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CT放射組學(xué)特征預(yù)測(cè)周圍型肺腺癌EGFR基因突變研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-09 12:26
【摘要】:目的:應(yīng)用周圍型肺腺癌患者臨床、CT放射組學(xué)特征預(yù)測(cè)表皮生長因子受體(EGFR)的突變狀態(tài)。方法:本研究回顧性分析2016-2018年于吉林大學(xué)白求恩第一醫(yī)院進(jìn)行手術(shù)治療,術(shù)后病理證實(shí)為原發(fā)性周圍型肺腺癌,并對(duì)大體病理標(biāo)本進(jìn)行EGFR突變檢測(cè)的104例患者。用放射組學(xué)方法評(píng)估其術(shù)前胸部CT,提取了能夠反映腫瘤異質(zhì)性和表型的特征,再用最小絕對(duì)收縮和選擇算法(LASSO)降維得到更有辨別價(jià)值的組學(xué)特征,分別應(yīng)用放射組學(xué)特征、放射組學(xué)聯(lián)合臨床特征建立兩種LR模型預(yù)測(cè)EGFR突變狀態(tài),應(yīng)用五折交叉認(rèn)證、ROC曲線及曲線線下面積(AUC)評(píng)估兩種模型效能,從而得到預(yù)測(cè)EGFR突變的最優(yōu)模型。結(jié)果:共提取1025個(gè)三維組學(xué)特征,通過降維得到13個(gè)放射組學(xué)特征最具有預(yù)測(cè)價(jià)值,并建立放射組學(xué)標(biāo)簽。放射組學(xué)聯(lián)合臨床特征模型由放射組學(xué)標(biāo)簽、患者性別、吸煙史、是否有脈管浸潤和組織病理學(xué)亞型組成,其訓(xùn)練組AUC為0.88±0.03(均值±標(biāo)準(zhǔn)差),驗(yàn)證組AUC為0.88±0.12,測(cè)試組AUC為0.913,優(yōu)于單純使用放射組學(xué)的預(yù)測(cè)模型(訓(xùn)練組AUC=0.92±0.01,驗(yàn)證組AUC=0.84±0.04,測(cè)試組AUC=0.837)。結(jié)論:由放射組學(xué)標(biāo)簽、患者性別、吸煙史、是否有脈管浸潤和組織病理學(xué)亞型組成的放射組學(xué)聯(lián)合臨床特征模型并通過諾模圖表示,能有效預(yù)存周圍型肺腺癌患者EGFR基因突變情況,與單純放射組學(xué)特征模型相比,具有更佳的預(yù)測(cè)效能。
【圖文】:

CT圖像,腫瘤,差矩陣,認(rèn)知特征


7圖1 采用手工勾畫對(duì)周圍型肺腺癌進(jìn)行腫瘤分割的具有代表性的CT圖像(a)將ROI邊界分割成黃色輪廓 (b)分割提取出的ROI3.2.3 特征提取從每個(gè)多層 ROI 病灶中總共提取了 1025 個(gè)特征,這些特征被分為四組:①臨床認(rèn)知特征(CCF),②圖像強(qiáng)度特征(IIF),③紋理特征(TF),④小波特征(WF)。第一組的主要目的是描述腫瘤的三維特征形態(tài),如體積、質(zhì)量、有效直徑、表面積、球度等。第二組描述腫瘤區(qū)域的灰度共生矩陣、灰度游程矩陣、附近灰色調(diào)差矩陣等等。第三組顯示腫瘤內(nèi)部結(jié)構(gòu)的同質(zhì)性或異質(zhì)性。最后一組通過對(duì) CT 原始圖像進(jìn)行分解,將紋理和強(qiáng)度有效地轉(zhuǎn)化為高低頻率,本研究對(duì)每幅 CT 圖像進(jìn)行三維小波變換,,將 CT 圖像按照 x、y、z 三個(gè)濾波方向進(jìn)行分解。特征提取算法在 Python3.6.1 平臺(tái)進(jìn)行處理。3.2.4 特征選擇大量的放射學(xué)特征對(duì)腫瘤的定量研究具有重要意義。然而

曲線,參數(shù),特征系數(shù),懲罰項(xiàng)


通過 LASSO 回歸模型(圖 2),原始的 1025 維放射組學(xué)特征被篩選出 13個(gè)系數(shù)非零的放射組學(xué)特征(表 2)。圖2 (a)LASSO模型的調(diào)優(yōu)參數(shù)(b)LASSO模型十折交叉驗(yàn)證方法篩選特征的特征系數(shù)收斂圖注:圖(a)中,α值為懲罰項(xiàng)系數(shù),縱坐標(biāo)為均方誤差,選擇采用十折交叉驗(yàn)證最小準(zhǔn)則得到最小均方誤差值,在最優(yōu)處繪制垂直虛線,得到對(duì)應(yīng)的-log(α),α最終取值為0.0371。圖(b)中每條曲線代表1025維特征中某一個(gè)特征的特征系數(shù)隨著α值變化的情況,豎虛線表示最佳α取值對(duì)應(yīng)的-log(α)值得到13項(xiàng)特征系數(shù)非零的特征。a)b)
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R734.2;R730.44

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本文編號(hào):2656138

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