本文關(guān)鍵詞：基于深度學(xué)習(xí)的抗HIV活性QSAR預(yù)測(cè)　出處：《計(jì)算機(jī)工程與設(shè)計(jì)》2017年01期 　論文類(lèi)型：期刊論文

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【摘要】：為提高抗HIV活性預(yù)測(cè)的精度,采用深度學(xué)習(xí)算法,提出一種基于深度信念網(wǎng)絡(luò)的抗HIV活性預(yù)測(cè)方法。利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)任意精度逼近非線(xiàn)性函數(shù)的優(yōu)點(diǎn),結(jié)合多個(gè)受限玻爾茲曼機(jī)(restricted Boltzmann machine,RBM)進(jìn)行非監(jiān)督逐層貪婪模式訓(xùn)練學(xué)習(xí),建立深度信念網(wǎng)絡(luò)算法模型(deep belief network,DBN)。將抗HIV活性的高溫超導(dǎo)源數(shù)據(jù)(HTS raw data)、高溫超導(dǎo)抑制劑(HTS%inhibition(20μM))、最大測(cè)定信號(hào)釋放比率(mean max signal)等特征作為DBN模型的輸入,抗HIV平均活性值作為該模型的輸出,設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)對(duì)模型進(jìn)行訓(xùn)練及驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,DBN模型對(duì)抗HIV活性的預(yù)測(cè)均方根誤差小,預(yù)測(cè)精度高,平均預(yù)測(cè)精度為93.82%,適用于抗HIV活性評(píng)估。
[Abstract]:In order to improve the accuracy of anti-#en0# activity prediction, the depth learning algorithm is used. In this paper, a prediction method of anti HIV activity based on deep belief network is proposed, which utilizes the advantage of BP neural network to approximate the nonlinear function with arbitrary precision. Combined with multiple restricted Boltzmann machines (RBMs), unsupervised greedy training is carried out. An algorithm model of deep belief network is established. The HTS raw data of anti HIV activity are analyzed. High temperature superconducting inhibitor (HTS inhibition 20 渭 m). The maximum signal release ratio (mean max signal) was used as the input of the DBN model, and the average activity value of anti-#en2# was taken as the output of the model. Experiments were designed to train and verify the model. The experimental results show that the root-mean-square error (RMS) of DDBN model against HIV activity is small, and the prediction accuracy is high, with an average prediction accuracy of 93.82%. It is suitable for the evaluation of anti-HIV activity.
【作者單位】： 新疆大學(xué)軟件學(xué)院;新疆大學(xué)網(wǎng)絡(luò)中心;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31160341) 新疆研究生科研創(chuàng)新基金項(xiàng)目(XJGRI2015034)
【分類(lèi)號(hào)】：TP18
【正文快照】： 0引言對(duì)抗HIV(human immunodeficiency virus,HIV)活性定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure activity relation-ship,QSAR)進(jìn)行活性預(yù)測(cè),可以提高抗艾滋病藥物發(fā)現(xiàn)的效率并降低研發(fā)成本,對(duì)促進(jìn)艾滋病藥物的設(shè)計(jì)有重要的意義�？笻IV活性與結(jié)構(gòu)關(guān)系是一種復(fù)雜的多元、非線(xiàn)性關(guān)

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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