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腹部圖像分割與增強(qiáng)的自步深度學(xué)習(xí)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-03-23 09:45
【摘要】:醫(yī)學(xué)影像分析是疾病診斷和治療中最基本、最重要的步驟,隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的不斷更新發(fā)展,使用圖像處理和機(jī)器學(xué)習(xí)的方法進(jìn)行醫(yī)學(xué)影像分析成為新的發(fā)展方向。醫(yī)學(xué)圖像數(shù)據(jù)量小,人體間差異性大,對(duì)使用傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法和深度學(xué)習(xí)方法進(jìn)行醫(yī)學(xué)影像分析提出了更高的要求。胰腺癌作為惡性程度最高的癌癥之一,精準(zhǔn)地分割病人的胰腺圖像有助于醫(yī)生的診斷和治療,本文針對(duì)小樣本的胰腺數(shù)據(jù)分別使用傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)以及目前熱門的深度學(xué)習(xí)進(jìn)行圖像分割,提出了適用于不同模態(tài)的胰腺圖像分割方法。此外,隨著對(duì)醫(yī)療設(shè)備輻射方面的關(guān)注度越來(lái)越高,低輻射的醫(yī)學(xué)影像將廣泛使用,針對(duì)低輻射醫(yī)學(xué)影像成像質(zhì)量差,本文采用深度學(xué)習(xí)方法探討降質(zhì)醫(yī)學(xué)影像的圖像增強(qiáng),提出了適用于降質(zhì)醫(yī)學(xué)影像增強(qiáng)的深度學(xué)習(xí)方法,為進(jìn)一步的醫(yī)學(xué)影像分析,如分割、配準(zhǔn)等提供幫助。本文主要完成了以下三個(gè)工作:1.針對(duì)三維磁共振胰腺圖像中胰腺體積小且與周圍組織粘連嚴(yán)重難以準(zhǔn)確分割問(wèn)題,提出了基于水平集和自步支持向量機(jī)結(jié)合的序貫分割模型。首先,通過(guò)人機(jī)交互勾畫第一張磁共振胰腺序列圖像中胰腺的大致輪廓,利用水平集方法自動(dòng)演化出序列的粗分割結(jié)果。然后,利用訓(xùn)練好的自步支持向量機(jī)對(duì)粗分割結(jié)果進(jìn)一步分割。最后,利用形態(tài)學(xué)方法進(jìn)行后處理得到最終結(jié)果。針對(duì)自步支持向量機(jī),使用自步學(xué)習(xí)的思想改進(jìn)支持向量機(jī),在訓(xùn)練過(guò)程中先學(xué)習(xí)簡(jiǎn)單樣本然后逐漸加入復(fù)雜樣本,我們?nèi)诤匣叶裙采仃囂卣、灰度梯度共生矩陣特征和三維灰度梯度共生矩陣特征構(gòu)造了自步支持向量機(jī)的輸入。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該分割方法提高了胰腺分割精度,達(dá)到一定的去粘連效果。2.針對(duì)PET/MRI中磁共振二維成像導(dǎo)致胰腺圖像質(zhì)量差,對(duì)比度低,難以分割問(wèn)題,提出了基于遷移學(xué)習(xí)和多尺度卷積的分割模型。首先,使用PET數(shù)據(jù)構(gòu)造了編碼器-解碼器結(jié)構(gòu)的U-Net分割網(wǎng)絡(luò)。然后基于MRI數(shù)據(jù)構(gòu)造了雙編碼器-單解碼器結(jié)構(gòu)的U-Net分割網(wǎng)絡(luò),對(duì)于其中一個(gè)編碼器,由PET分割模型中編碼器遷移得到,使得模型可以關(guān)注感興趣區(qū)域進(jìn)行特征提取;對(duì)于另一個(gè)解碼器,構(gòu)造了多尺度卷積模塊提升模型的特征表達(dá)能力;在解碼器部分采用插值上采樣和反卷積融合的方式進(jìn)行特征映射輸出MRI分割結(jié)果。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,基于遷移學(xué)習(xí)的思想可以更好地定位胰腺,多尺度卷積以及融合的上采樣方式提高了分割精度。3.針對(duì)降質(zhì)醫(yī)學(xué)圖像兆伏CT噪聲大、分辨率低等問(wèn)題,提出了基于重建損失約束的生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)提升圖像質(zhì)量。本方法利用生成對(duì)抗方式學(xué)習(xí)低質(zhì)量的兆伏CT和高質(zhì)量的千伏CT之間的映射關(guān)系提高兆伏CT圖像質(zhì)量。通過(guò)構(gòu)造兆伏CT和千伏CT雙輸入的生成器,使用cycle consistency loss解決了數(shù)據(jù)非配對(duì)問(wèn)題,在生成器重構(gòu)部分引入重建損失提高了圖像生成質(zhì)量,并引入梯度項(xiàng)對(duì)生成圖像輪廓進(jìn)行約束。在真實(shí)的臨床兆伏CT數(shù)據(jù)上表明,我們的方法在視覺(jué)效果和指標(biāo)上都表現(xiàn)優(yōu)異。
【圖文】:

圖層,病人,胰腺,圖像


(a) (b)(c) (d)圖3.2 某一病人連續(xù)四個(gè)圖層圖像3.3.3 算法流程(1)算法訓(xùn)練流程自步支持向量機(jī)用于三維磁共振胰腺圖像分割訓(xùn)練流程如圖 3.3 所示:訓(xùn)練圖像灰度共生矩陣二維灰度梯度共生矩陣特征三維灰度梯度共生矩陣特征訓(xùn)練自步支持向量機(jī)模型構(gòu)造特征向量提取特征圖3.3 自步支持向量機(jī)訓(xùn)練流程自步支持向量機(jī)詳細(xì)訓(xùn)練流程如下:(I)訓(xùn)練樣本選取自步支持向量機(jī)主要關(guān)注胰腺邊緣黏連部分,選取胰腺邊緣部分作為訓(xùn)練集可以使模型學(xué)習(xí)胰腺邊緣區(qū)域的特征,進(jìn)一步提高胰腺分割進(jìn)度,,所以本章舍棄將整個(gè)圖像序列中所有胰腺圖像構(gòu)造訓(xùn)練樣本的傳統(tǒng)做法,選取胰腺與周圍器官連接部分構(gòu)造

示意圖,訓(xùn)練樣本,示意圖,灰度梯度共生矩陣


其中紅色標(biāo)注部分即為本章選取的訓(xùn)練樣本。(a) (b)圖3.4 訓(xùn)練樣本選取示意圖(II)特征提取對(duì)每一個(gè)像素點(diǎn),按照 6 維灰度共生矩陣特征,15 維二維灰度梯度共生矩陣特征,15 維三維灰度梯度共生矩陣特征,該像素點(diǎn)為中心的5 5塊內(nèi)像素點(diǎn)灰度值的順序構(gòu)造 61 維特征用來(lái)描述每一個(gè)像素點(diǎn),其權(quán)重皆為 1,輸入到自步 SVM 中進(jìn)行訓(xùn)練。(III)訓(xùn)練 SVM構(gòu)造訓(xùn)練樣本集,并按照 3.3.1 小節(jié)中的步驟求解自步支持向量機(jī)模型的參數(shù)
【學(xué)位授予單位】:西安電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R445;TP391.41;TP18

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