計算機代數(shù)在生物化學中的應用
發(fā)布時間:2017-10-09 05:18
本文關鍵詞:計算機代數(shù)在生物化學中的應用
更多相關文章: 計算機代數(shù) Gr(o|¨ )bner基 吳消元法 生物化學 酶動力學
【摘要】:計算機代數(shù)理論是計算機技術和數(shù)學相結(jié)合的一門新興學科。計算機代數(shù)理論涉及了所有的數(shù)學領域。由于計算機代數(shù)可以完成需要大量人力才能完成的運算,計算機代數(shù)理論已被應用于絕大多數(shù)科學研究和工程領域;谟嬎銠C代數(shù)理論,本文對生物化學逆向工程中的離散模型和酶動力學模型進行了詳細的研究,主要結(jié)果如下:1、基于計算機代數(shù)中的Grobner基理論,在生物信息學逆向工程中通過構(gòu)建插值多項式來建立離散模型。該方法基于BM算法中加入中國剩余定理得到的BMM算法,使得模型可以應用于有理數(shù)域并且避免中間表達式膨脹。2、基于計算機代數(shù)中的吳消元法和動力系統(tǒng)定性理論對酶動力學系統(tǒng)進行了研究。本文先后研究了最簡單的酶動力學系統(tǒng),不穩(wěn)定的酶動力學系統(tǒng)和另一類不穩(wěn)定的酶動力學系統(tǒng),均得到了系統(tǒng)的解析解,并且通過具體實驗驗證了本文所提出理論的正確性和算法的有效性。
【關鍵詞】:計算機代數(shù) Gr(o|¨ )bner基 吳消元法 生物化學 酶動力學
【學位授予單位】:北京化工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:O15
【目錄】:
- 摘要5-6
- ABSTRACT6-12
- 第一章 緒論12-22
- 1.1 符號計算12-14
- 1.1.1 Grobner基13-14
- 1.1.2 數(shù)學機械化和吳消元法14
- 1.2 生物化學14-15
- 1.3 酶動力學15-22
- 1.3.1 一般原理15-16
- 1.3.2 酶的測定16-17
- 1.3.3 單底物反應17-21
- 1.3.3.1 米氏動力學17-19
- 1.3.3.2 米氏方程的推導過程19-20
- 1.3.3.3 動力學常數(shù)的現(xiàn)實意義20-21
- 1.3.4 化學機制21-22
- 第二章 預備知識22-31
- 2.1 抽象代數(shù)基本知識22-25
- 2.2 多項式的約化25-26
- 2.3 Grobner基算法26-28
- 2.4 吳消元法28-31
- 第三章 基于計算機代數(shù)的逆向工程離散模型研究31-39
- 3.1 Buchberger-Moller算法的模算法31-33
- 3.2 算法的準確性驗證33-34
- 3.3 時間序列的多項式模型34-39
- 第四章 最簡單的酶促系統(tǒng)動力學研究39-47
- 4.1 最簡單的酶動力學模型分析39-42
- 4.2 總結(jié)42-47
- 第五章 最簡單的不穩(wěn)定酶動力學分析47-55
- 5.1 方法47-52
- 5.2 結(jié)果和討論52-55
- 第六章 一般的不穩(wěn)定酶動力學分析55-63
- 6.1 方法55-60
- 6.2 結(jié)論60-63
- 第七章 結(jié)論63-65
- 參考文獻65-69
- 附錄69-80
- 致謝80-82
- 研究成果及發(fā)表的學術論文82-84
- 作者和導師簡介84-85
- 碩士研究生學位論文答辯委員會決議書85-86
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 吳文俊;關于代數(shù)方程組的零點——Ritt原理的一個應用[J];科學通報;1985年12期
,本文編號:998353
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/yysx/998353.html
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