應(yīng)用高通量測(cè)序分析健康中國(guó)人群的皮膚微生物
發(fā)布時(shí)間:2020-04-01 09:40
【摘要】:研究背景皮膚暴露于外界環(huán)境中,形成機(jī)體抵御物理、生物化學(xué)等外來侵襲的第一道防線,同時(shí)其表面居住著各種各樣的微生物,包括細(xì)菌、真菌、病毒、螨蟲,形成一個(gè)復(fù)雜而充滿活力的生態(tài)系統(tǒng)。皮膚微生物群參與并調(diào)節(jié)皮膚先天性免疫和適應(yīng)性免疫,在皮膚健康和疾病發(fā)生發(fā)展中具有重要作用。研究目的通過高通量測(cè)序表征健康中國(guó)人群皮膚表面的細(xì)菌和真菌群落,了解其與部位、年齡、性別的關(guān)系。研究方法將50名健康受試者劃分為五個(gè)年齡層,即兒童(4~6歲)、青少年(11~13歲)、年輕人(25~34歲)、中年人(37~53歲)和老年人(62~74歲)。運(yùn)用拭子法采集其面頰、后背和掌前臂的皮膚樣品,對(duì)皮膚拭子進(jìn)行微生物基因組DNA提取—目的片段PCR擴(kuò)增(細(xì)菌目的片段為16Sr DNA的V3-V4區(qū),真菌目的片段為ITS2區(qū))—PCR產(chǎn)物純化—文庫(kù)構(gòu)建—上機(jī)測(cè)序—質(zhì)量過濾—生物信息分析。研究結(jié)果共產(chǎn)生9,574,365條高質(zhì)量的16S r DNA V3-V4區(qū)序列和10,382,475條高質(zhì)量的ITS2區(qū)序列,物種注釋為兩個(gè)古生菌門,即Thaumarchaeota(奇古菌門)和Euryarchaeota(廣古菌門),四個(gè)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門,即Actinobacteria(放線菌門)、Proteobacteria(變形菌門)、Firmicutes(厚壁菌門)和Bacteroidetes(擬桿菌門),兩個(gè)優(yōu)勢(shì)真菌門,即Ascomycota(子囊菌門)和Basidiomycota(擔(dān)子菌門)。后背以Propionibacterium(丙酸桿菌屬)、Staphylococcus(葡萄球菌屬)、Basidiomycota(擔(dān)子菌門)、Malassezia(馬拉色菌屬)、Malassezia globosa(球形馬拉色菌)為主,面頰和掌前臂有相似的細(xì)菌和真菌群落組成,但掌前臂有更高的細(xì)菌和真菌物種多樣性,以Alphaproteobacteria(α-變形桿菌綱)為主,而面頰以Betaproteobacteria(β-變形桿菌綱)為主。老年人有更高的細(xì)菌物種豐富度和多樣性,兒童有更高的真菌物種豐富度和多樣性,宜于絲狀真菌Cladosporium(枝孢菌)、Aspergillus(曲霉屬)、Alternaria(鏈格孢屬)、Penicillium(青霉屬)和非馬拉色酵母真菌Debaryomyces(德巴利酵母屬)、Saccharomycopsis(覆膜孢酵母屬)、Candida(假絲酵母屬)的定殖,而不宜于親脂性的Propionibacterium(丙酸桿菌屬)、Malassezia(馬拉色菌屬)生長(zhǎng)。丙酸桿菌屬、馬拉色菌屬受皮脂水平影響,其豐度在青春期急劇增加,青壯年達(dá)到高峰,此后隨年齡增長(zhǎng)豐度逐漸降低。男性比女性有更高的細(xì)菌物種豐富度,女性有更豐富的Ascomycota(子囊菌門),男性有更豐富的Malassezia restricta(限制性馬拉色菌)。此外皮膚表面高比例的氣運(yùn)真菌表明皮膚除了是常駐菌生長(zhǎng)的棲息地,也作為沉積表面被動(dòng)地從環(huán)境或衣物中收集更多的暫駐菌。研究結(jié)論鑒定了健康中國(guó)人皮膚表面的細(xì)菌和真菌群落,其群落組成和豐度受皮膚部位、年齡和性別影響,為皮膚疾病或屏障結(jié)構(gòu)受損下的微生物群落鑒定以及正常微生物群的功能學(xué)研究奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R446.5
本文編號(hào):2610284
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R446.5
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前2條
1 田燕;劉瑋;;皮膚屏障[J];實(shí)用皮膚病學(xué)雜志;2013年06期
2 劉瑋;;皮膚屏障功能解析[J];中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志;2008年12期
,本文編號(hào):2610284
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