA,采用瓊脂稀釋法和雙盤擴(kuò)散試驗法測定所分離的菌株對常見抗MRSA藥物的體外敏感性,用PCR擴(kuò)增pvl毒力基因,并用Illumina高通量測序平臺對所分離菌株進(jìn)行全基因組測序,利用CLC Genomics Workbench和Ridom生物信息學(xué)軟件對基因組序列進(jìn)行多位點序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、spa分型和cgMLST分析。結(jié)果:本研究共收集292株MRSA,MLST結(jié)果顯示最主要的ST型是ST5(150株)和ST59(68株),分別占比51.4%和23.3%。其中ST5的比例從2013年的68.3%下降到2015年的32.1%,ST59的比例從2013年的8.9%上升到2015年的41.0%。cgMLST分析結(jié)果顯示,無論是社區(qū)發(fā)作還是醫(yī)院發(fā)作菌株,ST59都比ST5表現(xiàn)出更廣泛的基因多樣性。最小生成樹顯示ST5菌株的親緣關(guān)系表現(xiàn)的相對密切,而ST59菌株之間大多為無關(guān)。在93例皮膚軟組織感染病例中ST59型MRSA菌株占45.2%,其左氧氟沙星的耐藥率僅(11.8%),而幾乎所有的ST5和ST239型菌株都對喹諾酮類耐藥。小鼠皮膚感染模型和溶血試驗結(jié)果顯示醫(yī)院發(fā)作的ST59型MRSA菌株具有較強(qiáng)的毒性,提示這些菌株與典型的CA-MRSA菌株具有相似的毒力水平。結(jié)論:具有高毒性潛力的ST59型MRSA菌株正逐漸取代ST5型MRSA菌株在醫(yī)院的優(yōu)勢地位,cgMLST在醫(yī)院里可作為監(jiān)測MRSA菌株流行病學(xué)變化的有力工具。
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R446.5
【圖文】:
CA-MRSA進(jìn)行了比較。在小鼠皮膚感染模型中,由ST59型HO-MRSA菌株引起的逡逑小鼠皮膚膿腫大小明顯比ST5和ST239型HO-MRSA大,但是與經(jīng)典CA-MRSA克隆逡逑菌株LAC及SA268形成的膿腫大小相似(圖4A)。逡逑人紅細(xì)胞溶血試驗是另一種評價金黃色葡萄球菌毒力的重要參數(shù)。在溶血實驗逡逑中,ST59型HO-MRSA菌株培養(yǎng)液濾液裂解紅細(xì)胞的能力高于ST5邋(夕=0.03)和逡逑ST239型(/K0.001)邋HO-MRSA,與CA-MRSA菌株SA268邋(產(chǎn)0.08)和USA300菌逡逑株LAC邋(p0.47)裂解紅細(xì)胞能力相似。這結(jié)果與小鼠皮膚感染模型一致。但是,逡逑我們也發(fā)現(xiàn)ST59型HO-MRSA菌株之間的溶血能力相差較大(圖4B)。逡逑32逡逑
本文編號:2718887
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R446.5
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CA-MRSA進(jìn)行了比較。在小鼠皮膚感染模型中,由ST59型HO-MRSA菌株引起的逡逑小鼠皮膚膿腫大小明顯比ST5和ST239型HO-MRSA大,但是與經(jīng)典CA-MRSA克隆逡逑菌株LAC及SA268形成的膿腫大小相似(圖4A)。逡逑人紅細(xì)胞溶血試驗是另一種評價金黃色葡萄球菌毒力的重要參數(shù)。在溶血實驗逡逑中,ST59型HO-MRSA菌株培養(yǎng)液濾液裂解紅細(xì)胞的能力高于ST5邋(夕=0.03)和逡逑ST239型(/K0.001)邋HO-MRSA,與CA-MRSA菌株SA268邋(產(chǎn)0.08)和USA300菌逡逑株LAC邋(p0.47)裂解紅細(xì)胞能力相似。這結(jié)果與小鼠皮膚感染模型一致。但是,逡逑我們也發(fā)現(xiàn)ST59型HO-MRSA菌株之間的溶血能力相差較大(圖4B)。逡逑32逡逑
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1 王海萍;cgMLST在甲氧西林耐藥金黃色葡萄球菌克隆變遷中的應(yīng)用研究[D];浙江大學(xué);2019年
本文編號:2718887
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