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計算機(jī)代數(shù)在生物化學(xué)中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2017-10-09 05:18

  本文關(guān)鍵詞:計算機(jī)代數(shù)在生物化學(xué)中的應(yīng)用


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【摘要】:計算機(jī)代數(shù)理論是計算機(jī)技術(shù)和數(shù)學(xué)相結(jié)合的一門新興學(xué)科。計算機(jī)代數(shù)理論涉及了所有的數(shù)學(xué)領(lǐng)域。由于計算機(jī)代數(shù)可以完成需要大量人力才能完成的運(yùn)算,計算機(jī)代數(shù)理論已被應(yīng)用于絕大多數(shù)科學(xué)研究和工程領(lǐng)域;谟嬎銠C(jī)代數(shù)理論,本文對生物化學(xué)逆向工程中的離散模型和酶動力學(xué)模型進(jìn)行了詳細(xì)的研究,主要結(jié)果如下:1、基于計算機(jī)代數(shù)中的Grobner基理論,在生物信息學(xué)逆向工程中通過構(gòu)建插值多項(xiàng)式來建立離散模型。該方法基于BM算法中加入中國剩余定理得到的BMM算法,使得模型可以應(yīng)用于有理數(shù)域并且避免中間表達(dá)式膨脹。2、基于計算機(jī)代數(shù)中的吳消元法和動力系統(tǒng)定性理論對酶動力學(xué)系統(tǒng)進(jìn)行了研究。本文先后研究了最簡單的酶動力學(xué)系統(tǒng),不穩(wěn)定的酶動力學(xué)系統(tǒng)和另一類不穩(wěn)定的酶動力學(xué)系統(tǒng),均得到了系統(tǒng)的解析解,并且通過具體實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了本文所提出理論的正確性和算法的有效性。
【關(guān)鍵詞】:計算機(jī)代數(shù) Gr(o|¨ )bner基 吳消元法 生物化學(xué) 酶動力學(xué)
【學(xué)位授予單位】:北京化工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:O15
【目錄】:
  • 摘要5-6
  • ABSTRACT6-12
  • 第一章 緒論12-22
  • 1.1 符號計算12-14
  • 1.1.1 Grobner基13-14
  • 1.1.2 數(shù)學(xué)機(jī)械化和吳消元法14
  • 1.2 生物化學(xué)14-15
  • 1.3 酶動力學(xué)15-22
  • 1.3.1 一般原理15-16
  • 1.3.2 酶的測定16-17
  • 1.3.3 單底物反應(yīng)17-21
  • 1.3.3.1 米氏動力學(xué)17-19
  • 1.3.3.2 米氏方程的推導(dǎo)過程19-20
  • 1.3.3.3 動力學(xué)常數(shù)的現(xiàn)實(shí)意義20-21
  • 1.3.4 化學(xué)機(jī)制21-22
  • 第二章 預(yù)備知識22-31
  • 2.1 抽象代數(shù)基本知識22-25
  • 2.2 多項(xiàng)式的約化25-26
  • 2.3 Grobner基算法26-28
  • 2.4 吳消元法28-31
  • 第三章 基于計算機(jī)代數(shù)的逆向工程離散模型研究31-39
  • 3.1 Buchberger-Moller算法的模算法31-33
  • 3.2 算法的準(zhǔn)確性驗(yàn)證33-34
  • 3.3 時間序列的多項(xiàng)式模型34-39
  • 第四章 最簡單的酶促系統(tǒng)動力學(xué)研究39-47
  • 4.1 最簡單的酶動力學(xué)模型分析39-42
  • 4.2 總結(jié)42-47
  • 第五章 最簡單的不穩(wěn)定酶動力學(xué)分析47-55
  • 5.1 方法47-52
  • 5.2 結(jié)果和討論52-55
  • 第六章 一般的不穩(wěn)定酶動力學(xué)分析55-63
  • 6.1 方法55-60
  • 6.2 結(jié)論60-63
  • 第七章 結(jié)論63-65
  • 參考文獻(xiàn)65-69
  • 附錄69-80
  • 致謝80-82
  • 研究成果及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文82-84
  • 作者和導(dǎo)師簡介84-85
  • 碩士研究生學(xué)位論文答辯委員會決議書85-86

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 吳文俊;關(guān)于代數(shù)方程組的零點(diǎn)——Ritt原理的一個應(yīng)用[J];科學(xué)通報;1985年12期

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本文編號:998353

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